More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3211 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  100 
 
 
781 aa  1580    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  46.08 
 
 
811 aa  439  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.76 
 
 
922 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  47.31 
 
 
2051 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.09 
 
 
750 aa  405  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  44.03 
 
 
937 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  47.72 
 
 
935 aa  399  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.5 
 
 
945 aa  387  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.83 
 
 
939 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.16 
 
 
784 aa  343  5.999999999999999e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.34 
 
 
989 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.24 
 
 
989 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.79 
 
 
865 aa  330  6e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 
721 aa  323  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.72 
 
 
720 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 
1128 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 
770 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  37.37 
 
 
1128 aa  304  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  38.72 
 
 
1323 aa  299  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.39 
 
 
1068 aa  298  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1323 aa  297  5e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.87 
 
 
929 aa  296  7e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 
1285 aa  294  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  36.38 
 
 
1125 aa  293  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  40.85 
 
 
1153 aa  291  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.04 
 
 
1611 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.43 
 
 
1090 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1586  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.75 
 
 
1178 aa  289  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.830805  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.43 
 
 
1090 aa  289  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 
1127 aa  288  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.8 
 
 
1578 aa  288  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0975  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 
1130 aa  286  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.537982 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.21 
 
 
1127 aa  283  8.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  37.01 
 
 
1257 aa  282  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  35.32 
 
 
1161 aa  282  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 
1058 aa  282  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 
1146 aa  281  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0653  sensor histidine kinase  37.68 
 
 
1124 aa  281  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.450749  normal  0.469118 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 
1126 aa  280  6e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  39.44 
 
 
810 aa  277  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.16 
 
 
844 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.16 
 
 
844 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 
1187 aa  275  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1446  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.04 
 
 
1131 aa  273  6e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.705679  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.25 
 
 
1099 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0961  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.2 
 
 
1154 aa  271  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.544458  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3146  histidine kinase  38.3 
 
 
1140 aa  270  7e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.353593  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.39 
 
 
1002 aa  269  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2976  two-component hybrid sensor and regulator  38.27 
 
 
1132 aa  268  4e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.210238 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 
1122 aa  267  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0612415  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0592  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 
1113 aa  267  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0114606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2174  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.51 
 
 
633 aa  267  7e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.634157  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1442  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 
1122 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  39.34 
 
 
800 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3865  ATP-binding region, ATPase-like  36.29 
 
 
1122 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1730  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
1195 aa  261  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479441  normal  0.752594 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0670  sensor histidine kinase/response regulator  36.23 
 
 
1170 aa  260  8e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.315036  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 
1002 aa  259  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.53 
 
 
633 aa  259  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 
1002 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  36.96 
 
 
1121 aa  259  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.55 
 
 
823 aa  259  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 
1322 aa  258  4e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.09 
 
 
631 aa  258  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3731  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 
1140 aa  256  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4637  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 
1140 aa  256  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.619414  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5667  histidine kinase  36.42 
 
 
1140 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0978  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 
1175 aa  256  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3398  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 
1202 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.613847  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
785 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5513  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 
1124 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168644  normal  0.269782 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1082  histidine kinase  36.44 
 
 
1220 aa  253  7e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1353  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 
1197 aa  253  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  38.56 
 
 
655 aa  252  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  40.46 
 
 
620 aa  252  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  37.26 
 
 
651 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  37.59 
 
 
853 aa  250  6e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.69 
 
 
606 aa  250  8e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 
643 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 
1064 aa  249  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.22 
 
 
841 aa  249  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0219  histidine kinase  36.73 
 
 
1166 aa  249  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.803779  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 
827 aa  248  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.14 
 
 
929 aa  248  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 
765 aa  248  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 
643 aa  248  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.73 
 
 
882 aa  248  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  36.47 
 
 
641 aa  247  4.9999999999999997e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  35.25 
 
 
900 aa  247  6e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.68 
 
 
1350 aa  247  6e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 
643 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 
969 aa  246  9.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.85 
 
 
763 aa  246  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 
1927 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 
1350 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  36.23 
 
 
1028 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 
1433 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 
862 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 
1203 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3525  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.26 
 
 
1197 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.471601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>