More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2535 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
688 aa  1393    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121998  normal  0.468356 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.6 
 
 
695 aa  543  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02065  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  43.92 
 
 
692 aa  535  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  41.49 
 
 
695 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  40.65 
 
 
695 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.2 
 
 
1065 aa  476  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  47.2 
 
 
1065 aa  478  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.13 
 
 
1089 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.64 
 
 
1381 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.2 
 
 
1022 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.97 
 
 
941 aa  452  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.29 
 
 
957 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.02 
 
 
827 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2443  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.65 
 
 
657 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3679  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.1 
 
 
979 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138825  normal  0.0339746 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  47.5 
 
 
939 aa  433  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.66 
 
 
1215 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2505  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.51 
 
 
707 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.64 
 
 
943 aa  430  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6183  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.34 
 
 
916 aa  430  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.24256 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3430  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.08 
 
 
705 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2332  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.85 
 
 
687 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.45 
 
 
922 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.33 
 
 
573 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.58 
 
 
1225 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.55 
 
 
977 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.416631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  44.54 
 
 
1225 aa  411  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3791  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.66 
 
 
492 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.107728 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1730  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.55 
 
 
1103 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.747769  normal  0.0625523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1455  PAS sensor protein  44.55 
 
 
1092 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534076  normal  0.193101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.25 
 
 
1050 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 
727 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.31 
 
 
727 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
732 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4108  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.51 
 
 
1095 aa  383  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 
727 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.46 
 
 
1651 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.02 
 
 
812 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.09 
 
 
1646 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0878  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  51.16 
 
 
754 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307069  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1830  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.54 
 
 
1165 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.62 
 
 
999 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5841  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 
887 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.111175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2717  sensory box histidine kinase/response regulator  50.25 
 
 
676 aa  363  8e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.230475  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.91 
 
 
845 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.39 
 
 
1631 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5389  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.91 
 
 
762 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0752  ATPase domain-containing protein  43.46 
 
 
537 aa  356  7.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.27 
 
 
703 aa  356  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.32 
 
 
814 aa  355  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.76 
 
 
1067 aa  352  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2450  PAS  48.98 
 
 
676 aa  351  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154072 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  40.31 
 
 
1086 aa  349  8e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.03 
 
 
1092 aa  349  8e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2885  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.36 
 
 
818 aa  349  9e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237924  normal  0.0700462 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.68 
 
 
889 aa  349  9e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.14 
 
 
1086 aa  347  4e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 
864 aa  345  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.96 
 
 
998 aa  343  7e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  46.36 
 
 
646 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3696  sensory box histidine kinase/response regulator  46.85 
 
 
827 aa  340  5e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.652711  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 
809 aa  337  5e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0092  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 
742 aa  336  9e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.37 
 
 
858 aa  336  9e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.62 
 
 
890 aa  335  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  46.02 
 
 
646 aa  335  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 
720 aa  334  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 
927 aa  332  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1778  PAS  46.1 
 
 
956 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.584017  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4630  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.39 
 
 
845 aa  331  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.39 
 
 
830 aa  331  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2652  histidine kinase  48.73 
 
 
556 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1870  sensory box histidine kinase/response regulator  45.13 
 
 
691 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4293  sensory box histidine kinase/response regulator  37.94 
 
 
793 aa  326  9e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6214  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.25 
 
 
772 aa  323  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.459564 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 
1057 aa  323  7e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.98 
 
 
899 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.16 
 
 
703 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1031  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 
689 aa  322  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3996  PAS  37.43 
 
 
796 aa  321  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447634  normal  0.187563 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2780  histidine kinase  40.94 
 
 
558 aa  321  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 
944 aa  320  6e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  45.69 
 
 
847 aa  320  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3532  PAS  38.58 
 
 
691 aa  319  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.804686  normal  0.0772354 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.23 
 
 
686 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5761  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.35 
 
 
708 aa  318  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3015  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.89 
 
 
762 aa  315  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4732  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.98 
 
 
728 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 
1224 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2377  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.83 
 
 
688 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 
1076 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3692  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 
951 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.408416  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 
943 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0036  histidine kinase  45.61 
 
 
556 aa  311  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.526737  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 
837 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5234  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 
946 aa  308  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 
946 aa  306  9.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3138  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.95 
 
 
647 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.825955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.79 
 
 
1076 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1939  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.25 
 
 
691 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0201512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>