More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06119 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2131  response regulator, histidine kinase  47.24 
 
 		 958 aa  816    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.739788  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06119  histidine kinase  100 
 
 		 985 aa  2005    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  57.47 
 
 		 984 aa  1022    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  85.92 
 
 		 987 aa  1702    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1826  sensor protein TorS  31.96 
 
 		 1000 aa  471  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.811683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1229  hybrid sensory histidine kinase TorS  31.19 
 
 		 904 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0346249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2321  hybrid sensory histidine kinase TorS  30.86 
 
 		 914 aa  399  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00396933  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1110  hybrid sensory histidine kinase TorS  30.93 
 
 		 914 aa  399  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00372691  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00996  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with TorR  30.63 
 
 		 914 aa  396  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.458275  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01003  hypothetical protein  30.63 
 
 		 914 aa  396  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.624093  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2131  hybrid sensory histidine kinase TorS  30.88 
 
 		 900 aa  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1104  hybrid sensory histidine kinase TorS  30.63 
 
 		 914 aa  395  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2602  hybrid sensory histidine kinase TorS  30.91 
 
 		 904 aa  391  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.417001 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2649  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 		 899 aa  389  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0141024  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4216  hybrid sensory histidine kinase TorS  30.1 
 
 		 895 aa  349  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4109  hybrid sensory histidine kinase TorS  29.58 
 
 		 895 aa  345  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4158  hybrid sensory histidine kinase TorS  29.58 
 
 		 895 aa  345  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.315093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4037  hybrid sensory histidine kinase TorS  29.79 
 
 		 895 aa  345  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4054  hybrid sensory histidine kinase TorS  29.69 
 
 		 923 aa  343  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3365  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 		 1009 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 		 1020 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3532  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 		 996 aa  325  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.403445 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1992  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.61 
 
 		 999 aa  325  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.721903  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1152  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 		 1025 aa  325  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2051  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.65 
 
 		 1007 aa  324  5e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.442026  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1114  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.07 
 
 		 1017 aa  323  8e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3215  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.62 
 
 		 1030 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2801  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 		 1041 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3215  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.62 
 
 		 1020 aa  319  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3242  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.72 
 
 		 980 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1049  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 		 1017 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1230  sensor histidine kinase/response regulator TorS  28.22 
 
 		 1025 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 		 1017 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.94198 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3345  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.51 
 
 		 1038 aa  307  7e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 		 923 aa  305  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  35.8 
 
 		 982 aa  303  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 		 817 aa  298  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 		 764 aa  297  6e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0985  sensor histidine kinase/response regulator TorS  29.28 
 
 		 973 aa  290  8e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.374582 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 		 1199 aa  289  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1277  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 		 811 aa  289  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  33.86 
 
 		 968 aa  286  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 		 781 aa  284  6.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.01 
 
 		 674 aa  283  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 		 932 aa  280  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.36 
 
 		 882 aa  278  5e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.49 
 
 		 1350 aa  277  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  39.8 
 
 		 900 aa  276  9e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 		 1204 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2547  histidine kinase  41.45 
 
 		 698 aa  276  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.795977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 1226 aa  276  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.16 
 
 		 780 aa  276  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0202  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 		 781 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.28 
 
 		 765 aa  275  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 		 1433 aa  275  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.28 
 
 		 1255 aa  274  5.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.54 
 
 		 1075 aa  273  9e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2667  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 737 aa  272  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.149434  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.23 
 
 		 763 aa  271  2.9999999999999997e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 		 1407 aa  271  4e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  32.95 
 
 		 793 aa  271  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.82 
 
 		 866 aa  271  5e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  35.29 
 
 		 2109 aa  271  5e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  33.33 
 
 		 1560 aa  269  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 1313 aa  269  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 		 1120 aa  269  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2396  histidine kinase  41.69 
 
 		 539 aa  269  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106517 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.72 
 
 		 896 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 873 aa  268  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 		 785 aa  267  5.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  40.28 
 
 		 588 aa  267  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  32.97 
 
 		 835 aa  266  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  37.76 
 
 		 544 aa  266  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  40.05 
 
 		 578 aa  266  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.44 
 
 		 846 aa  265  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 		 717 aa  265  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2178  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.7 
 
 		 750 aa  265  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00477296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 631 aa  264  6.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  36.8 
 
 		 810 aa  263  1e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4342  aerobic respiration control sensor protein ArcB  33.86 
 
 		 779 aa  263  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 		 1195 aa  263  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.87 
 
 		 631 aa  263  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 		 982 aa  263  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 995 aa  262  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 		 827 aa  262  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 		 969 aa  262  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 		 1059 aa  262  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  36.96 
 
 		 847 aa  262  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 		 643 aa  261  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 		 902 aa  261  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 643 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 		 643 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 		 1398 aa  261  6e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.44 
 
 		 667 aa  261  6e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.28 
 
 		 860 aa  261  7e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 1222 aa  260  9e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3728  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 		 750 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  35.68 
 
 		 631 aa  260  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000354  sensor histidine kinase  34.66 
 
 		 785 aa  260  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.407699  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  36.64 
 
 		 1023 aa  259  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>