More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000354 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06167  sensor protein LuxQ  59.69 
 
 		 594 aa  717    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000354  sensor histidine kinase  100 
 
 		 785 aa  1609    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.407699  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0393x  response regulator, histidine kinase  44.51 
 
 		 943 aa  433  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621999  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000536  autoinducer 2 sensor kinase/phosphatase LuxQ  37.73 
 
 		 858 aa  315  2.9999999999999996e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05352  histidine kinase  40.05 
 
 		 859 aa  311  2.9999999999999997e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003904  sensor histidine kinase  42.64 
 
 		 806 aa  307  4.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.397449  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01620  Signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 		 806 aa  306  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0930  autoinducer 2 sensor kinase/phosphatase LuxQ  41.6 
 
 		 745 aa  304  4.0000000000000003e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.407663  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0671  sensor histidine kinase LuxQ  40.05 
 
 		 857 aa  301  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1424  sensor histidine kinase  41.77 
 
 		 736 aa  301  4e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02206  hypothetical protein  41.41 
 
 		 827 aa  299  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 		 882 aa  279  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  40.11 
 
 		 651 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06164  sensor histidine kinase/response regulator fusion  63.76 
 
 		 218 aa  274  5.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2547  histidine kinase  39.01 
 
 		 698 aa  274  6e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.795977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 		 1433 aa  273  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  40.53 
 
 		 651 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 		 932 aa  273  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 631 aa  272  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.33 
 
 		 957 aa  272  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.6 
 
 		 1068 aa  270  5e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  40.05 
 
 		 1560 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.1 
 
 		 633 aa  270  8.999999999999999e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 645 aa  268  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.32 
 
 		 822 aa  268  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.8 
 
 		 1199 aa  267  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 		 1059 aa  267  5e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.84 
 
 		 827 aa  266  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  40.26 
 
 		 641 aa  266  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2835  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.75 
 
 		 964 aa  265  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.106901  decreased coverage  0.00127572 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 		 881 aa  265  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.09 
 
 		 717 aa  265  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 		 643 aa  265  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.15 
 
 		 873 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  40.16 
 
 		 645 aa  263  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 1222 aa  263  1e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.49 
 
 		 643 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  40.63 
 
 		 758 aa  263  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5254  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.55 
 
 		 579 aa  262  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601488  normal  0.0228125 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  40.36 
 
 		 984 aa  261  3e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  34.22 
 
 		 2109 aa  261  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.6 
 
 		 767 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  37.7 
 
 		 641 aa  260  6e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.59 
 
 		 643 aa  260  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3528  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.56 
 
 		 690 aa  259  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 846 aa  258  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.49 
 
 		 781 aa  257  5e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 		 923 aa  257  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 		 1195 aa  257  6e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.27 
 
 		 738 aa  256  9e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06119  histidine kinase  38.5 
 
 		 985 aa  256  9e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.93 
 
 		 785 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  33.96 
 
 		 987 aa  256  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003464  signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 573 aa  256  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 		 606 aa  256  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.07 
 
 		 940 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  38.92 
 
 		 661 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  40.05 
 
 		 853 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  39.01 
 
 		 729 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03837  Signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 		 623 aa  255  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  32.94 
 
 		 755 aa  255  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.69 
 
 		 743 aa  254  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 667 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 		 896 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 817 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 		 631 aa  254  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.09 
 
 		 962 aa  253  7e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.56 
 
 		 643 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 653 aa  252  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0460  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  40.05 
 
 		 835 aa  252  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.980587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 		 982 aa  252  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.29 
 
 		 1313 aa  252  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 		 765 aa  252  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 		 724 aa  252  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 1177 aa  252  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.94 
 
 		 1075 aa  252  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  37.56 
 
 		 759 aa  251  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.74 
 
 		 604 aa  251  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3431  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.75 
 
 		 756 aa  251  3e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.34 
 
 		 763 aa  251  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 		 1110 aa  251  4e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.45 
 
 		 959 aa  251  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.72 
 
 		 781 aa  251  5e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 		 903 aa  251  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 		 1350 aa  250  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  41.49 
 
 		 882 aa  250  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.58 
 
 		 898 aa  250  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 		 718 aa  250  7e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 780 aa  250  7e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1772  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 		 1169 aa  250  8e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.914739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 		 812 aa  249  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.15 
 
 		 1070 aa  249  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  37.29 
 
 		 1023 aa  249  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 		 827 aa  249  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3044  DMSO/TMAO-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 813 aa  249  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 674 aa  249  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.27 
 
 		 995 aa  249  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4006  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.08 
 
 		 782 aa  248  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  36.9 
 
 		 553 aa  249  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.87 
 
 		 973 aa  248  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>