More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003904 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003904  sensor histidine kinase  100 
 
 		 806 aa  1664    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.397449  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1424  sensor histidine kinase  55.43 
 
 		 736 aa  835    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01620  Signal transduction histidine kinase  73.88 
 
 		 806 aa  1246    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0393x  response regulator, histidine kinase  42.15 
 
 		 943 aa  323  8e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621999  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000354  sensor histidine kinase  42.64 
 
 		 785 aa  307  4.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.407699  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0671  sensor histidine kinase LuxQ  39.95 
 
 		 857 aa  308  4.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02206  hypothetical protein  41.84 
 
 		 827 aa  287  5e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0659  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.32 
 
 		 570 aa  273  6e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  39.74 
 
 		 553 aa  271  4e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0930  autoinducer 2 sensor kinase/phosphatase LuxQ  37.53 
 
 		 745 aa  270  8e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.407663  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000536  autoinducer 2 sensor kinase/phosphatase LuxQ  37.7 
 
 		 858 aa  265  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4471  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.74 
 
 		 627 aa  261  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.611462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05352  histidine kinase  37.43 
 
 		 859 aa  261  4e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.39 
 
 		 738 aa  259  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.28 
 
 		 898 aa  259  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.35 
 
 		 1433 aa  258  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.86 
 
 		 822 aa  258  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 		 781 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 		 765 aa  254  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 969 aa  254  5.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  37.87 
 
 		 968 aa  253  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 		 643 aa  253  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 		 743 aa  252  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 		 846 aa  252  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  35.17 
 
 		 651 aa  252  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03837  Signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 623 aa  252  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  37.44 
 
 		 729 aa  252  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  38.98 
 
 		 631 aa  251  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.83 
 
 		 1068 aa  251  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2396  histidine kinase  36.2 
 
 		 539 aa  251  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106517 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2108  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.21 
 
 		 924 aa  251  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.154995  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 		 643 aa  251  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 631 aa  251  5e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  38.58 
 
 		 606 aa  250  8e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 		 643 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.53 
 
 		 582 aa  248  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.95 
 
 		 959 aa  248  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 		 741 aa  248  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5254  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.87 
 
 		 579 aa  248  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601488  normal  0.0228125 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1355  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.21 
 
 		 895 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.72 
 
 		 995 aa  248  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  38.13 
 
 		 666 aa  248  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 		 674 aa  248  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 		 643 aa  248  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 		 780 aa  248  4e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2127  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.11 
 
 		 815 aa  247  4.9999999999999997e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 		 1691 aa  247  6e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 		 827 aa  247  6.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 589 aa  246  8e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0113735 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  33.01 
 
 		 1001 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.22 
 
 		 1195 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3693  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 		 602 aa  246  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.58 
 
 		 873 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 		 1199 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 		 645 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  36.46 
 
 		 987 aa  244  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 		 633 aa  245  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 		 1177 aa  245  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 		 759 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 		 667 aa  244  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.54 
 
 		 903 aa  244  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0460  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.62 
 
 		 835 aa  243  9e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.980587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  33.19 
 
 		 641 aa  243  9e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 982 aa  243  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  37.07 
 
 		 651 aa  243  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 		 876 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2547  histidine kinase  38.96 
 
 		 698 aa  242  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.795977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.93 
 
 		 853 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 		 973 aa  241  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 		 846 aa  241  5e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 		 781 aa  241  5e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06167  sensor protein LuxQ  39.88 
 
 		 594 aa  241  5.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.18 
 
 		 724 aa  240  6.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  37.19 
 
 		 835 aa  240  8e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.17 
 
 		 631 aa  240  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  33.98 
 
 		 661 aa  239  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 874 aa  239  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2708  sensor hybrid histidine kinase  38.96 
 
 		 530 aa  240  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1314  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.5 
 
 		 573 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  35.95 
 
 		 1763 aa  239  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 		 901 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.135172  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2835  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.66 
 
 		 964 aa  239  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.106901  decreased coverage  0.00127572 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 		 1116 aa  239  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.5 
 
 		 767 aa  239  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.8 
 
 		 863 aa  238  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  35.59 
 
 		 982 aa  238  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 		 866 aa  238  4e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 		 902 aa  238  5.0000000000000005e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0852  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 		 859 aa  238  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.237693 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0221  histidine kinase  37.1 
 
 		 476 aa  238  5.0000000000000005e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.641728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 		 572 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.12 
 
 		 957 aa  237  6e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 		 1075 aa  237  7e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 		 940 aa  237  8e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 		 968 aa  237  8e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  36.78 
 
 		 2109 aa  237  8e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.73 
 
 		 718 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  34.87 
 
 		 984 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 		 738 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0206  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.34 
 
 		 771 aa  236  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>