More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3345 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3365  multi-sensor hybrid histidine kinase  58.46 
 
 		 1009 aa  1039    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1230  sensor histidine kinase/response regulator TorS  51.59 
 
 		 1025 aa  893    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3354  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.41 
 
 		 1020 aa  880    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3345  Hpt sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1038 aa  2094    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1152  Hpt sensor hybrid histidine kinase  51.01 
 
 		 1025 aa  880    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3532  multi-sensor hybrid histidine kinase  57.43 
 
 		 996 aa  1020    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.403445 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2801  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.74 
 
 		 1041 aa  892    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3215  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.91 
 
 		 1030 aa  869    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1049  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.06 
 
 		 1017 aa  887    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1114  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.3 
 
 		 1017 aa  892    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1992  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.25 
 
 		 999 aa  964    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.721903  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.33 
 
 		 1017 aa  883    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.94198 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3215  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.21 
 
 		 1020 aa  875    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0985  sensor histidine kinase/response regulator TorS  43.21 
 
 		 973 aa  674    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.374582 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  30.38 
 
 		 984 aa  347  7e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1826  sensor protein TorS  29.92 
 
 		 1000 aa  340  9.999999999999999e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.811683  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  28.38 
 
 		 987 aa  308  3e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06119  histidine kinase  27.92 
 
 		 985 aa  307  6e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2131  response regulator, histidine kinase  30.08 
 
 		 958 aa  294  7e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.739788  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 		 817 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 		 903 aa  214  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2051  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 		 1007 aa  214  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.442026  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  34.24 
 
 		 751 aa  213  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3789  aerobic respiration control sensor protein ArcB  31.28 
 
 		 779 aa  213  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00874982  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3747  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.64 
 
 		 781 aa  211  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.244728  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  35.58 
 
 		 1179 aa  210  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.35 
 
 		 846 aa  209  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.64 
 
 		 606 aa  209  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1229  hybrid sensory histidine kinase TorS  29.03 
 
 		 904 aa  206  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0346249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3242  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.63 
 
 		 980 aa  206  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1277  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 		 811 aa  206  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 		 1158 aa  206  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 		 1199 aa  206  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.79 
 
 		 743 aa  205  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 631 aa  205  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1110  hybrid sensory histidine kinase TorS  28.27 
 
 		 914 aa  204  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00372691  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2321  hybrid sensory histidine kinase TorS  28.57 
 
 		 914 aa  204  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00396933  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2131  hybrid sensory histidine kinase TorS  28.29 
 
 		 900 aa  204  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 781 aa  203  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0307  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.51 
 
 		 789 aa  203  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0739851  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 		 601 aa  203  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  32.96 
 
 		 968 aa  202  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.88 
 
 		 916 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01633  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.63 
 
 		 784 aa  201  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2602  hybrid sensory histidine kinase TorS  28.42 
 
 		 904 aa  201  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 		 1350 aa  201  9e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00996  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with TorR  28.42 
 
 		 914 aa  200  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.458275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2649  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 		 899 aa  200  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0141024  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1104  hybrid sensory histidine kinase TorS  28.42 
 
 		 914 aa  200  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01003  hypothetical protein  28.42 
 
 		 914 aa  200  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.624093  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.03 
 
 		 1442 aa  199  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.36 
 
 		 1287 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  30.94 
 
 		 793 aa  199  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.08 
 
 		 1120 aa  199  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 		 724 aa  198  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 		 765 aa  198  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3631  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.07 
 
 		 779 aa  198  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330412  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 		 674 aa  198  5.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.89 
 
 		 764 aa  198  5.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65860  putative two-component sensor  33.04 
 
 		 770 aa  197  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.407883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 1005 aa  197  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2475  sensor histidine kinase/response regulator  28.91 
 
 		 784 aa  197  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446979  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.79 
 
 		 932 aa  197  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5715  putative two-component sensor  33.04 
 
 		 750 aa  197  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.901003  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  30.2 
 
 		 2109 aa  196  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3728  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 		 750 aa  195  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2617  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 		 554 aa  195  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  34.81 
 
 		 1028 aa  195  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2178  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.97 
 
 		 750 aa  195  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00477296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0301  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.02 
 
 		 789 aa  194  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0737861  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 		 969 aa  194  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2504  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 		 1132 aa  195  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.72 
 
 		 1309 aa  194  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.5 
 
 		 778 aa  194  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  31.97 
 
 		 835 aa  194  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.78 
 
 		 667 aa  193  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.68 
 
 		 778 aa  193  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3403  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.68 
 
 		 778 aa  193  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.02 
 
 		 1691 aa  193  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.88 
 
 		 1059 aa  194  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03075  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ArcA  29.68 
 
 		 778 aa  193  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0497  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.68 
 
 		 778 aa  193  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03026  hypothetical protein  29.68 
 
 		 778 aa  193  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3698  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.68 
 
 		 778 aa  193  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3506  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.68 
 
 		 778 aa  193  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.648174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0490  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.68 
 
 		 778 aa  193  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 		 896 aa  192  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1574  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 841 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 		 864 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  33.72 
 
 		 2051 aa  192  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.79 
 
 		 929 aa  192  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 		 1350 aa  191  5.999999999999999e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 		 827 aa  191  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 		 940 aa  191  9e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4342  aerobic respiration control sensor protein ArcB  29.38 
 
 		 779 aa  190  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 973 aa  190  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 		 1433 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 		 1313 aa  189  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2667  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 		 737 aa  190  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.149434  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 		 874 aa  189  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>