More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6560 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  61.51 
 
 		 721 aa  852    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 720 aa  1448    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.79 
 
 		 939 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.59 
 
 		 989 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.43 
 
 		 989 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  41.12 
 
 		 811 aa  362  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  39.76 
 
 		 2051 aa  359  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 770 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 865 aa  348  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 		 922 aa  340  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  38.72 
 
 		 781 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.37 
 
 		 1323 aa  326  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 		 937 aa  325  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 631 aa  323  8e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3243  PAS sensor protein  41.03 
 
 		 1323 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.63 
 
 		 784 aa  321  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 		 750 aa  320  3.9999999999999996e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  43.57 
 
 		 1257 aa  319  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2475  sensor histidine kinase/response regulator  33.59 
 
 		 784 aa  311  2e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446979  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 		 935 aa  310  6.999999999999999e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  33.12 
 
 		 641 aa  307  4.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.14 
 
 		 929 aa  306  9.000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5715  putative two-component sensor  36.46 
 
 		 750 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.901003  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  37.63 
 
 		 810 aa  298  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 		 945 aa  296  8e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 		 1322 aa  295  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.54 
 
 		 1127 aa  295  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65860  putative two-component sensor  35.99 
 
 		 770 aa  292  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 1611 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 		 1058 aa  289  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.54 
 
 		 1578 aa  287  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3586  sensor histidine kinase/response regulator  42.44 
 
 		 1153 aa  287  5.999999999999999e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.04 
 
 		 1187 aa  284  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.72 
 
 		 1285 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.07 
 
 		 1099 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  36.49 
 
 		 659 aa  273  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0202  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 		 781 aa  272  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 1090 aa  272  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1586  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.36 
 
 		 1178 aa  270  5.9999999999999995e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.830805  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 1090 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  37.02 
 
 		 800 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3398  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 		 1202 aa  268  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.613847  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  35.81 
 
 		 1121 aa  267  4e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 		 784 aa  268  4e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 1002 aa  267  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 		 1002 aa  267  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 844 aa  267  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 844 aa  267  7e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.32 
 
 		 1127 aa  266  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2174  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 		 633 aa  265  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.634157  normal  0.649523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3865  ATP-binding region, ATPase-like  37.04 
 
 		 1122 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2178  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 		 750 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00477296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3728  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 		 750 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.27 
 
 		 932 aa  263  6e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.88 
 
 		 1068 aa  263  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0653  sensor histidine kinase  37.42 
 
 		 1124 aa  263  8e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.450749  normal  0.469118 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 1146 aa  262  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 		 1126 aa  261  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 		 1122 aa  260  6e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0612415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1730  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 1195 aa  260  6e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479441  normal  0.752594 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  41.22 
 
 		 1028 aa  259  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  33.88 
 
 		 1125 aa  258  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1446  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.42 
 
 		 1131 aa  258  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.705679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 		 1002 aa  258  3e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  36.6 
 
 		 1560 aa  258  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2035  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 		 750 aa  257  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1082  histidine kinase  35 
 
 		 1220 aa  257  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 		 1271 aa  256  8e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  35.41 
 
 		 1161 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1128 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 		 1135 aa  255  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3320  histidine kinase  39.12 
 
 		 1128 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.515444 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  37.59 
 
 		 984 aa  255  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0219  histidine kinase  36.49 
 
 		 1166 aa  256  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.803779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.11 
 
 		 1407 aa  254  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0592  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.82 
 
 		 1113 aa  253  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0114606 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06119  histidine kinase  37.4 
 
 		 985 aa  252  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5667  histidine kinase  35.99 
 
 		 1140 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  39.56 
 
 		 1023 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1442  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 		 1122 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3525  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 		 1197 aa  252  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.45 
 
 		 655 aa  251  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  37.4 
 
 		 987 aa  251  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.96 
 
 		 1121 aa  251  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.79 
 
 		 995 aa  250  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3731  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 		 1140 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4637  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 		 1140 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.619414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0670  sensor histidine kinase/response regulator  38.62 
 
 		 1170 aa  250  6e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.315036  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  38.71 
 
 		 823 aa  249  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.81 
 
 		 860 aa  249  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.04 
 
 		 929 aa  249  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.41 
 
 		 1158 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.21 
 
 		 973 aa  249  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1353  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 		 1197 aa  249  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  39.16 
 
 		 1120 aa  249  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2976  two-component hybrid sensor and regulator  32.5 
 
 		 1132 aa  248  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.210238 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  35.84 
 
 		 544 aa  249  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 		 759 aa  248  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 		 1120 aa  248  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 		 747 aa  247  4.9999999999999997e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>