More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0036 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0036  histidine kinase  100 
 
 
556 aa  1116    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.526737  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.28 
 
 
889 aa  472  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  57.61 
 
 
999 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.05 
 
 
998 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.09 
 
 
890 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  58.08 
 
 
858 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3532  PAS  53.96 
 
 
691 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.804686  normal  0.0772354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4108  multi-sensor hybrid histidine kinase  59.9 
 
 
1095 aa  444  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3791  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  59.25 
 
 
492 aa  445  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.107728 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  58.74 
 
 
830 aa  445  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  55.74 
 
 
847 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6183  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.38 
 
 
916 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.24256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1870  sensory box histidine kinase/response regulator  53.35 
 
 
691 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3696  sensory box histidine kinase/response regulator  56.28 
 
 
827 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.652711  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.1 
 
 
1089 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.19 
 
 
1086 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.06 
 
 
1092 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  55.37 
 
 
1086 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  60.05 
 
 
695 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02065  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  57.39 
 
 
695 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  57.44 
 
 
646 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  53.08 
 
 
646 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.1 
 
 
812 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.44 
 
 
686 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  57.46 
 
 
1022 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1778  PAS  52.24 
 
 
956 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.584017  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  58.38 
 
 
1381 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  56.12 
 
 
695 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  56.48 
 
 
957 aa  430  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  54.39 
 
 
1065 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  57.82 
 
 
692 aa  425  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  57.03 
 
 
1050 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.88 
 
 
1065 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0752  ATPase domain-containing protein  57.57 
 
 
537 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.53 
 
 
689 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.800994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  57.57 
 
 
573 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.85 
 
 
814 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6214  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  55.92 
 
 
772 aa  420  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.459564 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  58.29 
 
 
977 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.416631 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4630  multi-sensor hybrid histidine kinase  56.14 
 
 
845 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1455  PAS sensor protein  57.85 
 
 
1092 aa  411  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534076  normal  0.193101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1730  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  57.85 
 
 
1103 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.747769  normal  0.0625523 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1830  multi-sensor hybrid histidine kinase  58.31 
 
 
1165 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.53 
 
 
827 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2717  sensory box histidine kinase/response regulator  45.05 
 
 
676 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.230475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2450  PAS  43.68 
 
 
676 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0878  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  54.03 
 
 
754 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307069  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4732  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.86 
 
 
728 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.89 
 
 
845 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  50.59 
 
 
571 aa  386  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.28 
 
 
922 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.05 
 
 
864 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.79 
 
 
1215 aa  376  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.7 
 
 
941 aa  377  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3679  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.51 
 
 
979 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138825  normal  0.0339746 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2780  histidine kinase  49.64 
 
 
558 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  52.14 
 
 
939 aa  365  1e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2652  histidine kinase  48.64 
 
 
556 aa  363  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4076  histidine kinase  48.91 
 
 
416 aa  362  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.05 
 
 
1225 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2377  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.95 
 
 
688 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5728  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.82 
 
 
727 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  51.54 
 
 
1225 aa  355  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1939  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.95 
 
 
691 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0201512 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.5 
 
 
1067 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5761  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.74 
 
 
708 aa  342  7e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.3 
 
 
966 aa  343  7e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2885  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.21 
 
 
818 aa  342  8e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237924  normal  0.0700462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.99 
 
 
943 aa  341  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2228  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.97 
 
 
688 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.899414 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5389  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.12 
 
 
762 aa  339  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3546  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.45 
 
 
688 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0024  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.82 
 
 
734 aa  336  7e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1031  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.27 
 
 
689 aa  335  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5205  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.87 
 
 
727 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6265  sensor histidine kinase  47.56 
 
 
490 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0824359  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3015  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.57 
 
 
762 aa  334  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4846  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  51.54 
 
 
701 aa  333  4e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.110474 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.12 
 
 
732 aa  333  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2229  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.81 
 
 
553 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.638317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  45.99 
 
 
529 aa  330  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1684  histidine kinase  52.05 
 
 
701 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.62 
 
 
905 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3138  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.27 
 
 
647 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6011  histidine kinase  49.88 
 
 
743 aa  327  5e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0568406  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3208  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.56 
 
 
622 aa  326  8.000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0750823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3545  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.19 
 
 
553 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.70141  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1041  sensory box histidine kinase/response regulator  40.11 
 
 
611 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2778  Signal transduction histidine kinase  40.11 
 
 
611 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2635  sensory box histidine kinase/response regulator  40.11 
 
 
611 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.38 
 
 
740 aa  323  7e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0137  sensory box histidine kinase/response regulator  39.93 
 
 
611 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1307  sensory box histidine kinase/response regulator  39.93 
 
 
611 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.94 
 
 
943 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0764  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.1 
 
 
568 aa  320  3e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  42.49 
 
 
573 aa  321  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.99 
 
 
1036 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0541  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  45.2 
 
 
575 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  46.87 
 
 
726 aa  319  9e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5111  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.78 
 
 
589 aa  319  9e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>