More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0469 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03075  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ArcA  76.18 
 
 		 778 aa  1191    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0497  multi-sensor hybrid histidine kinase  76.18 
 
 		 778 aa  1191    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3698  aerobic respiration control sensor protein ArcB  76.18 
 
 		 778 aa  1191    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  75.89 
 
 		 778 aa  1189    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0301  aerobic respiration control sensor protein ArcB  81.47 
 
 		 789 aa  1273    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0737861  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3626  aerobic respiration control sensor protein ArcB  77.34 
 
 		 778 aa  1212    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10996  normal  0.809738 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01633  aerobic respiration control sensor protein ArcB  43.9 
 
 		 784 aa  664    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  59.54 
 
 		 788 aa  916    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4342  aerobic respiration control sensor protein ArcB  87.16 
 
 		 779 aa  1375    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3688  aerobic respiration control sensor protein ArcB  77.21 
 
 		 778 aa  1208    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.739542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3590  aerobic respiration control sensor protein ArcB  77.46 
 
 		 778 aa  1212    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.571349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004463  aerobic respiration control sensor protein ArcB  59.54 
 
 		 784 aa  925    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135915  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00931  aerobic respiration control sensor protein ArcB  58.88 
 
 		 786 aa  920    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3789  aerobic respiration control sensor protein ArcB  79.51 
 
 		 779 aa  1236    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00874982  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0924  aerobic respiration control sensor protein ArcB  47.11 
 
 		 753 aa  696    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178911  normal  0.270801 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  76.18 
 
 		 778 aa  1189    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3519  aerobic respiration control sensor protein ArcB  77.46 
 
 		 778 aa  1212    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0490  aerobic respiration control sensor protein ArcB  76.18 
 
 		 778 aa  1191    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3747  aerobic respiration control sensor protein ArcB  44.94 
 
 		 781 aa  666    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.244728  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  99.87 
 
 		 778 aa  1593    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0807351  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3631  aerobic respiration control sensor protein ArcB  78.69 
 
 		 779 aa  1253    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3403  aerobic respiration control sensor protein ArcB  76.06 
 
 		 778 aa  1188    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1126  aerobic respiration control sensor protein ArcB  99.87 
 
 		 778 aa  1592    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3645  aerobic respiration control sensor protein ArcB  76.41 
 
 		 777 aa  1197    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0208563  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1948  aerobic respiration control sensor protein ArcB  59.05 
 
 		 785 aa  904    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000151303  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0469  aerobic respiration control sensor protein ArcB  100 
 
 		 778 aa  1593    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.55831  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03026  hypothetical protein  76.18 
 
 		 778 aa  1191    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3506  aerobic respiration control sensor protein ArcB  76.18 
 
 		 778 aa  1191    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.648174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3521  aerobic respiration control sensor protein ArcB  77.34 
 
 		 778 aa  1210    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0307  aerobic respiration control sensor protein ArcB  80.96 
 
 		 789 aa  1280    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0739851  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0402  sensor histidine kinase  45.35 
 
 		 618 aa  420  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.928095  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 		 965 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332193  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 1177 aa  303  8.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.67 
 
 		 1199 aa  293  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 		 882 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  32.16 
 
 		 984 aa  268  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 		 1165 aa  265  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 		 877 aa  264  4.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 		 982 aa  263  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  30.44 
 
 		 2109 aa  262  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 		 1452 aa  261  2e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 		 1204 aa  261  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.54 
 
 		 1222 aa  261  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  30.51 
 
 		 982 aa  261  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.22 
 
 		 1350 aa  259  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.63 
 
 		 873 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  32.33 
 
 		 987 aa  257  5e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 		 738 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 		 1226 aa  256  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 		 916 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 923 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  33.52 
 
 		 794 aa  254  6e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 		 1195 aa  253  7e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3044  DMSO/TMAO-sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 		 813 aa  252  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 		 767 aa  250  7e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 		 1596 aa  250  8e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.75 
 
 		 1127 aa  250  9e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 		 902 aa  250  9e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 		 1340 aa  250  9e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2934  PAS  30.77 
 
 		 955 aa  248  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 		 785 aa  248  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06119  histidine kinase  32.94 
 
 		 985 aa  248  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 		 695 aa  248  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 764 aa  248  4e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0420  PAS  31.52 
 
 		 787 aa  246  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0516903 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 		 765 aa  246  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.12 
 
 		 969 aa  246  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2101  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 678 aa  246  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.007905  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 		 772 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3325  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 667 aa  244  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 959 aa  243  7.999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0645  two component system histidine kinase  32.13 
 
 		 630 aa  243  7.999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000209128  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.74 
 
 		 780 aa  243  7.999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 		 877 aa  243  9e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.11 
 
 		 1009 aa  243  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  38.28 
 
 		 882 aa  243  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.78 
 
 		 1313 aa  243  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.16 
 
 		 827 aa  243  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.51 
 
 		 1433 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0748  putative aerobic respiration control sensor protein arcB  32.13 
 
 		 630 aa  242  2e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795042  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 		 846 aa  241  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 631 aa  241  5e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.96 
 
 		 1116 aa  240  6.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1826  sensor protein TorS  31.5 
 
 		 1000 aa  239  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.811683  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  31.47 
 
 		 968 aa  239  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.74 
 
 		 876 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.57 
 
 		 896 aa  239  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1425  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 		 1096 aa  239  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.579353  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.87 
 
 		 947 aa  239  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2475  sensor histidine kinase/response regulator  34.93 
 
 		 784 aa  239  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446979  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1355  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 895 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.02 
 
 		 846 aa  238  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.1 
 
 		 817 aa  238  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 		 604 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  30.24 
 
 		 1120 aa  237  6e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  37.03 
 
 		 661 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  35.57 
 
 		 1125 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1420  sensory box histidine kinase/response regulator  31.32 
 
 		 1199 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293149  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000354  sensor histidine kinase  32.84 
 
 		 785 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.407699  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3431  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.12 
 
 		 756 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>