More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5389 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5389  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 762 aa  1549    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  44.21 
 
 		 1065 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.41 
 
 		 941 aa  537  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.15 
 
 		 1065 aa  531  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4108  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.09 
 
 		 1095 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  45.58 
 
 		 939 aa  510  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 		 1215 aa  486  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.78 
 
 		 827 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 		 1092 aa  480  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 		 1086 aa  479  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.98 
 
 		 957 aa  481  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  40.43 
 
 		 1086 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.11 
 
 		 922 aa  470  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.02 
 
 		 1225 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.96 
 
 		 1381 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  46.86 
 
 		 1225 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.4 
 
 		 1089 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.9 
 
 		 1022 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  50 
 
 		 692 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.61 
 
 		 573 aa  456  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6183  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.55 
 
 		 916 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.24256 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1455  PAS sensor protein  41.71 
 
 		 1092 aa  450  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534076  normal  0.193101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1730  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.58 
 
 		 1103 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.747769  normal  0.0625523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.62 
 
 		 1050 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.56 
 
 		 695 aa  443  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 943 aa  439  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.59 
 
 		 977 aa  438  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.416631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3791  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.31 
 
 		 492 aa  438  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.107728 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 		 812 aa  428  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  58.29 
 
 		 999 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0752  ATPase domain-containing protein  51.41 
 
 		 537 aa  425  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.86 
 
 		 814 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  47.19 
 
 		 695 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2717  sensory box histidine kinase/response regulator  53.71 
 
 		 676 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.230475  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3679  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.01 
 
 		 979 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138825  normal  0.0339746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  46.2 
 
 		 695 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2450  PAS  53.45 
 
 		 676 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  51.96 
 
 		 646 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.61 
 
 		 889 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  51.73 
 
 		 646 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0878  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  56.04 
 
 		 754 aa  405  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  56.49 
 
 		 830 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.26 
 
 		 845 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.27 
 
 		 890 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1830  multi-sensor hybrid histidine kinase  56.06 
 
 		 1165 aa  392  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4630  multi-sensor hybrid histidine kinase  56.6 
 
 		 845 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4732  multi-sensor hybrid histidine kinase  54.41 
 
 		 728 aa  391  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.61 
 
 		 858 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6214  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  53.22 
 
 		 772 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.459564 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  53.3 
 
 		 847 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3532  PAS  40.43 
 
 		 691 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.804686  normal  0.0772354 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.33 
 
 		 998 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2885  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.58 
 
 		 818 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237924  normal  0.0700462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.55 
 
 		 864 aa  385  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2780  histidine kinase  54.87 
 
 		 558 aa  385  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2652  histidine kinase  55.15 
 
 		 556 aa  382  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.91 
 
 		 688 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121998  normal  0.468356 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1870  sensory box histidine kinase/response regulator  39.45 
 
 		 691 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.79 
 
 		 686 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3696  sensory box histidine kinase/response regulator  52.71 
 
 		 827 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.652711  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.31 
 
 		 689 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.800994 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.08 
 
 		 1651 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1778  PAS  52.33 
 
 		 956 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.584017  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.5 
 
 		 1646 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.86 
 
 		 1631 aa  364  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0036  histidine kinase  52.6 
 
 		 556 aa  363  5.0000000000000005e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.526737  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.72 
 
 		 927 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5761  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.12 
 
 		 708 aa  355  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5205  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.09 
 
 		 727 aa  355  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1031  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.13 
 
 		 689 aa  354  4e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0531  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 		 1193 aa  353  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.55 
 
 		 1067 aa  352  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5728  multi-sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 		 727 aa  351  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2228  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.32 
 
 		 688 aa  349  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.899414 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3546  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.54 
 
 		 688 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2377  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.15 
 
 		 688 aa  347  6e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.08 
 
 		 936 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  48.84 
 
 		 571 aa  345  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4076  histidine kinase  50 
 
 		 416 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.39 
 
 		 944 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 789 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3015  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.38 
 
 		 762 aa  334  4e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.76 
 
 		 1113 aa  334  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3429  histidine kinase  47.89 
 
 		 538 aa  333  9e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2333  histidine kinase  47.34 
 
 		 538 aa  333  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.32 
 
 		 810 aa  331  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  45.52 
 
 		 573 aa  331  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.2 
 
 		 946 aa  330  6e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6011  histidine kinase  50.9 
 
 		 743 aa  330  7e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0568406  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 		 1079 aa  330  8e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3692  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.05 
 
 		 951 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.408416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 		 1108 aa  328  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1221  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  50.77 
 
 		 532 aa  328  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178023 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.6 
 
 		 809 aa  328  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.2 
 
 		 1076 aa  328  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.93 
 
 		 673 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.74 
 
 		 632 aa  327  6e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177294  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3208  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.41 
 
 		 622 aa  326  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0750823 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2506  histidine kinase  43.56 
 
 		 538 aa  325  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.971833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.11 
 
 		 926 aa  324  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>