More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02206 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02206  hypothetical protein  100 
 
 		 827 aa  1694    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0393x  response regulator, histidine kinase  41.9 
 
 		 943 aa  440  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621999  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.41 
 
 		 827 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.4 
 
 		 781 aa  317  9e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000382  putative sensory box sensor histidine kinase/response regulator  43.75 
 
 		 873 aa  312  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3431  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 		 756 aa  311  4e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  34.45 
 
 		 810 aa  308  2.0000000000000002e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1424  sensor histidine kinase  41.42 
 
 		 736 aa  303  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000354  sensor histidine kinase  41.41 
 
 		 785 aa  299  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.407699  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 		 1313 aa  297  5e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 		 846 aa  290  5.0000000000000004e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 		 791 aa  290  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 		 959 aa  288  4e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  34.15 
 
 		 1560 aa  287  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003904  sensor histidine kinase  41.84 
 
 		 806 aa  287  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.397449  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 		 902 aa  286  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01620  Signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 		 806 aa  285  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 		 866 aa  280  9e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  35.67 
 
 		 797 aa  279  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 		 674 aa  277  6e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 1029 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 		 1407 aa  273  7e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  38.37 
 
 		 553 aa  270  5e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 		 803 aa  269  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2547  histidine kinase  40.21 
 
 		 698 aa  267  7e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.795977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 1075 aa  267  7e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0930  autoinducer 2 sensor kinase/phosphatase LuxQ  40.73 
 
 		 745 aa  266  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.407663  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.39 
 
 		 926 aa  265  4e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 		 873 aa  264  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 		 1313 aa  263  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000536  autoinducer 2 sensor kinase/phosphatase LuxQ  32.83 
 
 		 858 aa  262  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  32.52 
 
 		 606 aa  262  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5254  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 		 579 aa  262  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601488  normal  0.0228125 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05352  histidine kinase  32.95 
 
 		 859 aa  260  8e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  38.14 
 
 		 968 aa  260  9e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 1078 aa  259  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  36.32 
 
 		 571 aa  259  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.45 
 
 		 874 aa  259  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 		 1064 aa  259  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.14 
 
 		 763 aa  258  4e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.72 
 
 		 1055 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  38.26 
 
 		 631 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  37.15 
 
 		 559 aa  256  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.49 
 
 		 898 aa  255  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 		 767 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4006  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.26 
 
 		 782 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0671  sensor histidine kinase LuxQ  30.66 
 
 		 857 aa  254  5.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 		 1033 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 		 1287 aa  254  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.84 
 
 		 969 aa  254  6e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 1116 aa  253  7e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 		 902 aa  253  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 		 911 aa  253  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  36.07 
 
 		 982 aa  252  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.88 
 
 		 927 aa  252  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.76 
 
 		 868 aa  252  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 		 863 aa  250  6e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 		 1452 aa  250  6e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 		 876 aa  250  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.9 
 
 		 1070 aa  250  7e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.57 
 
 		 780 aa  250  7e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2396  histidine kinase  36.21 
 
 		 539 aa  249  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106517 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  38.82 
 
 		 755 aa  249  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2521  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.78 
 
 		 597 aa  248  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 		 1596 aa  248  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 		 1120 aa  248  4e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0973  histidine kinase  38.42 
 
 		 733 aa  248  4e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000797186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0659  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 		 570 aa  247  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 		 869 aa  248  4.9999999999999997e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  33.33 
 
 		 853 aa  247  6.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 		 1203 aa  247  6.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 877 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 		 881 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.47 
 
 		 582 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 		 1350 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  34.17 
 
 		 1028 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 		 862 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 877 aa  244  3e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2895  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 		 1324 aa  245  3e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000343468  normal  0.0609683 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 		 631 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  38.69 
 
 		 1626 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3747  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.51 
 
 		 781 aa  244  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.244728  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 1788 aa  244  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 		 965 aa  244  6e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332193  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 		 772 aa  244  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0331  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.71 
 
 		 955 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.383184 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.82 
 
 		 772 aa  243  9e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2774  histidine kinase  33.58 
 
 		 761 aa  243  9e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  38.16 
 
 		 984 aa  243  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06167  sensor protein LuxQ  40.29 
 
 		 594 aa  243  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  37.53 
 
 		 1179 aa  243  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 		 1195 aa  243  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 		 738 aa  243  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 		 1059 aa  243  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3693  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 		 602 aa  242  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 		 1433 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0490  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.3 
 
 		 778 aa  241  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.3 
 
 		 778 aa  241  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3506  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.3 
 
 		 778 aa  241  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.648174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03026  hypothetical protein  32.3 
 
 		 778 aa  241  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>