More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2976 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4239  histidine kinase  47.46 
 
 		 1211 aa  1010    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  49.69 
 
 		 1128 aa  1097    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  50.71 
 
 		 1161 aa  1078    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0592  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.22 
 
 		 1113 aa  1080    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0114606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1446  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  49.29 
 
 		 1131 aa  1021    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.705679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  50.8 
 
 		 1121 aa  1120    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.18 
 
 		 1126 aa  1102    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1082  histidine kinase  47.39 
 
 		 1220 aa  981    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0978  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.43 
 
 		 1175 aa  1003    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3146  histidine kinase  47.66 
 
 		 1140 aa  992    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.353593  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0975  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  51.1 
 
 		 1130 aa  1113    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.537982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3691  histidine kinase  49.21 
 
 		 1071 aa  999    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5513  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.93 
 
 		 1124 aa  1027    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168644  normal  0.269782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3525  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.56 
 
 		 1197 aa  985    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2001  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.66 
 
 		 1121 aa  988    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  50.44 
 
 		 1125 aa  1107    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  56.75 
 
 		 1127 aa  1304    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0670  sensor histidine kinase/response regulator  46.28 
 
 		 1170 aa  1005    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.315036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.28 
 
 		 1122 aa  1152    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0612415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3398  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  48.58 
 
 		 1202 aa  1042    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.613847  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2976  two-component hybrid sensor and regulator  100 
 
 		 1132 aa  2331    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.210238 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.22 
 
 		 1146 aa  1046    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.87 
 
 		 1127 aa  1034    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1353  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  48.74 
 
 		 1197 aa  1011    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1712  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  48.31 
 
 		 1173 aa  1001    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3865  ATP-binding region, ATPase-like  50.71 
 
 		 1122 aa  1136    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.42 
 
 		 1128 aa  1095    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3731  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  47.21 
 
 		 1140 aa  981    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1586  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.38 
 
 		 1178 aa  1034    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.830805  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3382  ATPase domain-containing protein  48.98 
 
 		 1071 aa  998    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525319  normal  0.740946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1442  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.8 
 
 		 1122 aa  1133    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3573  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.56 
 
 		 1120 aa  1051    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4637  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  47.21 
 
 		 1140 aa  981    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.619414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00879  two-component hybrid sensor and regulator  47.97 
 
 		 1100 aa  1030    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1730  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.28 
 
 		 1195 aa  971    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479441  normal  0.752594 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0219  histidine kinase  45.18 
 
 		 1166 aa  950    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.803779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0961  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.69 
 
 		 1154 aa  1150    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.544458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0653  sensor histidine kinase  50.35 
 
 		 1124 aa  1125    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.450749  normal  0.469118 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5667  histidine kinase  47.21 
 
 		 1140 aa  983    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  48.26 
 
 		 1153 aa  1027    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1894  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.53 
 
 		 1085 aa  600  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6438  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  51.93 
 
 		 573 aa  553  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.09 
 
 		 555 aa  545  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 874 aa  488  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1280  hypothetical protein  42.34 
 
 		 596 aa  417  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.961931  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0610  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin family protein  43.49 
 
 		 568 aa  416  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3405  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  40.88 
 
 		 570 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.286515  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0985  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  41.75 
 
 		 575 aa  375  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0012046 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13491  integral membrane protein  41.87 
 
 		 443 aa  307  9.000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.134076 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 		 811 aa  270  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 		 939 aa  269  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  38.27 
 
 		 781 aa  268  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 		 770 aa  265  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 		 1323 aa  263  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  32.53 
 
 		 1323 aa  261  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 		 865 aa  260  9e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  34.13 
 
 		 2051 aa  257  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 		 937 aa  255  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 		 721 aa  255  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.88 
 
 		 784 aa  254  8.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 935 aa  253  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 		 750 aa  252  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 		 922 aa  251  6e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 		 989 aa  250  9e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1664  histidine kinase  35.88 
 
 		 530 aa  250  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.586003  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 		 720 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 		 844 aa  241  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 		 844 aa  241  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 		 945 aa  240  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 		 1285 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 		 989 aa  239  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.81 
 
 		 929 aa  228  7e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.72 
 
 		 841 aa  225  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.72 
 
 		 1002 aa  225  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.72 
 
 		 1002 aa  225  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 1058 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 		 1611 aa  224  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 		 1090 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 		 1090 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 		 1068 aa  222  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  32.6 
 
 		 1257 aa  222  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 		 1578 aa  221  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 		 870 aa  221  7e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 		 1099 aa  220  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.57 
 
 		 747 aa  220  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  33.42 
 
 		 800 aa  219  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0264  Signal transduction histidine kinase-like  32.64 
 
 		 666 aa  217  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3693  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 		 602 aa  216  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 		 738 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  33.64 
 
 		 1763 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.49 
 
 		 1322 aa  213  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.83 
 
 		 1187 aa  212  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 		 1410 aa  211  4e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 1002 aa  212  4e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  33.49 
 
 		 882 aa  211  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 		 907 aa  210  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 1765 aa  210  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 		 947 aa  209  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 970 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 		 995 aa  210  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>