More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4119 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1331 aa  2729    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3055  putative PAS/PAC sensor protein  90.04 
 
 
561 aa  1003    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.618146  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.33 
 
 
708 aa  544  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.91 
 
 
1808 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.36 
 
 
1002 aa  518  1.0000000000000001e-145  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.28 
 
 
1297 aa  502  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.69 
 
 
1330 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 
1391 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.6 
 
 
1478 aa  486  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.43 
 
 
1501 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.52 
 
 
934 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.6 
 
 
796 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.86 
 
 
680 aa  470  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  61.62 
 
 
1548 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.65 
 
 
696 aa  452  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.125145  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.47 
 
 
720 aa  445  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.46 
 
 
1557 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  57.22 
 
 
1431 aa  424  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.24 
 
 
1068 aa  426  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.57 
 
 
628 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.08 
 
 
865 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.53 
 
 
1419 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.62 
 
 
1965 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.23 
 
 
1184 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  53.05 
 
 
701 aa  413  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.38 
 
 
889 aa  405  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.95 
 
 
1645 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.35 
 
 
1287 aa  398  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.3 
 
 
955 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1492  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.04 
 
 
606 aa  392  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.07 
 
 
882 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  50.59 
 
 
1407 aa  388  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 
1185 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  49.51 
 
 
1399 aa  369  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3018  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.91 
 
 
653 aa  366  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697975  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1191  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  46.55 
 
 
697 aa  350  9e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604254  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  39.2 
 
 
678 aa  350  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 
678 aa  347  7e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 
631 aa  347  8.999999999999999e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1870  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.62 
 
 
657 aa  344  8e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240453  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2317  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 
657 aa  340  8e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.553373  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0447  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.9 
 
 
662 aa  340  9.999999999999999e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  46.97 
 
 
519 aa  339  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05068  composite two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  40.31 
 
 
676 aa  336  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0992  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 
663 aa  336  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.374279  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.69 
 
 
930 aa  336  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2452  histidine kinase  51.2 
 
 
459 aa  331  6e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137495  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1458  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.72 
 
 
585 aa  318  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  41.63 
 
 
587 aa  312  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  43.6 
 
 
1131 aa  308  6e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  44.39 
 
 
725 aa  307  7e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4696  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.7 
 
 
1214 aa  301  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1302  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  38.57 
 
 
1220 aa  301  8e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.772751 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 
835 aa  300  8e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2484  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 
761 aa  300  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55775  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.15 
 
 
1559 aa  299  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
1223 aa  300  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 
660 aa  299  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 
663 aa  298  6e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658614  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.33 
 
 
761 aa  298  7e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170014  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1406 aa  295  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1005  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 
646 aa  293  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442988  decreased coverage  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 
794 aa  293  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.55 
 
 
794 aa  293  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410783  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_003296  RS02235  composite two-component sensor kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  38.53 
 
 
796 aa  292  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1811  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.22 
 
 
1085 aa  288  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.565529  normal  0.532209 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4406  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 
653 aa  288  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
689 aa  286  3.0000000000000004e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4695  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 
526 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.756017  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5910  putative PAS/PAC sensor protein  34.69 
 
 
739 aa  285  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 
781 aa  283  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0667  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.45 
 
 
703 aa  281  6e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3030  sensory box histidine kinase/response regulator  35.15 
 
 
771 aa  275  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
656 aa  276  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3159  sensory box histidine kinase/response regulator  35.15 
 
 
771 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.882119  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1979  sensory box histidine kinase/response regulator  35.03 
 
 
771 aa  275  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1379  sensory box histidine kinase/response regulator  35.16 
 
 
769 aa  275  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2264  sensory box histidine kinase/response regulator  35.03 
 
 
771 aa  275  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.87596  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1289  sensory box histidine kinase/response regulator  35.03 
 
 
772 aa  275  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1000  sensory box histidine kinase/response regulator  35.03 
 
 
771 aa  275  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.53 
 
 
1408 aa  274  8.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1922  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 
558 aa  272  4e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 
672 aa  271  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.934605  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 
666 aa  271  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 
666 aa  271  5.9999999999999995e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1997  histidine kinase/response regulator hybrid protein  39.01 
 
 
558 aa  271  7e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.947527  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.54 
 
 
1363 aa  270  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 
1313 aa  268  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.41 
 
 
1090 aa  268  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.41 
 
 
1090 aa  268  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 
647 aa  267  8e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5642  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.13 
 
 
768 aa  266  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3793  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 
664 aa  266  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.191798 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 
768 aa  265  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6454  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 
768 aa  265  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 
776 aa  265  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 
768 aa  265  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 
938 aa  264  8e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.34 
 
 
1927 aa  264  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 
647 aa  262  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>