More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3146 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  53.2 
 
 		 1161 aa  1189    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.54 
 
 		 1128 aa  1021    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00879  two-component hybrid sensor and regulator  42 
 
 		 1100 aa  849    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1446  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  50.53 
 
 		 1131 aa  1110    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.705679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  43.52 
 
 		 1121 aa  952    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2001  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.7 
 
 		 1121 aa  952    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4239  histidine kinase  49.17 
 
 		 1211 aa  1056    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5667  histidine kinase  53.23 
 
 		 1140 aa  1151    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5513  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.57 
 
 		 1124 aa  948    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168644  normal  0.269782 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  47.58 
 
 		 1125 aa  1007    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  48.81 
 
 		 1128 aa  1015    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1586  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.77 
 
 		 1178 aa  1074    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.830805  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3573  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.78 
 
 		 1120 aa  933    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1442  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.04 
 
 		 1122 aa  1101    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0975  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.57 
 
 		 1130 aa  1078    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.537982 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1730  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.25 
 
 		 1195 aa  1061    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479441  normal  0.752594 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.45 
 
 		 1122 aa  1110    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0612415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0592  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.71 
 
 		 1113 aa  1035    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0114606 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0219  histidine kinase  62.37 
 
 		 1166 aa  1301    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.803779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3398  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  48.94 
 
 		 1202 aa  1103    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.613847  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2976  two-component hybrid sensor and regulator  47.66 
 
 		 1132 aa  1056    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.210238 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  51.94 
 
 		 1146 aa  1174    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  74.53 
 
 		 1127 aa  1692    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1353  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  51.03 
 
 		 1197 aa  1121    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1712  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  54.29 
 
 		 1173 aa  1140    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0670  sensor histidine kinase/response regulator  49.91 
 
 		 1170 aa  1048    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.315036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3865  ATP-binding region, ATPase-like  50.31 
 
 		 1122 aa  1108    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1082  histidine kinase  47.05 
 
 		 1220 aa  1024    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3731  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  53.14 
 
 		 1140 aa  1151    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.27 
 
 		 1127 aa  1054    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0978  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.88 
 
 		 1175 aa  1095    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3691  histidine kinase  46.83 
 
 		 1071 aa  872    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  75.51 
 
 		 1153 aa  1650    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4637  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  53.14 
 
 		 1140 aa  1151    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.619414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3382  ATPase domain-containing protein  46.74 
 
 		 1071 aa  875    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.740946 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3146  histidine kinase  100 
 
 		 1140 aa  2307    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.353593  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.51 
 
 		 1126 aa  996    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3525  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.42 
 
 		 1197 aa  1067    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0961  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.87 
 
 		 1154 aa  949    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.544458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0653  sensor histidine kinase  50.04 
 
 		 1124 aa  1069    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.450749  normal  0.469118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6438  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  55.9 
 
 		 573 aa  610  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1894  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.45 
 
 		 1085 aa  602  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.5 
 
 		 555 aa  585  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 		 874 aa  490  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0610  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin family protein  43.64 
 
 		 568 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1280  hypothetical protein  46.23 
 
 		 596 aa  422  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.961931  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0985  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  44.55 
 
 		 575 aa  391  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012046 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3405  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  46.28 
 
 		 570 aa  392  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.286515  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13491  integral membrane protein  40.55 
 
 		 443 aa  304  5.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.134076 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  36.47 
 
 		 2051 aa  299  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.37 
 
 		 865 aa  295  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  37.86 
 
 		 781 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 		 811 aa  286  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.27 
 
 		 721 aa  284  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 784 aa  277  9e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 922 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  41.03 
 
 		 1257 aa  276  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  37.27 
 
 		 1323 aa  273  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 		 750 aa  272  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 		 1323 aa  270  8.999999999999999e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.26 
 
 		 939 aa  266  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.2 
 
 		 720 aa  266  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 		 1578 aa  265  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.16 
 
 		 846 aa  263  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 		 1611 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 989 aa  259  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.49 
 
 		 770 aa  259  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 		 935 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  39.8 
 
 		 800 aa  256  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 		 1058 aa  255  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 		 937 aa  254  9.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  38.41 
 
 		 970 aa  253  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.45 
 
 		 989 aa  253  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 		 1068 aa  250  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  37.19 
 
 		 810 aa  249  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 		 1285 aa  249  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 747 aa  248  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 1090 aa  246  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1090 aa  244  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  38.02 
 
 		 853 aa  243  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 		 1187 aa  241  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.94 
 
 		 1322 aa  240  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 817 aa  238  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1664  histidine kinase  36.89 
 
 		 530 aa  238  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.586003  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 		 860 aa  234  9e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4725  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 		 614 aa  232  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269083  normal  0.0435637 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.95 
 
 		 844 aa  233  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.95 
 
 		 844 aa  232  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 		 1172 aa  230  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 945 aa  229  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.59 
 
 		 853 aa  229  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2174  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.25 
 
 		 633 aa  228  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.634157  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 		 1611 aa  228  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 		 1075 aa  228  7e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 		 841 aa  226  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 		 929 aa  226  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 		 1407 aa  225  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.75 
 
 		 738 aa  224  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.11 
 
 		 791 aa  224  8e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 765 aa  223  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>