More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0852 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0852  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
859 aa  1732    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2396  histidine kinase  50.25 
 
 
539 aa  369  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.106517 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2521  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.2 
 
 
597 aa  307  6e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2194  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.02 
 
 
858 aa  301  3e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.857252  normal  0.467192 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  43.12 
 
 
631 aa  296  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.87 
 
 
846 aa  293  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  43.73 
 
 
620 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.52 
 
 
827 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  41 
 
 
1127 aa  287  7e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4471  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.51 
 
 
627 aa  286  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.611462  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.58 
 
 
822 aa  284  5.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  42.96 
 
 
1028 aa  284  6.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.1 
 
 
1075 aa  283  8.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.34 
 
 
846 aa  283  9e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02676  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 
847 aa  281  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.58 
 
 
803 aa  279  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0659  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.3 
 
 
570 aa  278  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.33 
 
 
837 aa  278  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.61 
 
 
959 aa  277  8e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.03 
 
 
674 aa  276  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3769  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.39 
 
 
710 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  40.64 
 
 
666 aa  276  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29290  hybrid histidine protein kinase  42.44 
 
 
826 aa  275  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.52 
 
 
765 aa  274  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  40.58 
 
 
661 aa  273  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.3 
 
 
878 aa  272  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.9 
 
 
718 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.57 
 
 
902 aa  271  4e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  40.64 
 
 
735 aa  270  7e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.8 
 
 
817 aa  270  7e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  40.85 
 
 
1560 aa  270  8.999999999999999e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.15 
 
 
873 aa  270  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2790  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.33 
 
 
592 aa  269  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0688167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2547  histidine kinase  42.68 
 
 
698 aa  269  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.795977  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.2 
 
 
1407 aa  269  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2664  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.37 
 
 
662 aa  268  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373594  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.64 
 
 
606 aa  269  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  42.72 
 
 
738 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.19 
 
 
1055 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.27 
 
 
738 aa  268  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2693  histidine kinase  38.17 
 
 
782 aa  268  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.145264  normal  0.474998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0585  ATP-binding region ATPase domain protein  40.42 
 
 
528 aa  267  5e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.215545  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.19 
 
 
932 aa  268  5e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  38.35 
 
 
968 aa  267  5e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2127  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.63 
 
 
815 aa  267  5.999999999999999e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.87 
 
 
1222 aa  267  7e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.25 
 
 
827 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.78 
 
 
1350 aa  266  8.999999999999999e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  41.56 
 
 
777 aa  265  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.75 
 
 
772 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1267  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.19 
 
 
916 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.25 
 
 
724 aa  265  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  37.72 
 
 
736 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.66 
 
 
862 aa  265  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.75 
 
 
789 aa  265  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.11 
 
 
781 aa  265  3e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  43.35 
 
 
553 aa  265  3e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 
1452 aa  265  4e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  41.51 
 
 
578 aa  264  4.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.62 
 
 
939 aa  264  4.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 
944 aa  264  6e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.6 
 
 
717 aa  264  6.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.98 
 
 
898 aa  263  8e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.65 
 
 
860 aa  263  8.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.31 
 
 
947 aa  263  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.06 
 
 
863 aa  263  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3009  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 
920 aa  263  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.59521  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  41.03 
 
 
742 aa  263  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.34 
 
 
763 aa  263  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 
881 aa  263  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.54 
 
 
647 aa  262  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372822  normal  0.204987 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.15 
 
 
1068 aa  262  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.01 
 
 
801 aa  262  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.59 
 
 
1691 aa  262  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.99 
 
 
781 aa  261  3e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.2 
 
 
572 aa  261  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.59 
 
 
902 aa  261  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.17 
 
 
1195 aa  261  6e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 
631 aa  260  7e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  43 
 
 
877 aa  260  7e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4279  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.42 
 
 
951 aa  260  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.34 
 
 
667 aa  260  8e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.3 
 
 
1287 aa  260  8e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.1 
 
 
876 aa  260  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 
780 aa  259  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.47 
 
 
1229 aa  259  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.6 
 
 
1143 aa  259  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.78 
 
 
850 aa  259  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1560  response regulator, histidine kinase  36.55 
 
 
697 aa  259  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0213368  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.4 
 
 
1059 aa  259  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1377  Cache sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 
731 aa  258  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873394  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  41.75 
 
 
982 aa  258  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0221  histidine kinase  41.77 
 
 
476 aa  258  4e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.641728  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5254  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.77 
 
 
579 aa  257  5e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601488  normal  0.0228125 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.82 
 
 
1199 aa  258  5e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.69 
 
 
743 aa  257  6e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  42.3 
 
 
655 aa  257  6e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.99 
 
 
1226 aa  257  6e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  42.53 
 
 
559 aa  257  8e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  39.65 
 
 
1060 aa  256  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>