More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4054 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00996  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with TorR  62.22 
 
 		 914 aa  1072    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.458275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2649  Hpt sensor hybrid histidine kinase  61.87 
 
 		 899 aa  1073    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0141024  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4158  hybrid sensory histidine kinase TorS  99.33 
 
 		 895 aa  1800    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.315093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01003  hypothetical protein  62.22 
 
 		 914 aa  1072    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.624093  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2321  hybrid sensory histidine kinase TorS  61.87 
 
 		 914 aa  1073    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00396933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2602  hybrid sensory histidine kinase TorS  62.22 
 
 		 904 aa  1072    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1110  hybrid sensory histidine kinase TorS  62.44 
 
 		 914 aa  1076    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00372691  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1229  hybrid sensory histidine kinase TorS  62.33 
 
 		 904 aa  1075    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0346249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4109  hybrid sensory histidine kinase TorS  99.33 
 
 		 895 aa  1799    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4037  hybrid sensory histidine kinase TorS  99.33 
 
 		 895 aa  1798    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1104  hybrid sensory histidine kinase TorS  62.22 
 
 		 914 aa  1073    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2131  hybrid sensory histidine kinase TorS  62.33 
 
 		 900 aa  1073    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4216  hybrid sensory histidine kinase TorS  98.99 
 
 		 895 aa  1790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4054  hybrid sensory histidine kinase TorS  100 
 
 		 923 aa  1885    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  32.84 
 
 		 984 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  31.19 
 
 		 987 aa  378  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2131  response regulator, histidine kinase  30.58 
 
 		 958 aa  352  3e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.739788  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06119  histidine kinase  29.59 
 
 		 985 aa  345  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1826  sensor protein TorS  32.41 
 
 		 1000 aa  335  3e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.811683  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 		 835 aa  244  6e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3242  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.81 
 
 		 980 aa  239  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0202  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 781 aa  238  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.01 
 
 		 1059 aa  230  9e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  36.71 
 
 		 1407 aa  228  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  38.42 
 
 		 1135 aa  223  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0654  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 		 934 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  34.3 
 
 		 2109 aa  223  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 		 923 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2667  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 		 737 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.149434  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 		 921 aa  222  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2178  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.37 
 
 		 750 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00477296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 631 aa  220  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 789 aa  219  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  35.19 
 
 		 1346 aa  219  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3728  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 		 750 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 		 1127 aa  217  8e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  31.23 
 
 		 793 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2035  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 		 750 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.03 
 
 		 977 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2774  histidine kinase  35.23 
 
 		 761 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 		 827 aa  214  7e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2051  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.23 
 
 		 1007 aa  213  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.442026  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  34.08 
 
 		 1001 aa  213  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0985  sensor histidine kinase/response regulator TorS  28.14 
 
 		 973 aa  212  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.374582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 		 1350 aa  212  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 		 643 aa  212  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 912 aa  212  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  33.33 
 
 		 810 aa  212  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 		 1363 aa  212  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  32.22 
 
 		 910 aa  211  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 		 1118 aa  211  4e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 1195 aa  211  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0206  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 		 771 aa  211  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 		 1240 aa  211  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  36.64 
 
 		 661 aa  211  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  34.83 
 
 		 1287 aa  211  7e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 		 873 aa  210  8e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 		 846 aa  210  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 		 633 aa  210  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 		 877 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1287 aa  210  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2396  histidine kinase  36.27 
 
 		 539 aa  210  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106517 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 		 817 aa  209  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 		 627 aa  209  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 		 1397 aa  209  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 		 864 aa  209  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 		 957 aa  208  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  34.06 
 
 		 651 aa  208  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  34.38 
 
 		 923 aa  208  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 973 aa  208  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.83 
 
 		 1267 aa  207  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  35.03 
 
 		 759 aa  207  6e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  33.53 
 
 		 882 aa  207  9e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.8 
 
 		 1820 aa  207  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0015  histidine kinase  37.15 
 
 		 868 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.461208 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 		 1069 aa  206  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 		 944 aa  207  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4481  sensor histidine kinase/response regulator  31.41 
 
 		 982 aa  206  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  34.05 
 
 		 631 aa  206  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 		 916 aa  206  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 1284 aa  206  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1114  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 		 1017 aa  206  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 1202 aa  206  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  30.8 
 
 		 751 aa  205  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 		 866 aa  205  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 		 1369 aa  205  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2475  sensor histidine kinase/response regulator  29.2 
 
 		 784 aa  205  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446979  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.56 
 
 		 695 aa  204  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1049  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.75 
 
 		 1017 aa  205  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.1 
 
 		 1788 aa  205  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  37.41 
 
 		 900 aa  204  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.3 
 
 		 1128 aa  204  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 		 1240 aa  204  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 		 816 aa  204  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 		 631 aa  204  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  32.25 
 
 		 835 aa  203  9e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.93 
 
 		 705 aa  203  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 		 758 aa  204  9e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.06 
 
 		 833 aa  203  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.72 
 
 		 868 aa  203  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>