More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1230 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2801  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.67 
 
 		 1041 aa  875    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3215  multi-sensor hybrid histidine kinase  73.43 
 
 		 1030 aa  1355    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1230  sensor histidine kinase/response regulator TorS  100 
 
 		 1025 aa  2058    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  74.05 
 
 		 1020 aa  1365    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3532  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.04 
 
 		 996 aa  929    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.403445 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3215  multi-sensor hybrid histidine kinase  74.24 
 
 		 1020 aa  1365    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1049  multi-sensor hybrid histidine kinase  85.41 
 
 		 1017 aa  1610    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1114  multi-sensor hybrid histidine kinase  84.75 
 
 		 1017 aa  1613    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1992  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.53 
 
 		 999 aa  894    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.721903  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3365  multi-sensor hybrid histidine kinase  56.36 
 
 		 1009 aa  966    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1152  Hpt sensor hybrid histidine kinase  73.88 
 
 		 1025 aa  1365    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3345  Hpt sensor hybrid histidine kinase  51.59 
 
 		 1038 aa  892    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  84.53 
 
 		 1017 aa  1606    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.94198 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0985  sensor histidine kinase/response regulator TorS  46.36 
 
 		 973 aa  723    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.374582 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1826  sensor protein TorS  30.58 
 
 		 1000 aa  363  7.0000000000000005e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.811683  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  31.26 
 
 		 984 aa  353  1e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  28.92 
 
 		 987 aa  341  4e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2131  response regulator, histidine kinase  29.92 
 
 		 958 aa  339  9.999999999999999e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.739788  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06119  histidine kinase  27.87 
 
 		 985 aa  319  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2051  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.57 
 
 		 1007 aa  250  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.442026  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 781 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3563  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.07 
 
 		 1023 aa  229  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 		 817 aa  218  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0307  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.2 
 
 		 789 aa  217  9e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0739851  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0301  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.19 
 
 		 789 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0737861  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 724 aa  213  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  28.77 
 
 		 793 aa  213  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1229  hybrid sensory histidine kinase TorS  28.71 
 
 		 904 aa  212  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0346249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2617  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.44 
 
 		 554 aa  213  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1126  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.48 
 
 		 778 aa  212  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.48 
 
 		 778 aa  211  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0807351  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0469  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.48 
 
 		 778 aa  211  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.55831  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 		 1199 aa  211  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2321  hybrid sensory histidine kinase TorS  29.03 
 
 		 914 aa  211  5e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00396933  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 903 aa  211  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1110  hybrid sensory histidine kinase TorS  28.9 
 
 		 914 aa  210  8e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00372691  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  33.6 
 
 		 2109 aa  210  9e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2602  hybrid sensory histidine kinase TorS  28.74 
 
 		 904 aa  209  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.44 
 
 		 1442 aa  209  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  31.05 
 
 		 788 aa  209  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03075  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ArcA  29.5 
 
 		 778 aa  209  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0497  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.5 
 
 		 778 aa  209  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03026  hypothetical protein  29.5 
 
 		 778 aa  209  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0490  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.5 
 
 		 778 aa  209  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3506  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.5 
 
 		 778 aa  209  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.648174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.5 
 
 		 778 aa  209  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3698  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.5 
 
 		 778 aa  209  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00996  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with TorR  28.9 
 
 		 914 aa  208  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.458275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2649  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.9 
 
 		 899 aa  208  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0141024  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3403  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.5 
 
 		 778 aa  208  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01003  hypothetical protein  28.9 
 
 		 914 aa  208  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.624093  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2131  hybrid sensory histidine kinase TorS  27.63 
 
 		 900 aa  208  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1104  hybrid sensory histidine kinase TorS  28.9 
 
 		 914 aa  208  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3242  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.97 
 
 		 980 aa  208  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1277  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 		 811 aa  207  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 		 973 aa  207  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.31 
 
 		 778 aa  207  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  35.71 
 
 		 900 aa  206  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3626  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.02 
 
 		 778 aa  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10996  normal  0.809738 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3590  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.02 
 
 		 778 aa  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.571349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3519  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.02 
 
 		 778 aa  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 		 765 aa  206  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000354  sensor histidine kinase  30.34 
 
 		 785 aa  206  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.407699  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3688  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.65 
 
 		 778 aa  206  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.739542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3521  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.65 
 
 		 778 aa  205  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3789  aerobic respiration control sensor protein ArcB  31.18 
 
 		 779 aa  205  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00874982  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2475  sensor histidine kinase/response regulator  27.27 
 
 		 784 aa  204  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446979  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 		 606 aa  204  5e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00931  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.21 
 
 		 786 aa  204  7e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 		 874 aa  203  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 		 1143 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3631  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.35 
 
 		 779 aa  202  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330412  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 		 1125 aa  202  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 		 827 aa  202  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  33.01 
 
 		 1001 aa  202  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.18 
 
 		 1199 aa  202  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 1433 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  30.85 
 
 		 982 aa  201  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3783  histidine kinase  36.39 
 
 		 737 aa  201  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18481  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  32.53 
 
 		 968 aa  201  5e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4216  hybrid sensory histidine kinase TorS  29.1 
 
 		 895 aa  201  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  35.49 
 
 		 786 aa  201  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004463  aerobic respiration control sensor protein ArcB  28.78 
 
 		 784 aa  201  7e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135915  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.04 
 
 		 1124 aa  201  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0654  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.82 
 
 		 934 aa  201  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2667  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.02 
 
 		 737 aa  201  7.999999999999999e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.149434  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 		 969 aa  201  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 		 704 aa  200  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01633  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.53 
 
 		 784 aa  200  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4037  hybrid sensory histidine kinase TorS  29.55 
 
 		 895 aa  200  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3728  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 		 750 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  36.29 
 
 		 1125 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.66 
 
 		 1255 aa  199  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4342  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.91 
 
 		 779 aa  199  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 		 717 aa  199  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 		 1068 aa  199  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 		 718 aa  199  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 865 aa  198  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3645  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.77 
 
 		 777 aa  198  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0208563  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4054  hybrid sensory histidine kinase TorS  29.4 
 
 		 923 aa  198  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>