More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3047 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0092  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  70.39 
 
 		 742 aa  798    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0144  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  79.4 
 
 		 764 aa  1238    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.131271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2108  multi-sensor hybrid histidine kinase  57.57 
 
 		 1014 aa  652    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.659699  normal  0.848073 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 814 aa  1640    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1131  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  81.37 
 
 		 826 aa  1325    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.45 
 
 		 1057 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.71 
 
 		 1076 aa  595  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.22 
 
 		 1059 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.71 
 
 		 944 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.82 
 
 		 1011 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.37 
 
 		 837 aa  544  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.23 
 
 		 809 aa  535  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.63 
 
 		 946 aa  528  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.79 
 
 		 821 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.97 
 
 		 943 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4051  PAS sensor protein  48.87 
 
 		 783 aa  519  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.688401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0097  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  67 
 
 		 720 aa  512  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.26 
 
 		 785 aa  513  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4196  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  68.56 
 
 		 693 aa  513  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4421  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.3 
 
 		 783 aa  514  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.79 
 
 		 899 aa  511  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  51 
 
 		 684 aa  509  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.36 
 
 		 822 aa  511  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4293  sensory box histidine kinase/response regulator  39.56 
 
 		 793 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.74 
 
 		 581 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3996  PAS  38.22 
 
 		 796 aa  509  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447634  normal  0.187563 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3794  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  68.96 
 
 		 708 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475023 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3622  PAS sensor protein  50.82 
 
 		 684 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6444  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  66.75 
 
 		 736 aa  505  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2970  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  62.25 
 
 		 584 aa  502  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  65.1 
 
 		 703 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4105  multi-sensor hybrid histidine kinase  63.47 
 
 		 888 aa  484  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.98 
 
 		 795 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524225  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5233  histidine kinase  64.06 
 
 		 638 aa  478  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.69 
 
 		 1224 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  59.79 
 
 		 727 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5234  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.68 
 
 		 946 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0508  histidine kinase  59.68 
 
 		 632 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3343  histidine kinase  59.68 
 
 		 632 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  60.31 
 
 		 727 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.12 
 
 		 585 aa  445  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4475  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.55 
 
 		 587 aa  444  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4107  PAS sensor protein  54.55 
 
 		 587 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0206968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  58.64 
 
 		 732 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  59.32 
 
 		 727 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3335  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.84 
 
 		 942 aa  430  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5223  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  57.41 
 
 		 722 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3021  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.69 
 
 		 812 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510865  normal  0.160517 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.26 
 
 		 1164 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1329  PAS sensor protein  43.97 
 
 		 1164 aa  405  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.488954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0232  sensor histidine kinase  54.5 
 
 		 716 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  43.01 
 
 		 1427 aa  389  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.51 
 
 		 1415 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  40.04 
 
 		 646 aa  379  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.08 
 
 		 1426 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  44.88 
 
 		 1299 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  37.38 
 
 		 646 aa  365  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 		 966 aa  364  3e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.26 
 
 		 845 aa  364  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 		 827 aa  363  6e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.51 
 
 		 1050 aa  355  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0855  GAF sensor hybrid histidine kinase  51.3 
 
 		 776 aa  351  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  36.64 
 
 		 1065 aa  350  6e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 		 1065 aa  348  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  32.5 
 
 		 1036 aa  337  5.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 		 630 aa  333  7.000000000000001e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 		 927 aa  333  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  31.54 
 
 		 847 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 957 aa  326  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.42 
 
 		 941 aa  324  3e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 		 1381 aa  323  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1939  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 		 691 aa  320  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0201512 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48160  putative sensor/response regulator hybrid  32.59 
 
 		 858 aa  317  6e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2377  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 		 688 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 939 aa  307  6e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1455  PAS sensor protein  34.66 
 
 		 1092 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534076  normal  0.193101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1730  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 		 1103 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.747769  normal  0.0625523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3546  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 		 688 aa  300  6e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2228  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 		 688 aa  300  6e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.899414 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4307  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 		 806 aa  300  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.767019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.83 
 
 		 1646 aa  298  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.01 
 
 		 1651 aa  296  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.44 
 
 		 1631 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.82 
 
 		 508 aa  292  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.34 
 
 		 712 aa  288  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.113069  normal  0.344517 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 810 aa  287  5.999999999999999e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3692  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.36 
 
 		 951 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.408416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0349  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.25 
 
 		 722 aa  283  9e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.081308  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2229  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.34 
 
 		 553 aa  283  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.638317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.58 
 
 		 662 aa  282  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  44.53 
 
 		 571 aa  281  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2378  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 		 551 aa  280  9e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81922 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 		 943 aa  280  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3545  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.85 
 
 		 553 aa  279  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.70141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  34.02 
 
 		 1086 aa  279  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 		 1086 aa  279  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 		 1036 aa  278  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 		 977 aa  278  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.416631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 1092 aa  277  7e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2196  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.82 
 
 		 705 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.908394  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>