More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3215 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1230  sensor histidine kinase/response regulator TorS  73.7 
 
 		 1025 aa  1358    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  97.09 
 
 		 1020 aa  1897    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3215  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1030 aa  2078    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3215  multi-sensor hybrid histidine kinase  97.86 
 
 		 1020 aa  1904    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3345  Hpt sensor hybrid histidine kinase  50.96 
 
 		 1038 aa  869    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2801  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.33 
 
 		 1041 aa  893    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1049  multi-sensor hybrid histidine kinase  74.25 
 
 		 1017 aa  1383    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1114  multi-sensor hybrid histidine kinase  74.4 
 
 		 1017 aa  1385    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1992  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.95 
 
 		 999 aa  894    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.721903  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3365  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.27 
 
 		 1009 aa  969    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1152  Hpt sensor hybrid histidine kinase  98.25 
 
 		 1025 aa  1918    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  74.11 
 
 		 1017 aa  1373    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.94198 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0985  sensor histidine kinase/response regulator TorS  45.13 
 
 		 973 aa  722    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.374582 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3532  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.55 
 
 		 996 aa  962    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.403445 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1826  sensor protein TorS  29.2 
 
 		 1000 aa  353  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.811683  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  29.64 
 
 		 987 aa  352  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  30.09 
 
 		 984 aa  347  6e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2131  response regulator, histidine kinase  30.63 
 
 		 958 aa  341  4e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.739788  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06119  histidine kinase  28.84 
 
 		 985 aa  332  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2051  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 1007 aa  251  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.442026  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01633  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.78 
 
 		 784 aa  231  4e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  32.06 
 
 		 793 aa  229  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3242  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 		 980 aa  227  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.27 
 
 		 781 aa  227  9e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2475  sensor histidine kinase/response regulator  29.35 
 
 		 784 aa  226  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446979  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3563  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.7 
 
 		 1023 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2321  hybrid sensory histidine kinase TorS  29.5 
 
 		 914 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00396933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2602  hybrid sensory histidine kinase TorS  29.36 
 
 		 904 aa  224  6e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1229  hybrid sensory histidine kinase TorS  30.07 
 
 		 904 aa  224  8e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0346249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1110  hybrid sensory histidine kinase TorS  29.5 
 
 		 914 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00372691  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00996  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with TorR  29.36 
 
 		 914 aa  223  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.458275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2649  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.36 
 
 		 899 aa  223  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0141024  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01003  hypothetical protein  29.36 
 
 		 914 aa  223  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.624093  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1104  hybrid sensory histidine kinase TorS  29.36 
 
 		 914 aa  223  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2131  hybrid sensory histidine kinase TorS  29.79 
 
 		 900 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  33.27 
 
 		 2109 aa  222  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  32.84 
 
 		 751 aa  221  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.04 
 
 		 1433 aa  214  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 		 874 aa  214  7.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.2 
 
 		 778 aa  214  9e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  34.01 
 
 		 968 aa  214  9e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03075  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ArcA  32.2 
 
 		 778 aa  213  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0497  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 		 778 aa  213  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3403  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.2 
 
 		 778 aa  212  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3506  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.2 
 
 		 778 aa  213  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.648174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3698  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.2 
 
 		 778 aa  213  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 695 aa  213  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03026  hypothetical protein  32.2 
 
 		 778 aa  213  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0490  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.2 
 
 		 778 aa  213  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 1199 aa  211  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3747  aerobic respiration control sensor protein ArcB  31.47 
 
 		 781 aa  211  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.244728  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0202  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.01 
 
 		 781 aa  211  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.2 
 
 		 778 aa  211  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.05 
 
 		 1124 aa  211  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0307  aerobic respiration control sensor protein ArcB  31.98 
 
 		 789 aa  211  6e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0739851  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2178  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.74 
 
 		 750 aa  210  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00477296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3728  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.03 
 
 		 750 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 		 984 aa  209  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.17 
 
 		 932 aa  209  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3519  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.94 
 
 		 778 aa  208  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3590  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.94 
 
 		 778 aa  208  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.571349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3626  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.94 
 
 		 778 aa  208  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10996  normal  0.809738 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  30.67 
 
 		 982 aa  207  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3688  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.57 
 
 		 778 aa  207  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.739542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1126  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.17 
 
 		 778 aa  207  7e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3521  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.57 
 
 		 778 aa  207  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1948  aerobic respiration control sensor protein ArcB  28.75 
 
 		 785 aa  207  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000151303  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.17 
 
 		 778 aa  206  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0807351  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0469  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.17 
 
 		 778 aa  207  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.55831  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  29.57 
 
 		 755 aa  206  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2035  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 		 750 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.87 
 
 		 1363 aa  206  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.65 
 
 		 969 aa  204  5e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  33.4 
 
 		 1001 aa  204  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 		 743 aa  204  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 		 1009 aa  204  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 973 aa  204  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 		 606 aa  204  7e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.36 
 
 		 1350 aa  204  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4342  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.24 
 
 		 779 aa  204  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  34.01 
 
 		 900 aa  204  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1277  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 		 811 aa  204  9e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1199 aa  204  9e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.1 
 
 		 1127 aa  204  9e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2667  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 		 737 aa  204  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.149434  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.85 
 
 		 817 aa  204  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 		 765 aa  202  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0301  aerobic respiration control sensor protein ArcB  31.58 
 
 		 789 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0737861  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0393x  response regulator, histidine kinase  32.76 
 
 		 943 aa  202  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621999  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 1204 aa  202  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.41 
 
 		 1442 aa  202  3.9999999999999996e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3645  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.73 
 
 		 777 aa  201  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0208563  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3631  aerobic respiration control sensor protein ArcB  31.91 
 
 		 779 aa  201  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330412  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 		 1143 aa  201  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  31.19 
 
 		 788 aa  201  7e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 		 1078 aa  201  7e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  33.48 
 
 		 1125 aa  201  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00931  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.66 
 
 		 786 aa  201  7.999999999999999e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 		 827 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3789  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.73 
 
 		 779 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00874982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>