More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2100 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2100  two-component sensor protein  100 
 
 		 1211 aa  2456    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  0.142111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  75.15 
 
 		 1201 aa  1767    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278595  normal  0.0196406 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1482  sensory box histidine kinase/response regulator  36.45 
 
 		 1213 aa  667    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2326  extracellular solute-binding protein/sensory box protein  52.94 
 
 		 751 aa  745    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163187  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1292  PAS  35.91 
 
 		 1209 aa  655    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.746783 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2113  PAS  50.5 
 
 		 1206 aa  1139    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.819255  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0303  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.03 
 
 		 1196 aa  717    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.723835  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1612  histidine kinase  89.09 
 
 		 448 aa  779    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.786857  normal  0.263527 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3975  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.05 
 
 		 1214 aa  1198    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3639  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  98.02 
 
 		 1210 aa  2331    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.847136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1162  two-component sensor  39.51 
 
 		 1215 aa  760    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0173  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.03 
 
 		 1191 aa  708    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12820  two-component sensor  40.47 
 
 		 1212 aa  740    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1642  putative PAS/PAC sensor protein  85.82 
 
 		 796 aa  1335    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0928458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1420  sensory box histidine kinase/response regulator  33.45 
 
 		 1199 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24720  putative two-component sensor  47.22 
 
 		 741 aa  522  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2094  virulence sensor protein BvgS  48.8 
 
 		 691 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5710  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase (bvgS-like)  33.49 
 
 		 1040 aa  489  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2739  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  28.45 
 
 		 1197 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.485487  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2520  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  28.98 
 
 		 1127 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2507  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  28.56 
 
 		 1197 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0203632  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02280  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  28.56 
 
 		 1197 aa  465  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1287  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.56 
 
 		 1197 aa  465  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2657  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  28.49 
 
 		 1197 aa  464  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02241  hypothetical protein  28.56 
 
 		 1197 aa  465  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1299  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  28.56 
 
 		 1197 aa  465  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3601  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  28.48 
 
 		 1127 aa  463  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.317303 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2161  sensor histidine kinase/response regulator  29.76 
 
 		 1286 aa  451  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2316  sensor histidine kinase/response regulator  46.19 
 
 		 477 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.857648  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2782  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.82 
 
 		 1091 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1864  Hpt sensor hybrid histidine kinase  47.88 
 
 		 1069 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3413  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.92 
 
 		 1093 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.464366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2349  Hpt sensor hybrid histidine kinase  45.7 
 
 		 1093 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0868194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2527  Hpt sensor hybrid histidine kinase  45.97 
 
 		 1090 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120042  normal  0.0845157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 		 1165 aa  340  7e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.77 
 
 		 1199 aa  338  3.9999999999999995e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.12 
 
 		 1410 aa  328  5e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.95 
 
 		 1788 aa  322  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4472  PAS  41.05 
 
 		 679 aa  318  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.185936  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 		 1049 aa  291  7e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4410  virulence sensor protein BvgS  43.26 
 
 		 948 aa  285  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 		 1611 aa  277  8e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30700  putative sensor/response regulator hybrid  40.94 
 
 		 992 aa  272  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.716544  hitchhiker  0.000396049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 		 1622 aa  271  8e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2957  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.56 
 
 		 810 aa  268  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0107  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 774 aa  263  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 		 882 aa  261  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 		 1127 aa  258  5e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.03 
 
 		 877 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 		 916 aa  257  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.96 
 
 		 781 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  37.41 
 
 		 968 aa  253  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  39.1 
 
 		 882 aa  253  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.4 
 
 		 772 aa  253  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.95 
 
 		 1029 aa  253  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0062  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 		 807 aa  251  5e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.78 
 
 		 1055 aa  250  9e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 		 1003 aa  249  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  33.1 
 
 		 1763 aa  249  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2140  fused multi-sensor protein  34.06 
 
 		 882 aa  248  4e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.236911  normal  0.359885 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  37.91 
 
 		 1032 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 		 1002 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  37.91 
 
 		 1014 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.71 
 
 		 1433 aa  246  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 		 1363 aa  245  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  37.19 
 
 		 952 aa  245  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.07 
 
 		 1195 aa  245  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  37.66 
 
 		 988 aa  244  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 		 606 aa  244  7e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 		 1768 aa  244  9e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  33.33 
 
 		 606 aa  244  9e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 		 913 aa  244  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 		 1255 aa  244  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 		 741 aa  243  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 		 1116 aa  242  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0620  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 		 645 aa  242  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 		 643 aa  241  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.38 
 
 		 817 aa  241  6.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.28 
 
 		 1340 aa  241  8e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.26 
 
 		 1767 aa  241  8e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  32.49 
 
 		 1030 aa  241  9e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1285  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.22 
 
 		 1070 aa  240  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.102629  normal  0.010179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4228  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.22 
 
 		 1011 aa  240  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.22 
 
 		 582 aa  240  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  38.56 
 
 		 651 aa  240  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 		 803 aa  240  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 		 1765 aa  239  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2187  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 705 aa  238  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  30.95 
 
 		 1331 aa  238  5.0000000000000005e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2790  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 		 592 aa  238  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0688167 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 		 1287 aa  238  6e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 		 1075 aa  238  6e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  38.86 
 
 		 651 aa  238  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  37.8 
 
 		 982 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 1767 aa  237  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 1767 aa  237  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1407 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5216  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.97 
 
 		 1001 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 		 995 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.34 
 
 		 1177 aa  236  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>