More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0811 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 724 aa  1484    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  92.16 
 
 		 718 aa  1326    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.85 
 
 		 717 aa  520  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  44.95 
 
 		 850 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.67 
 
 		 817 aa  365  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  42.63 
 
 		 982 aa  359  9e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 		 781 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  40.7 
 
 		 835 aa  335  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  44.52 
 
 		 578 aa  334  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  43.44 
 
 		 588 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.13 
 
 		 902 aa  330  7e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 		 1127 aa  327  5e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.14 
 
 		 767 aa  327  6e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  38.77 
 
 		 1560 aa  325  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  41.94 
 
 		 661 aa  325  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  44.89 
 
 		 544 aa  324  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.31 
 
 		 1199 aa  323  5e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  43.76 
 
 		 772 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  38.3 
 
 		 968 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  45.45 
 
 		 882 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  38.29 
 
 		 1060 aa  319  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.99 
 
 		 827 aa  319  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 		 882 aa  318  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.66 
 
 		 846 aa  317  3e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.66 
 
 		 1313 aa  317  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.18 
 
 		 738 aa  317  6e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  45.64 
 
 		 631 aa  317  6e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.84 
 
 		 863 aa  317  7e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 		 1287 aa  316  7e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  44.87 
 
 		 631 aa  316  7e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 932 aa  316  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  38.31 
 
 		 736 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.35 
 
 		 1407 aa  312  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.94 
 
 		 881 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.03 
 
 		 572 aa  310  4e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.33 
 
 		 940 aa  310  5e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 		 1195 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 864 aa  310  8e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.35 
 
 		 974 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.38 
 
 		 647 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.79 
 
 		 647 aa  308  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.47 
 
 		 645 aa  307  5.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  38.93 
 
 		 793 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  45.2 
 
 		 735 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.43 
 
 		 1791 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  42.63 
 
 		 777 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  37.3 
 
 		 732 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.62 
 
 		 763 aa  305  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.97 
 
 		 667 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  41.63 
 
 		 1028 aa  305  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.95 
 
 		 641 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.870294  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 1433 aa  303  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  42.55 
 
 		 1193 aa  303  9e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.76 
 
 		 631 aa  302  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.95 
 
 		 1007 aa  303  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 		 896 aa  301  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.78 
 
 		 1068 aa  300  5e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.24 
 
 		 743 aa  300  6e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0206  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.7 
 
 		 771 aa  300  6e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.54 
 
 		 674 aa  300  6e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 		 1222 aa  300  8e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 		 939 aa  300  8e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.05 
 
 		 1075 aa  299  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 		 662 aa  298  3e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  45.16 
 
 		 571 aa  297  5e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.4 
 
 		 827 aa  297  6e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  40.32 
 
 		 651 aa  296  7e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42 
 
 		 1691 aa  296  9e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.72 
 
 		 947 aa  296  9e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.54 
 
 		 965 aa  296  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332193  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.97 
 
 		 957 aa  296  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 		 907 aa  296  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  43.35 
 
 		 606 aa  296  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  44.36 
 
 		 729 aa  295  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  38.08 
 
 		 666 aa  295  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.12 
 
 		 898 aa  294  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1760  histidine kinase  41.33 
 
 		 671 aa  294  4e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  38.92 
 
 		 651 aa  294  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.39 
 
 		 704 aa  293  5e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.12 
 
 		 627 aa  293  6e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 		 695 aa  293  6e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  39 
 
 		 1229 aa  293  8e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  40.62 
 
 		 620 aa  292  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.09 
 
 		 1044 aa  293  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.14 
 
 		 741 aa  292  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.28 
 
 		 765 aa  292  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 		 947 aa  292  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 850 aa  292  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  42.51 
 
 		 1023 aa  291  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  40.89 
 
 		 641 aa  291  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 		 873 aa  290  6e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.75 
 
 		 1350 aa  290  7e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.03 
 
 		 962 aa  290  7e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 822 aa  290  8e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2547  histidine kinase  44.22 
 
 		 698 aa  290  8e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.795977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.65 
 
 		 653 aa  290  9e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  43.86 
 
 		 559 aa  290  9e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 		 803 aa  289  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  43 
 
 		 959 aa  288  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  36.96 
 
 		 1120 aa  288  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>