More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01633 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  43.69 
 
 		 778 aa  656    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03075  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ArcA  43.73 
 
 		 778 aa  657    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0497  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.73 
 
 		 778 aa  657    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0490  aerobic respiration control sensor protein ArcB  43.73 
 
 		 778 aa  657    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0469  aerobic respiration control sensor protein ArcB  44.69 
 
 		 778 aa  657    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.55831  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01633  aerobic respiration control sensor protein ArcB  100 
 
 		 784 aa  1604    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3698  aerobic respiration control sensor protein ArcB  43.73 
 
 		 778 aa  657    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00931  aerobic respiration control sensor protein ArcB  46.82 
 
 		 786 aa  707    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4342  aerobic respiration control sensor protein ArcB  46.33 
 
 		 779 aa  667    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3506  aerobic respiration control sensor protein ArcB  43.73 
 
 		 778 aa  657    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.648174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3688  aerobic respiration control sensor protein ArcB  43.98 
 
 		 778 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.739542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3590  aerobic respiration control sensor protein ArcB  44.11 
 
 		 778 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.571349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3521  aerobic respiration control sensor protein ArcB  44.11 
 
 		 778 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3403  aerobic respiration control sensor protein ArcB  43.73 
 
 		 778 aa  657    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3789  aerobic respiration control sensor protein ArcB  46.35 
 
 		 779 aa  667    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00874982  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0301  aerobic respiration control sensor protein ArcB  45.6 
 
 		 789 aa  654    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0737861  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3519  aerobic respiration control sensor protein ArcB  44.11 
 
 		 778 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3645  aerobic respiration control sensor protein ArcB  43.15 
 
 		 777 aa  644    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0208563  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3747  aerobic respiration control sensor protein ArcB  72.81 
 
 		 781 aa  1159    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.244728  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1126  aerobic respiration control sensor protein ArcB  44.56 
 
 		 778 aa  656    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3626  aerobic respiration control sensor protein ArcB  44.24 
 
 		 778 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10996  normal  0.809738 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004463  aerobic respiration control sensor protein ArcB  47.7 
 
 		 784 aa  723    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135915  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  44.43 
 
 		 788 aa  644    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  43.73 
 
 		 778 aa  657    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1948  aerobic respiration control sensor protein ArcB  47.18 
 
 		 785 aa  699    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000151303  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  44.69 
 
 		 778 aa  656    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0807351  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0307  aerobic respiration control sensor protein ArcB  45.9 
 
 		 789 aa  656    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0739851  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3631  aerobic respiration control sensor protein ArcB  43.97 
 
 		 779 aa  664    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330412  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03026  hypothetical protein  43.73 
 
 		 778 aa  657    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0924  aerobic respiration control sensor protein ArcB  38.24 
 
 		 753 aa  560  1e-158  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178911  normal  0.270801 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0402  sensor histidine kinase  41.4 
 
 		 618 aa  388  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.928095  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.68 
 
 		 1222 aa  286  8e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.7 
 
 		 1059 aa  286  9e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 		 1199 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.42 
 
 		 1177 aa  282  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.54 
 
 		 965 aa  277  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332193  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.03 
 
 		 1350 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.9 
 
 		 1165 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 		 982 aa  265  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.66 
 
 		 882 aa  265  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 		 1204 aa  264  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 		 1116 aa  264  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 		 1226 aa  263  8e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 827 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.36 
 
 		 647 aa  259  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 		 738 aa  259  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 		 767 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.62 
 
 		 982 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 		 1596 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 		 873 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.33 
 
 		 1452 aa  254  5.000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 		 932 aa  254  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1355  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 		 895 aa  253  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.03 
 
 		 1070 aa  252  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2132  hypothetical protein  28.49 
 
 		 827 aa  251  5e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0393x  response regulator, histidine kinase  33.67 
 
 		 943 aa  250  8e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.56 
 
 		 647 aa  249  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 		 846 aa  249  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  38.38 
 
 		 641 aa  248  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.81 
 
 		 1078 aa  248  4e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 916 aa  247  4.9999999999999997e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.34 
 
 		 874 aa  247  6e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 		 877 aa  247  6.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 		 940 aa  246  9e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 		 772 aa  245  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 		 1313 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 		 947 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.57 
 
 		 1340 aa  244  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4006  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 782 aa  243  9e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  33.4 
 
 		 835 aa  242  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.24 
 
 		 877 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 		 864 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 		 923 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0645  two component system histidine kinase  31.87 
 
 		 630 aa  241  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000209128  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 		 939 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0748  putative aerobic respiration control sensor protein arcB  31.67 
 
 		 630 aa  241  5.999999999999999e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795042  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 		 876 aa  240  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 		 1433 aa  240  9e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.42 
 
 		 984 aa  239  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  34.54 
 
 		 588 aa  238  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.22 
 
 		 1195 aa  239  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.37 
 
 		 944 aa  238  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 		 645 aa  238  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.54 
 
 		 695 aa  238  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 631 aa  238  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 		 704 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  30.77 
 
 		 984 aa  236  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  32.15 
 
 		 732 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000354  sensor histidine kinase  31.99 
 
 		 785 aa  234  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.407699  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 		 957 aa  235  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  33.74 
 
 		 742 aa  235  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0634  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.94 
 
 		 1000 aa  234  5e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.932649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  35.97 
 
 		 631 aa  234  5e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 		 881 aa  234  5e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 674 aa  234  5e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2475  sensor histidine kinase/response regulator  31.4 
 
 		 784 aa  234  6e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446979  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02206  hypothetical protein  29.11 
 
 		 827 aa  234  6e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  31.71 
 
 		 968 aa  233  8.000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 		 1121 aa  233  9e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.62 
 
 		 868 aa  233  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>