More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4216 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00996  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with TorR  62.11 
 
 		 914 aa  1063    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.458275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1104  hybrid sensory histidine kinase TorS  62.11 
 
 		 914 aa  1063    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2649  Hpt sensor hybrid histidine kinase  62.11 
 
 		 899 aa  1064    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0141024  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4109  hybrid sensory histidine kinase TorS  99.11 
 
 		 895 aa  1805    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.551512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4158  hybrid sensory histidine kinase TorS  99.22 
 
 		 895 aa  1809    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.315093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4054  hybrid sensory histidine kinase TorS  98.99 
 
 		 923 aa  1790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4216  hybrid sensory histidine kinase TorS  100 
 
 		 895 aa  1827    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2602  hybrid sensory histidine kinase TorS  62.11 
 
 		 904 aa  1063    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1110  hybrid sensory histidine kinase TorS  62.33 
 
 		 914 aa  1068    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00372691  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01003  hypothetical protein  62.11 
 
 		 914 aa  1063    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.624093  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2321  hybrid sensory histidine kinase TorS  62.11 
 
 		 914 aa  1064    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00396933  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2131  hybrid sensory histidine kinase TorS  62.22 
 
 		 900 aa  1066    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4037  hybrid sensory histidine kinase TorS  98.99 
 
 		 895 aa  1805    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1229  hybrid sensory histidine kinase TorS  62.22 
 
 		 904 aa  1069    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0346249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  31.39 
 
 		 987 aa  386  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  33.05 
 
 		 984 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2131  response regulator, histidine kinase  31.18 
 
 		 958 aa  355  2e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.739788  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06119  histidine kinase  30 
 
 		 985 aa  352  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1826  sensor protein TorS  32.08 
 
 		 1000 aa  334  3e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.811683  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 		 835 aa  239  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0202  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 		 781 aa  237  9e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3242  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 		 980 aa  233  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 		 923 aa  229  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.74 
 
 		 1059 aa  228  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0654  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 		 934 aa  226  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  37.37 
 
 		 1407 aa  225  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  38.42 
 
 		 1135 aa  223  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  33.85 
 
 		 2109 aa  222  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 631 aa  222  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 		 921 aa  220  7.999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3728  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.06 
 
 		 750 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2178  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.82 
 
 		 750 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00477296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2774  histidine kinase  35.23 
 
 		 761 aa  218  4e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2667  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 		 737 aa  217  5.9999999999999996e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.149434  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.73 
 
 		 1363 aa  218  5.9999999999999996e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.31 
 
 		 789 aa  217  7e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.12 
 
 		 1127 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.28 
 
 		 1350 aa  217  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0985  sensor histidine kinase/response regulator TorS  29.57 
 
 		 973 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.374582 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2035  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.72 
 
 		 750 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 		 1195 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 		 643 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 		 864 aa  213  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  31.06 
 
 		 793 aa  213  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  33.88 
 
 		 1001 aa  213  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  36.43 
 
 		 661 aa  213  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  34.72 
 
 		 1346 aa  212  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 		 846 aa  212  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.03 
 
 		 977 aa  213  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 		 827 aa  212  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 		 973 aa  212  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2051  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.48 
 
 		 1007 aa  212  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.442026  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  33.26 
 
 		 810 aa  211  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 		 912 aa  211  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 		 873 aa  211  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0015  histidine kinase  37.78 
 
 		 868 aa  211  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.461208 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.8 
 
 		 633 aa  211  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1114  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.98 
 
 		 1017 aa  211  6e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  34.83 
 
 		 1287 aa  210  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 		 1267 aa  210  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 		 627 aa  210  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 		 1118 aa  209  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1049  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 		 1017 aa  209  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.6 
 
 		 817 aa  209  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 		 877 aa  208  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  30.81 
 
 		 751 aa  208  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.28 
 
 		 1202 aa  208  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.06 
 
 		 1442 aa  208  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  33.4 
 
 		 882 aa  208  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2396  histidine kinase  36.02 
 
 		 539 aa  208  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.106517 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  32.02 
 
 		 910 aa  207  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  38.04 
 
 		 900 aa  207  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0206  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 771 aa  207  9e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 		 1017 aa  207  9e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.94198 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 		 1240 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  35.03 
 
 		 759 aa  206  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.26 
 
 		 1820 aa  206  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.56 
 
 		 695 aa  206  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 		 916 aa  205  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 		 631 aa  205  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  33.9 
 
 		 631 aa  205  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 		 1284 aa  205  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 957 aa  205  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4481  sensor histidine kinase/response regulator  31.41 
 
 		 982 aa  205  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  34.69 
 
 		 923 aa  205  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 		 1165 aa  204  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 		 1069 aa  205  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1152  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 		 1025 aa  204  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 		 1369 aa  204  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.1 
 
 		 1788 aa  204  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  32.42 
 
 		 835 aa  204  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.06 
 
 		 880 aa  204  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1230  sensor histidine kinase/response regulator TorS  29.22 
 
 		 1025 aa  203  9e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.28 
 
 		 866 aa  204  9e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 		 1397 aa  203  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 		 944 aa  203  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.98 
 
 		 1240 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2475  sensor histidine kinase/response regulator  29.2 
 
 		 784 aa  202  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446979  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 		 1287 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3207  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 		 910 aa  202  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>