More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5221 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
703 aa  1422    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  71.1 
 
 
1059 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  61.11 
 
 
1011 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0092  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.82 
 
 
742 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4105  multi-sensor hybrid histidine kinase  70.73 
 
 
888 aa  571  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  56.35 
 
 
943 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  61.19 
 
 
1057 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.54 
 
 
1076 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  59.28 
 
 
944 aa  560  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2108  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.2 
 
 
1014 aa  556  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.659699  normal  0.848073 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  46.27 
 
 
732 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.5 
 
 
899 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5233  histidine kinase  65.97 
 
 
638 aa  551  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  70.98 
 
 
809 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  72.68 
 
 
581 aa  543  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2970  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.36 
 
 
584 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653031  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  70.56 
 
 
785 aa  509  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4051  PAS sensor protein  70.18 
 
 
783 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.688401  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  69.95 
 
 
946 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4421  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  69.92 
 
 
783 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.7 
 
 
727 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.31 
 
 
837 aa  503  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3794  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  65.24 
 
 
708 aa  503  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.475023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6444  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  63.75 
 
 
736 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114269  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0097  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  62.86 
 
 
720 aa  499  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4196  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  62.83 
 
 
693 aa  500  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1131  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  59.45 
 
 
826 aa  491  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120114  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0144  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  59.5 
 
 
764 aa  489  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.131271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  65.1 
 
 
814 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.26 
 
 
585 aa  475  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179057  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3335  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  61.03 
 
 
942 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  59.7 
 
 
727 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4107  PAS sensor protein  60.29 
 
 
587 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0206968  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4475  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  60.29 
 
 
587 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  60.05 
 
 
727 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.48 
 
 
821 aa  465  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.3 
 
 
795 aa  465  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524225  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3343  histidine kinase  57.94 
 
 
632 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.37 
 
 
822 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5234  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.3 
 
 
946 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0508  histidine kinase  57.71 
 
 
632 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5223  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  59.51 
 
 
722 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.48 
 
 
720 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  61.6 
 
 
1224 aa  452  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3622  PAS sensor protein  55.94 
 
 
684 aa  451  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.94 
 
 
684 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0232  sensor histidine kinase  58.85 
 
 
716 aa  442  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786809  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0855  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.51 
 
 
776 aa  439  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3021  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  61.21 
 
 
812 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510865  normal  0.160517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  51.25 
 
 
1427 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.18 
 
 
1036 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.23 
 
 
1415 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.72 
 
 
1426 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4293  sensory box histidine kinase/response regulator  51.54 
 
 
793 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3996  PAS  51.38 
 
 
796 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447634  normal  0.187563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  50 
 
 
1299 aa  369  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 
905 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5841  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.35 
 
 
887 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.111175 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 
703 aa  360  7e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 
889 aa  357  5e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 
660 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  34.39 
 
 
695 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2251  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 
721 aa  331  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0770498  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  34.56 
 
 
692 aa  328  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.16 
 
 
688 aa  322  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121998  normal  0.468356 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 
966 aa  320  6e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0024  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 
734 aa  318  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 
695 aa  317  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02065  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 
732 aa  317  7e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0137  sensory box histidine kinase/response regulator  38.61 
 
 
611 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1307  sensory box histidine kinase/response regulator  38.61 
 
 
611 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1041  sensory box histidine kinase/response regulator  38.49 
 
 
611 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2778  Signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 
611 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2635  sensory box histidine kinase/response regulator  38.49 
 
 
611 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  31.89 
 
 
695 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.45 
 
 
630 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0163  sensory box histidine kinase/response regulator  38.61 
 
 
611 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
494 aa  295  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4307  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.9 
 
 
806 aa  293  7e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.767019  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.17 
 
 
949 aa  293  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  38.01 
 
 
949 aa  291  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 
662 aa  290  6e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.66 
 
 
508 aa  290  7e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.57 
 
 
943 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1031  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 
689 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  42.12 
 
 
1036 aa  284  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.84 
 
 
712 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.113069  normal  0.344517 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 
1013 aa  282  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48160  putative sensor/response regulator hybrid  36.35 
 
 
858 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  41.57 
 
 
571 aa  280  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4524  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.81 
 
 
589 aa  280  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.26 
 
 
1076 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 
845 aa  279  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
926 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.81 
 
 
589 aa  279  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153925  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 
1651 aa  278  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.82 
 
 
705 aa  276  7e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 
673 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 
1105 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4268  histidine kinase  41 
 
 
575 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.396925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>