More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5910 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5910  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
739 aa  1499    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.07 
 
 
1331 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3000  signal transduction histidine kinase  50.17 
 
 
495 aa  269  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3626  signal transduction histidine kinase  46.88 
 
 
792 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0746201  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
1645 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5794  signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 
717 aa  231  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63151  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  35.49 
 
 
1124 aa  219  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0915  PAS sensor protein  37.38 
 
 
1132 aa  211  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476466  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0876  signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 
1132 aa  211  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61927  normal  0.464028 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 
1111 aa  201  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  45.45 
 
 
1096 aa  198  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
1096 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4799  signal transduction histidine kinase  43.63 
 
 
620 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0108  PAS sensor protein  43.24 
 
 
620 aa  191  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4080  putative PAS/PAC sensor protein  27.87 
 
 
1081 aa  176  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 
828 aa  175  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.419482 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0798  PAS sensor protein  36.45 
 
 
624 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2138  putative PAS/PAC sensor protein  32.52 
 
 
849 aa  163  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.906633  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  59.69 
 
 
678 aa  160  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.541226  hitchhiker  0.00764394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4235  signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
496 aa  160  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.942064  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7977  signal transduction histidine kinase  49.06 
 
 
1039 aa  151  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.22 
 
 
1215 aa  150  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.77 
 
 
1185 aa  150  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1297  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  49.68 
 
 
1168 aa  146  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
1004 aa  142  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  28.03 
 
 
1225 aa  140  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.03 
 
 
1225 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 
814 aa  140  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.38 
 
 
1808 aa  134  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  43.31 
 
 
1324 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1131  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.09 
 
 
826 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120114  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.22 
 
 
1050 aa  131  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4271  histidine kinase  45.86 
 
 
692 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.0625064 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0136  diguanylate cyclase  30 
 
 
1428 aa  127  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.86 
 
 
1330 aa  127  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  40.13 
 
 
697 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0975  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.7 
 
 
508 aa  125  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  41.94 
 
 
700 aa  125  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.37 
 
 
798 aa  124  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.14 
 
 
1977 aa  124  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 
1134 aa  124  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
1002 aa  123  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9041  two component sensor kinase/response regulator hybrid  28.3 
 
 
701 aa  122  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
1261 aa  123  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  39.01 
 
 
733 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.64 
 
 
764 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.38 
 
 
803 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 
770 aa  121  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 
1084 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  31.48 
 
 
728 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  39.53 
 
 
693 aa  119  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  41.72 
 
 
792 aa  118  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
728 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.93 
 
 
899 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5416  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 
632 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 
632 aa  117  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4812  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.21 
 
 
1423 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330918  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  30.15 
 
 
1017 aa  117  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.79 
 
 
796 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5234  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 
946 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
627 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4603  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.67 
 
 
783 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4875  PAS sensor protein  40.56 
 
 
632 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152822  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 
946 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  29.64 
 
 
770 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5841  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 
887 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.111175 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.06 
 
 
1965 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0315  signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 
901 aa  114  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.93 
 
 
1224 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6854  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
886 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0667  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.71 
 
 
703 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.03 
 
 
1253 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
3706 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 
664 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3696  sensory box histidine kinase/response regulator  31.2 
 
 
827 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.652711  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
674 aa  113  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.32 
 
 
1453 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.01 
 
 
1057 aa  112  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 
1116 aa  111  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1516  signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 
1205 aa  111  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0460264 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  37.57 
 
 
1036 aa  111  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 
1273 aa  111  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  26 
 
 
1381 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 
1086 aa  110  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0300  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 
887 aa  110  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328128  normal  0.0126688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 
1164 aa  109  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 
830 aa  109  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1778  PAS  30 
 
 
956 aa  108  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.584017  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  33.33 
 
 
692 aa  108  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.7 
 
 
1791 aa  108  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0144  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29 
 
 
764 aa  108  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.131271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
785 aa  108  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 
998 aa  107  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.76 
 
 
703 aa  107  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1329  PAS sensor protein  34.5 
 
 
1164 aa  107  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.488954 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4051  PAS sensor protein  31.56 
 
 
783 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.688401  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4421  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.56 
 
 
783 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 
858 aa  105  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 
1267 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.25 
 
 
1059 aa  105  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>