More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06167 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06167  sensor protein LuxQ  100 
 
 		 594 aa  1221    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000354  sensor histidine kinase  59.69 
 
 		 785 aa  717    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.407699  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0393x  response regulator, histidine kinase  42.49 
 
 		 943 aa  286  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621999  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  40.71 
 
 		 651 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000536  autoinducer 2 sensor kinase/phosphatase LuxQ  37.58 
 
 		 858 aa  249  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01620  Signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 		 806 aa  249  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.93 
 
 		 846 aa  244  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  39.82 
 
 		 651 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0671  sensor histidine kinase LuxQ  39.04 
 
 		 857 aa  244  5e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05352  histidine kinase  37.97 
 
 		 859 aa  243  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02206  hypothetical protein  40.29 
 
 		 827 aa  243  7e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003904  sensor histidine kinase  39.88 
 
 		 806 aa  241  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.397449  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.61 
 
 		 717 aa  240  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 		 631 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 		 633 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.6 
 
 		 882 aa  237  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2547  histidine kinase  40.94 
 
 		 698 aa  234  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.795977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5254  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.74 
 
 		 579 aa  234  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601488  normal  0.0228125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.5 
 
 		 643 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.29 
 
 		 973 aa  231  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1424  sensor histidine kinase  38.62 
 
 		 736 aa  231  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.91 
 
 		 1199 aa  229  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.54 
 
 		 881 aa  229  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  38.02 
 
 		 645 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  38.23 
 
 		 882 aa  228  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  41.21 
 
 		 641 aa  227  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  41.62 
 
 		 631 aa  226  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.83 
 
 		 743 aa  226  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.49 
 
 		 785 aa  226  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  37.72 
 
 		 641 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.88 
 
 		 643 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  40.06 
 
 		 729 aa  225  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  38.48 
 
 		 661 aa  224  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2835  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.09 
 
 		 964 aa  224  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.106901  decreased coverage  0.00127572 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.65 
 
 		 982 aa  224  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  39 
 
 		 704 aa  224  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.95 
 
 		 1059 aa  224  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  39.04 
 
 		 984 aa  224  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1277  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.94 
 
 		 811 aa  223  6e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  35.71 
 
 		 666 aa  223  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  38.99 
 
 		 952 aa  223  7e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 		 643 aa  223  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.19 
 
 		 957 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 		 923 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 		 645 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0930  autoinducer 2 sensor kinase/phosphatase LuxQ  38.04 
 
 		 745 aa  222  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.407663  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 		 1433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.05 
 
 		 1003 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.57 
 
 		 643 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.74 
 
 		 995 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.88 
 
 		 932 aa  221  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.06 
 
 		 896 aa  221  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.18 
 
 		 767 aa  221  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.63 
 
 		 1070 aa  220  5e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 		 765 aa  220  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  35.28 
 
 		 1175 aa  220  6e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 		 780 aa  220  6e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.96 
 
 		 959 aa  220  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  36.29 
 
 		 553 aa  219  7.999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 		 969 aa  219  7.999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  37.43 
 
 		 1560 aa  219  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  42.47 
 
 		 1346 aa  219  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  39 
 
 		 1310 aa  219  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  42.63 
 
 		 968 aa  217  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.69 
 
 		 772 aa  217  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.51 
 
 		 1369 aa  217  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 		 738 aa  217  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.17 
 
 		 659 aa  217  5e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  38.36 
 
 		 988 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  38.36 
 
 		 1032 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  38.36 
 
 		 1014 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.51 
 
 		 631 aa  216  8e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.57 
 
 		 1771 aa  216  8e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  40.78 
 
 		 578 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.01 
 
 		 866 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  39.69 
 
 		 853 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003464  signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 573 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 		 957 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.57 
 
 		 1767 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  37.61 
 
 		 1023 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 		 833 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 		 873 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.26 
 
 		 1767 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.76 
 
 		 781 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  39 
 
 		 785 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.87 
 
 		 916 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.83 
 
 		 1109 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  36.8 
 
 		 1763 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.26 
 
 		 1767 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4006  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.27 
 
 		 782 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1772  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 		 1169 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.914739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 		 1768 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 		 1118 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.13 
 
 		 873 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.94 
 
 		 817 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0206  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.24 
 
 		 771 aa  214  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.35 
 
 		 604 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  38.05 
 
 		 758 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0460  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.26 
 
 		 835 aa  213  7e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.980587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.51 
 
 		 803 aa  213  7.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>