More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0471 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  55.81 
 
 		 1065 aa  666    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.96 
 
 		 1065 aa  659    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.57 
 
 		 1050 aa  695    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.44 
 
 		 1381 aa  719    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  98.69 
 
 		 1225 aa  2425    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  85.01 
 
 		 1215 aa  2041    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1225 aa  2458    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.43 
 
 		 1022 aa  630  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4108  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.59 
 
 		 1095 aa  629  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6183  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.26 
 
 		 916 aa  621  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.24256 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.85 
 
 		 957 aa  552  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.92 
 
 		 941 aa  546  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1455  PAS sensor protein  42.5 
 
 		 1092 aa  543  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534076  normal  0.193101 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  70.26 
 
 		 812 aa  544  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  54 
 
 		 1089 aa  545  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1730  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.5 
 
 		 1103 aa  542  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.747769  normal  0.0625523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  56.67 
 
 		 977 aa  533  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.416631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.32 
 
 		 695 aa  526  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  48.32 
 
 		 939 aa  523  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.95 
 
 		 827 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  67.18 
 
 		 814 aa  515  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  51.73 
 
 		 692 aa  512  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.55 
 
 		 573 aa  511  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.55 
 
 		 864 aa  501  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3791  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.49 
 
 		 492 aa  498  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.107728 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.49 
 
 		 922 aa  490  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0878  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  66.15 
 
 		 754 aa  489  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1830  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.21 
 
 		 1165 aa  474  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0752  ATPase domain-containing protein  54.86 
 
 		 537 aa  466  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5389  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.02 
 
 		 762 aa  460  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  61.95 
 
 		 999 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  48.92 
 
 		 695 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.17 
 
 		 943 aa  454  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  46.65 
 
 		 695 aa  453  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  62.78 
 
 		 1086 aa  452  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  63.94 
 
 		 830 aa  453  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  61.95 
 
 		 1092 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  61.95 
 
 		 1086 aa  450  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  47.75 
 
 		 646 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  60.78 
 
 		 890 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  47.19 
 
 		 646 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 		 946 aa  436  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2717  sensory box histidine kinase/response regulator  55.56 
 
 		 676 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.230475  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.58 
 
 		 688 aa  434  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121998  normal  0.468356 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3679  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.73 
 
 		 979 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138825  normal  0.0339746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2450  PAS  56.99 
 
 		 676 aa  432  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  59.9 
 
 		 858 aa  432  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.93 
 
 		 943 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.02 
 
 		 889 aa  429  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.89 
 
 		 899 aa  426  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  56.56 
 
 		 998 aa  426  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  56.17 
 
 		 686 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4630  multi-sensor hybrid histidine kinase  60.1 
 
 		 845 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2885  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.12 
 
 		 818 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237924  normal  0.0700462 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.04 
 
 		 837 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.35 
 
 		 845 aa  413  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6214  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  59.08 
 
 		 772 aa  411  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.459564 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  57.29 
 
 		 847 aa  413  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3696  sensory box histidine kinase/response regulator  54.81 
 
 		 827 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.652711  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1778  PAS  54.76 
 
 		 956 aa  410  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.584017  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  45.95 
 
 		 1651 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 		 809 aa  405  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.13 
 
 		 1067 aa  398  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  38.4 
 
 		 1036 aa  395  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2652  histidine kinase  56.78 
 
 		 556 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.55 
 
 		 1646 aa  396  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2780  histidine kinase  54.96 
 
 		 558 aa  390  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.91 
 
 		 1631 aa  392  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  53.69 
 
 		 571 aa  388  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1870  sensory box histidine kinase/response regulator  52.73 
 
 		 691 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5234  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 946 aa  390  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4732  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.93 
 
 		 728 aa  386  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3692  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.94 
 
 		 951 aa  382  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.408416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3532  PAS  43.03 
 
 		 691 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.804686  normal  0.0772354 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.38 
 
 		 936 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5205  multi-sensor hybrid histidine kinase  53 
 
 		 727 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0036  histidine kinase  52.05 
 
 		 556 aa  373  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.526737  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5761  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.95 
 
 		 708 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6011  histidine kinase  53.83 
 
 		 743 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0568406  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3208  multi-sensor hybrid histidine kinase  49 
 
 		 622 aa  369  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0750823 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5728  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.86 
 
 		 727 aa  369  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.43 
 
 		 740 aa  366  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4076  histidine kinase  54.17 
 
 		 416 aa  365  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  49.48 
 
 		 573 aa  365  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 927 aa  364  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.89 
 
 		 810 aa  364  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.44 
 
 		 789 aa  363  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.22 
 
 		 548 aa  363  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  37.77 
 
 		 733 aa  363  1e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.67 
 
 		 741 aa  363  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  48.2 
 
 		 726 aa  360  9e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.09 
 
 		 789 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.09 
 
 		 789 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1221  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  50.5 
 
 		 532 aa  357  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.88 
 
 		 673 aa  357  8.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 807 aa  354  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4846  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  52.03 
 
 		 701 aa  354  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.110474 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1031  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.91 
 
 		 689 aa  353  8e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4726  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.13 
 
 		 625 aa  352  3e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.65 
 
 		 743 aa  349  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>