More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0648 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  100 
 
 		 984 aa  2001    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  58.73 
 
 		 987 aa  1082    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06119  histidine kinase  57.2 
 
 		 985 aa  1019    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2131  response regulator, histidine kinase  44.99 
 
 		 958 aa  751    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.739788  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1826  sensor protein TorS  32.81 
 
 		 1000 aa  475  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.811683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2131  hybrid sensory histidine kinase TorS  33.33 
 
 		 900 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2321  hybrid sensory histidine kinase TorS  32.85 
 
 		 914 aa  416  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00396933  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1229  hybrid sensory histidine kinase TorS  32.98 
 
 		 904 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0346249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1110  hybrid sensory histidine kinase TorS  32.85 
 
 		 914 aa  414  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00372691  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00996  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with TorR  32.6 
 
 		 914 aa  413  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.458275  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2602  hybrid sensory histidine kinase TorS  32.88 
 
 		 904 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01003  hypothetical protein  32.6 
 
 		 914 aa  413  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.624093  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1104  hybrid sensory histidine kinase TorS  32.74 
 
 		 914 aa  412  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2649  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 		 899 aa  405  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0141024  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4216  hybrid sensory histidine kinase TorS  32.62 
 
 		 895 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4109  hybrid sensory histidine kinase TorS  32.52 
 
 		 895 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4037  hybrid sensory histidine kinase TorS  32.52 
 
 		 895 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4054  hybrid sensory histidine kinase TorS  32.41 
 
 		 923 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4158  hybrid sensory histidine kinase TorS  32.52 
 
 		 895 aa  386  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.315093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1992  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 		 999 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.721903  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1230  sensor histidine kinase/response regulator TorS  31.42 
 
 		 1025 aa  343  7e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3345  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.55 
 
 		 1038 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1152  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 		 1025 aa  331  4e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 		 1020 aa  330  6e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.29 
 
 		 1017 aa  330  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.94198 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2051  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 1007 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.442026  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3215  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.87 
 
 		 1030 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3215  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 		 1020 aa  328  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2801  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 		 1041 aa  327  5e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1114  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.72 
 
 		 1017 aa  327  5e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0985  sensor histidine kinase/response regulator TorS  30.73 
 
 		 973 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.374582 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3532  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 		 996 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.403445 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1049  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.69 
 
 		 1017 aa  319  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3365  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 		 1009 aa  312  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3242  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.6 
 
 		 980 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 		 764 aa  304  6.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.67 
 
 		 1075 aa  299  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 		 817 aa  296  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.92 
 
 		 674 aa  294  4e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  36.78 
 
 		 982 aa  294  6e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.43 
 
 		 1120 aa  292  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.08 
 
 		 780 aa  287  7e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3728  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 750 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.58 
 
 		 1350 aa  284  6.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1277  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.69 
 
 		 811 aa  284  6.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 		 1433 aa  283  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  41.09 
 
 		 1560 aa  283  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  42.89 
 
 		 631 aa  281  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5715  putative two-component sensor  44.59 
 
 		 750 aa  281  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.901003  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2178  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 		 750 aa  280  8e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00477296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  34.58 
 
 		 968 aa  280  9e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.78 
 
 		 866 aa  280  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2035  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 		 750 aa  280  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  41.59 
 
 		 578 aa  278  5e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 		 827 aa  277  6e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.58 
 
 		 902 aa  277  7e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.8 
 
 		 1127 aa  277  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.43 
 
 		 969 aa  277  7e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 		 781 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 		 882 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.85 
 
 		 995 aa  275  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2396  histidine kinase  43.08 
 
 		 539 aa  275  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106517 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 		 827 aa  275  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  36 
 
 		 793 aa  275  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  39.14 
 
 		 553 aa  275  4.0000000000000004e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.31 
 
 		 932 aa  275  5.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.9 
 
 		 765 aa  274  6e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2475  sensor histidine kinase/response regulator  32.41 
 
 		 784 aa  274  7e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446979  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.25 
 
 		 667 aa  274  7e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  41.57 
 
 		 588 aa  273  8.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 724 aa  273  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3645  aerobic respiration control sensor protein ArcB  33.46 
 
 		 777 aa  273  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0208563  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3590  aerobic respiration control sensor protein ArcB  33.79 
 
 		 778 aa  273  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.571349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.59 
 
 		 631 aa  273  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3519  aerobic respiration control sensor protein ArcB  33.79 
 
 		 778 aa  273  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3688  aerobic respiration control sensor protein ArcB  33.79 
 
 		 778 aa  273  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.739542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3626  aerobic respiration control sensor protein ArcB  33.79 
 
 		 778 aa  273  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10996  normal  0.809738 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.33 
 
 		 763 aa  273  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.01 
 
 		 1199 aa  273  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.51 
 
 		 743 aa  273  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.48 
 
 		 717 aa  272  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3521  aerobic respiration control sensor protein ArcB  33.79 
 
 		 778 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 		 896 aa  273  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3631  aerobic respiration control sensor protein ArcB  33.4 
 
 		 779 aa  272  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330412  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 916 aa  271  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4471  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.48 
 
 		 627 aa  271  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.611462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.35 
 
 		 1120 aa  271  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65860  putative two-component sensor  43.51 
 
 		 770 aa  271  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3789  aerobic respiration control sensor protein ArcB  33.66 
 
 		 779 aa  270  7e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00874982  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 		 846 aa  270  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3403  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.22 
 
 		 778 aa  269  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  41.8 
 
 		 735 aa  269  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  34.01 
 
 		 800 aa  269  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 		 822 aa  268  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03075  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ArcA  32.22 
 
 		 778 aa  268  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0497  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.22 
 
 		 778 aa  268  4e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03026  hypothetical protein  32.22 
 
 		 778 aa  268  4e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4279  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 		 951 aa  268  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0490  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.22 
 
 		 778 aa  268  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3506  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.22 
 
 		 778 aa  268  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.648174  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>