More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0098 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  60.22 
 
 
692 aa  692    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1730  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.44 
 
 
1103 aa  1009    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.747769  normal  0.0625523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  56.49 
 
 
977 aa  732    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.416631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  58.75 
 
 
1381 aa  723    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  63.71 
 
 
695 aa  702    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02065  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0752  ATPase domain-containing protein  72.96 
 
 
537 aa  657    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6183  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  65.13 
 
 
916 aa  803    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.24256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.95 
 
 
1225 aa  665    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4108  multi-sensor hybrid histidine kinase  72.95 
 
 
1095 aa  759    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.9 
 
 
1086 aa  759    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  85.01 
 
 
999 aa  679    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.54 
 
 
1065 aa  747    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  63.99 
 
 
1089 aa  706    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  66.3 
 
 
573 aa  687    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.03 
 
 
1092 aa  753    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  43.63 
 
 
1065 aa  772    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1455  PAS sensor protein  55.26 
 
 
1092 aa  1004    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534076  normal  0.193101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1050 aa  2110    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.86 
 
 
957 aa  743    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  45.12 
 
 
1086 aa  750    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3791  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  68.56 
 
 
492 aa  666    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.107728 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  64.88 
 
 
1022 aa  634  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.95 
 
 
858 aa  630  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.5 
 
 
830 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  76.12 
 
 
890 aa  599  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  50.48 
 
 
847 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.44 
 
 
1215 aa  590  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.69 
 
 
686 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  71.61 
 
 
646 aa  579  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  52.22 
 
 
1225 aa  582  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1778  PAS  43.07 
 
 
956 aa  579  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.584017  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  70.6 
 
 
646 aa  576  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  60.54 
 
 
998 aa  568  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3696  sensory box histidine kinase/response regulator  56.84 
 
 
827 aa  562  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.652711  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6214  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  73.42 
 
 
772 aa  559  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.459564 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  50.58 
 
 
695 aa  555  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  69.82 
 
 
889 aa  553  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  47.65 
 
 
695 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3679  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.72 
 
 
979 aa  528  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138825  normal  0.0339746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4630  multi-sensor hybrid histidine kinase  72.54 
 
 
845 aa  515  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.29 
 
 
941 aa  512  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1830  multi-sensor hybrid histidine kinase  67.99 
 
 
1165 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  57.23 
 
 
812 aa  512  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1870  sensory box histidine kinase/response regulator  48.75 
 
 
691 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3532  PAS  50.98 
 
 
691 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.804686  normal  0.0772354 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  46 
 
 
939 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.08 
 
 
1651 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  56.46 
 
 
814 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.6 
 
 
1646 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.14 
 
 
827 aa  493  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.12 
 
 
864 aa  488  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.05 
 
 
922 aa  479  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.7 
 
 
1631 aa  479  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 
1076 aa  474  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2717  sensory box histidine kinase/response regulator  50.88 
 
 
676 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.230475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 
943 aa  460  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0878  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  62.57 
 
 
754 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307069  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  39.17 
 
 
1036 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2450  PAS  51.99 
 
 
676 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.97 
 
 
689 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.800994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.16 
 
 
1057 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  57.8 
 
 
845 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0036  histidine kinase  51.42 
 
 
556 aa  428  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.526737  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2885  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.01 
 
 
818 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237924  normal  0.0700462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
809 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5389  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.62 
 
 
762 aa  421  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4732  multi-sensor hybrid histidine kinase  57.62 
 
 
728 aa  421  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.67 
 
 
966 aa  418  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.1 
 
 
943 aa  412  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2377  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.12 
 
 
688 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.25 
 
 
688 aa  410  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121998  normal  0.468356 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2652  histidine kinase  50.93 
 
 
556 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.36 
 
 
1067 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.82 
 
 
899 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2780  histidine kinase  56.81 
 
 
558 aa  404  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.97 
 
 
837 aa  405  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  38.86 
 
 
949 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.7 
 
 
949 aa  399  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.99 
 
 
943 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.58 
 
 
946 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4726  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.15 
 
 
625 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140851  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2228  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.36 
 
 
688 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.899414 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3546  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.36 
 
 
688 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3208  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.26 
 
 
622 aa  384  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0750823 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.39 
 
 
548 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5728  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.96 
 
 
727 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  50.39 
 
 
573 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5205  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.63 
 
 
727 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4076  histidine kinase  52.82 
 
 
416 aa  381  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  49.75 
 
 
571 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 
927 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.92 
 
 
789 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1221  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  51.16 
 
 
532 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178023 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5761  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.76 
 
 
708 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6011  histidine kinase  54.95 
 
 
743 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0568406  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.01 
 
 
789 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.01 
 
 
789 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1939  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.76 
 
 
691 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0201512 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.99 
 
 
905 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 
936 aa  375  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>