More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0930 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0930  autoinducer 2 sensor kinase/phosphatase LuxQ  100 
 
 		 745 aa  1509    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.407663  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0671  sensor histidine kinase LuxQ  46.72 
 
 		 857 aa  376  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000536  autoinducer 2 sensor kinase/phosphatase LuxQ  46.94 
 
 		 858 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05352  histidine kinase  45.97 
 
 		 859 aa  372  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0393x  response regulator, histidine kinase  41.88 
 
 		 943 aa  327  5e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621999  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000354  sensor histidine kinase  41.6 
 
 		 785 aa  310  5e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.407699  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1424  sensor histidine kinase  43.75 
 
 		 736 aa  309  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02206  hypothetical protein  40.73 
 
 		 827 aa  276  8e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01620  Signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 806 aa  276  8e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003904  sensor histidine kinase  35.64 
 
 		 806 aa  273  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.397449  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 		 882 aa  270  8e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  35.89 
 
 		 631 aa  262  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 		 781 aa  257  6e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  38.86 
 
 		 736 aa  254  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  39.11 
 
 		 735 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2547  histidine kinase  35.08 
 
 		 698 aa  253  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.795977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 		 932 aa  252  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  37.67 
 
 		 732 aa  251  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 		 741 aa  250  5e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  37.6 
 
 		 606 aa  249  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 		 1350 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 827 aa  248  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  34.84 
 
 		 968 aa  248  4e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.93 
 
 		 846 aa  246  9e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 		 902 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.58 
 
 		 801 aa  245  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 		 767 aa  244  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 		 1078 aa  244  6e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 		 846 aa  243  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.92 
 
 		 923 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  35.84 
 
 		 882 aa  243  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  36.27 
 
 		 982 aa  242  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.41 
 
 		 1433 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 1222 aa  242  2e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2521  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 		 597 aa  241  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  34.6 
 
 		 742 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0658  histidine kinase  34.17 
 
 		 627 aa  241  4e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 1120 aa  241  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  37.84 
 
 		 751 aa  240  6.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.72 
 
 		 873 aa  240  8e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 		 765 aa  240  9e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.44 
 
 		 1596 aa  239  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 		 995 aa  239  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  34.78 
 
 		 835 aa  239  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.79 
 
 		 717 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 827 aa  238  3e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1934  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 		 1015 aa  238  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.452261  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02676  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 		 847 aa  237  5.0000000000000005e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 		 1005 aa  237  6e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 		 902 aa  236  8e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 		 874 aa  237  8e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003464  signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 573 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.97 
 
 		 785 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 645 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 		 1199 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0852  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 		 859 aa  236  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.86 
 
 		 868 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1601  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 		 685 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0518398  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.81 
 
 		 667 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 		 1791 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  34.41 
 
 		 553 aa  235  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3693  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 602 aa  235  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.37 
 
 		 880 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 		 643 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0206  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 		 771 aa  234  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 		 653 aa  234  5e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 		 738 aa  234  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.72 
 
 		 969 aa  234  5e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.74 
 
 		 764 aa  234  5e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4471  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 		 627 aa  234  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.611462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  35.82 
 
 		 1023 aa  234  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  37.63 
 
 		 578 aa  234  6e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.97 
 
 		 822 aa  233  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.87 
 
 		 781 aa  233  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 		 643 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 		 959 aa  232  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1195 aa  232  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2127  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 		 815 aa  232  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3563  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.92 
 
 		 1023 aa  232  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 		 791 aa  232  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2964  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 647 aa  231  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.443547 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.01 
 
 		 1229 aa  231  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 		 606 aa  231  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.58 
 
 		 957 aa  231  5e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 		 1771 aa  231  5e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  37.6 
 
 		 984 aa  231  5e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 		 870 aa  230  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3474  ATP-binding region ATPase domain protein  36.49 
 
 		 706 aa  230  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 		 778 aa  230  6e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 		 1767 aa  230  7e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 		 1767 aa  230  7e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.68 
 
 		 1331 aa  230  7e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0973  histidine kinase  37.19 
 
 		 733 aa  230  8e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000797186 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 780 aa  230  8e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  34.64 
 
 		 1346 aa  230  9e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 		 1027 aa  230  9e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.98 
 
 		 1358 aa  229  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 		 862 aa  229  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06167  sensor protein LuxQ  38.04 
 
 		 594 aa  229  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0542  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 1302 aa  229  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>