More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2547 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2547  histidine kinase  100 
 
 		 698 aa  1388    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.795977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2539  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 		 554 aa  364  3e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.787523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4471  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.64 
 
 		 627 aa  353  8e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.611462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2790  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.07 
 
 		 592 aa  325  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0688167 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2127  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.57 
 
 		 815 aa  323  7e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1977  histidine kinase  48.63 
 
 		 534 aa  323  8e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.313704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2964  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.87 
 
 		 647 aa  315  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3693  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.62 
 
 		 602 aa  300  7e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.62 
 
 		 882 aa  298  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.54 
 
 		 1070 aa  298  2e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  41.88 
 
 		 968 aa  295  1e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.83 
 
 		 1433 aa  290  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  40.52 
 
 		 982 aa  289  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.22 
 
 		 724 aa  289  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  43.56 
 
 		 661 aa  286  8e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0620  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.23 
 
 		 645 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.72 
 
 		 817 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.91 
 
 		 973 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  40.3 
 
 		 882 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  40.6 
 
 		 853 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3769  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.85 
 
 		 710 aa  285  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.729669 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  43.54 
 
 		 578 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.21 
 
 		 827 aa  282  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.29 
 
 		 1127 aa  281  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.46 
 
 		 1313 aa  281  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 		 781 aa  281  3e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.93 
 
 		 1068 aa  281  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2521  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.13 
 
 		 597 aa  280  6e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.65 
 
 		 873 aa  280  9e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 		 780 aa  279  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.54 
 
 		 969 aa  279  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3325  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 		 667 aa  278  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1355  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.83 
 
 		 895 aa  277  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  37.67 
 
 		 544 aa  277  5e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.84 
 
 		 1135 aa  277  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 		 902 aa  276  6e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  42.75 
 
 		 738 aa  276  8e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.75 
 
 		 995 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.96 
 
 		 940 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  44.04 
 
 		 666 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06119  histidine kinase  41.45 
 
 		 985 aa  276  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  41.84 
 
 		 588 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.5 
 
 		 916 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  41.48 
 
 		 1120 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 		 1075 aa  275  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2769  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.41 
 
 		 773 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.81 
 
 		 876 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.85 
 
 		 785 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.59 
 
 		 772 aa  274  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000354  sensor histidine kinase  39.01 
 
 		 785 aa  273  6e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.407699  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.65 
 
 		 1350 aa  273  7e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003464  signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 573 aa  273  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.17 
 
 		 1116 aa  273  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.92 
 
 		 881 aa  272  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.23 
 
 		 957 aa  272  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 		 896 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.4 
 
 		 803 aa  271  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  37.81 
 
 		 736 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  40.99 
 
 		 606 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.1 
 
 		 1120 aa  271  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 		 738 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3110  putative integral membrane sensor protein  41.33 
 
 		 1141 aa  271  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0940316 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.42 
 
 		 741 aa  271  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0659  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.29 
 
 		 570 aa  271  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44 
 
 		 718 aa  270  5e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.15 
 
 		 846 aa  270  5.9999999999999995e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 		 631 aa  270  7e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3526  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.78 
 
 		 835 aa  270  8e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.722503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  41.51 
 
 		 559 aa  270  8e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.75 
 
 		 902 aa  270  8.999999999999999e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.35 
 
 		 667 aa  269  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  42.82 
 
 		 571 aa  269  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.56 
 
 		 932 aa  269  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.85 
 
 		 1691 aa  269  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  38.9 
 
 		 810 aa  268  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  39.86 
 
 		 641 aa  269  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.49 
 
 		 524 aa  268  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.69 
 
 		 877 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0393x  response regulator, histidine kinase  37.32 
 
 		 943 aa  269  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621999  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  41.34 
 
 		 651 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.21 
 
 		 1027 aa  268  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.49 
 
 		 977 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0852  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.68 
 
 		 859 aa  268  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 		 969 aa  268  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4725  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 		 614 aa  267  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269083  normal  0.0435637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.75 
 
 		 791 aa  267  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.57 
 
 		 674 aa  267  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02206  hypothetical protein  40.21 
 
 		 827 aa  267  5e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.26 
 
 		 1199 aa  267  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  37.42 
 
 		 589 aa  266  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0064  histidine kinase  37.45 
 
 		 598 aa  266  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.77 
 
 		 764 aa  266  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  41.97 
 
 		 1346 aa  265  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.36 
 
 		 1791 aa  265  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2504  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 		 1132 aa  265  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.95 
 
 		 1271 aa  265  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.03 
 
 		 743 aa  265  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 		 1069 aa  265  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1874  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.78 
 
 		 575 aa  265  3e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.807127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 		 1055 aa  265  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>