More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2475 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2475  sensor histidine kinase/response regulator  100 
 
 		 784 aa  1612    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446979  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2178  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.39 
 
 		 750 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00477296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3728  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.52 
 
 		 750 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2035  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.39 
 
 		 750 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0202  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 		 781 aa  499  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65860  putative two-component sensor  39.89 
 
 		 770 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5715  putative two-component sensor  40.03 
 
 		 750 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.901003  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 720 aa  302  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  31.11 
 
 		 641 aa  294  4e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 631 aa  293  9e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4006  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 		 782 aa  292  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 721 aa  292  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  36.45 
 
 		 751 aa  292  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  33.07 
 
 		 968 aa  291  4e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 		 1350 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.53 
 
 		 606 aa  283  8.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.02 
 
 		 817 aa  282  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  39.95 
 
 		 1193 aa  281  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 		 896 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.1 
 
 		 923 aa  278  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 		 759 aa  278  4e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.89 
 
 		 982 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  39.8 
 
 		 544 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 		 1059 aa  275  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 1158 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 903 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  36.8 
 
 		 2109 aa  274  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  36.16 
 
 		 982 aa  273  9e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0658  histidine kinase  30.71 
 
 		 627 aa  273  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  37.24 
 
 		 794 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2934  PAS  38.01 
 
 		 955 aa  270  8e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1124 aa  270  8.999999999999999e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4279  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 		 951 aa  269  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  36.47 
 
 		 777 aa  269  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 873 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 		 717 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  33.98 
 
 		 984 aa  268  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.85 
 
 		 1596 aa  267  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  31.85 
 
 		 987 aa  267  5e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0206  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.36 
 
 		 771 aa  267  5e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 		 1433 aa  267  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 921 aa  267  7e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 882 aa  266  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 		 1009 aa  265  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.76 
 
 		 984 aa  266  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.3 
 
 		 860 aa  265  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.2 
 
 		 763 aa  265  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  37.65 
 
 		 1023 aa  264  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.55 
 
 		 784 aa  263  8e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 827 aa  263  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  35.09 
 
 		 1560 aa  262  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 		 965 aa  262  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332193  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.39 
 
 		 932 aa  261  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 		 1222 aa  260  8e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 		 524 aa  259  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2108  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 		 924 aa  258  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.154995  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.15 
 
 		 902 aa  258  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  38.42 
 
 		 786 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 		 850 aa  258  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 767 aa  258  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 		 803 aa  258  4e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.22 
 
 		 947 aa  257  5e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1826  sensor protein TorS  30.84 
 
 		 1000 aa  257  6e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.811683  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 		 724 aa  257  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  35.83 
 
 		 1120 aa  257  6e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.87 
 
 		 738 aa  256  8e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.13 
 
 		 864 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  33.46 
 
 		 631 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 		 1064 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.16 
 
 		 1226 aa  256  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 		 907 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 1195 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 		 781 aa  254  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1277  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 		 811 aa  255  3e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2667  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 		 737 aa  255  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.149434  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 		 876 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.09 
 
 		 846 aa  253  7e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  35.22 
 
 		 620 aa  253  7e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.9 
 
 		 973 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  35.7 
 
 		 651 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 		 631 aa  252  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 		 846 aa  253  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000921222 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.61 
 
 		 627 aa  253  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 		 662 aa  252  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 		 865 aa  252  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 1313 aa  252  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 		 1068 aa  251  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 		 633 aa  251  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003464  signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 573 aa  251  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 764 aa  251  3e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1767  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 		 1157 aa  251  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 		 718 aa  251  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 		 969 aa  251  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.47 
 
 		 655 aa  251  5e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2513  ATP-binding region, ATPase-like  38.1 
 
 		 945 aa  250  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.543755  normal  0.160676 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.39 
 
 		 1029 aa  249  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 		 1452 aa  249  2e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  38.46 
 
 		 651 aa  249  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3044  DMSO/TMAO-sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 813 aa  248  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 		 877 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>