More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2396 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2396  histidine kinase  100 
 
 		 539 aa  1090    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106517 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0852  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.25 
 
 		 859 aa  369  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2194  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.87 
 
 		 858 aa  316  7e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.857252  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0659  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.59 
 
 		 570 aa  314  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.12 
 
 		 995 aa  296  5e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  42.4 
 
 		 882 aa  296  5e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.92 
 
 		 846 aa  296  6e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  41.83 
 
 		 1193 aa  296  8e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.43 
 
 		 1007 aa  292  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 		 898 aa  292  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.12 
 
 		 827 aa  290  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.1 
 
 		 1199 aa  289  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  43.19 
 
 		 735 aa  289  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.79 
 
 		 767 aa  289  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.04 
 
 		 896 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 743 aa  287  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.53 
 
 		 645 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 		 902 aa  286  8e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  42.09 
 
 		 655 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.34 
 
 		 781 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.29 
 
 		 947 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.11 
 
 		 1407 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.24 
 
 		 667 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 		 827 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  40.2 
 
 		 666 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 		 822 aa  283  5.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  41.41 
 
 		 853 aa  283  6.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 837 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  42.56 
 
 		 620 aa  283  8.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  40.61 
 
 		 1028 aa  281  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.9 
 
 		 1222 aa  281  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 982 aa  281  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  40.85 
 
 		 661 aa  281  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.15 
 
 		 572 aa  279  7e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  42.34 
 
 		 582 aa  279  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  38.93 
 
 		 631 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.81 
 
 		 870 aa  278  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.19 
 
 		 1127 aa  279  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 874 aa  279  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4471  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.64 
 
 		 627 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.611462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.98 
 
 		 764 aa  278  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5254  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.65 
 
 		 579 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601488  normal  0.0228125 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  42.22 
 
 		 777 aa  278  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.11 
 
 		 724 aa  277  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.24 
 
 		 881 aa  276  5e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0460  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.57 
 
 		 835 aa  276  6e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.980587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 		 674 aa  276  6e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.25 
 
 		 957 aa  276  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  40.05 
 
 		 1560 aa  276  8e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  43.4 
 
 		 2109 aa  276  8e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 		 627 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 		 873 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  43.08 
 
 		 984 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.69 
 
 		 1287 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.41 
 
 		 1195 aa  274  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  40.41 
 
 		 759 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 		 631 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 738 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5216  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.24 
 
 		 1001 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  39.4 
 
 		 553 aa  273  6e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2957  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.37 
 
 		 810 aa  273  7e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.41 
 
 		 860 aa  273  7e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  41.93 
 
 		 1060 aa  273  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 		 1313 aa  273  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.08 
 
 		 932 aa  273  8.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  39.5 
 
 		 1023 aa  272  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.74 
 
 		 763 aa  272  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 		 969 aa  272  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  41.24 
 
 		 982 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.69 
 
 		 1442 aa  271  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2127  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.41 
 
 		 815 aa  271  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.14 
 
 		 1075 aa  270  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  41.58 
 
 		 987 aa  271  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.95 
 
 		 865 aa  270  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  39.35 
 
 		 1120 aa  270  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.21 
 
 		 762 aa  270  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  37.32 
 
 		 641 aa  270  5e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3009  GAF sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 920 aa  270  5e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.59521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 		 647 aa  270  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  36.99 
 
 		 853 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3769  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.26 
 
 		 710 aa  270  5.9999999999999995e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 		 704 aa  269  8e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2521  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.1 
 
 		 597 aa  269  8e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2161  sensor histidine kinase/response regulator  40.3 
 
 		 1286 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.88 
 
 		 873 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2664  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 		 662 aa  268  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373594  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.75 
 
 		 781 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06119  histidine kinase  41.69 
 
 		 985 aa  268  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 		 718 aa  268  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 		 1452 aa  268  2e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  37.02 
 
 		 1763 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 		 1363 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.21 
 
 		 1226 aa  267  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.91 
 
 		 1070 aa  267  4e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 		 916 aa  267  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 		 939 aa  267  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1277  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.7 
 
 		 811 aa  267  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2532  histidine kinase  38.24 
 
 		 399 aa  267  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0679268  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  38.75 
 
 		 659 aa  267  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 		 907 aa  266  5e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>