More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3634 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.81 
 
 
1011 aa  669    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.19 
 
 
1059 aa  682    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  63.28 
 
 
943 aa  749    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.62 
 
 
927 aa  657    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.96 
 
 
809 aa  649    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.95 
 
 
957 aa  691    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  68.94 
 
 
581 aa  761    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
944 aa  1900    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  70.8 
 
 
1076 aa  1122    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  61.07 
 
 
899 aa  710    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  73.1 
 
 
1057 aa  1125    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2108  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.28 
 
 
1014 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.659699  normal  0.848073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.87 
 
 
785 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.55 
 
 
941 aa  601  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4051  PAS sensor protein  49.18 
 
 
783 aa  600  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.688401  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4421  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.18 
 
 
783 aa  598  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5234  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.89 
 
 
946 aa  595  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.57 
 
 
1224 aa  591  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.94 
 
 
946 aa  589  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.71 
 
 
814 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.49 
 
 
795 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524225  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 
939 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.71 
 
 
821 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0144  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.91 
 
 
764 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.131271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4105  multi-sensor hybrid histidine kinase  73.58 
 
 
888 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1131  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.05 
 
 
826 aa  572  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120114  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  58.59 
 
 
837 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  59.28 
 
 
703 aa  560  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.12 
 
 
822 aa  562  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5233  histidine kinase  65.77 
 
 
638 aa  558  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3692  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.7 
 
 
951 aa  552  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.408416  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2970  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  57.74 
 
 
584 aa  529  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653031  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 
943 aa  519  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4293  sensory box histidine kinase/response regulator  44.68 
 
 
793 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3996  PAS  48.85 
 
 
796 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447634  normal  0.187563 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0092  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.6 
 
 
742 aa  511  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6444  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  66.33 
 
 
736 aa  500  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114269  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3021  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.66 
 
 
812 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510865  normal  0.160517 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4196  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  64.75 
 
 
693 aa  487  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  38.79 
 
 
1065 aa  486  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.85 
 
 
977 aa  477  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.416631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0097  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  62.98 
 
 
720 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3794  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  65.3 
 
 
708 aa  477  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.475023 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.37 
 
 
1065 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.65 
 
 
585 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179057  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3343  histidine kinase  62.11 
 
 
632 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0508  histidine kinase  63.07 
 
 
632 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  59.84 
 
 
727 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4475  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.37 
 
 
587 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4107  PAS sensor protein  53.37 
 
 
587 aa  459  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0206968  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3622  PAS sensor protein  50.84 
 
 
684 aa  458  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  59.64 
 
 
727 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.66 
 
 
684 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5223  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  59.17 
 
 
722 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  58.4 
 
 
732 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  60.72 
 
 
727 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  44.43 
 
 
1427 aa  452  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.63 
 
 
1381 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3335  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  60.1 
 
 
942 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1730  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 
1103 aa  438  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.747769  normal  0.0625523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1455  PAS sensor protein  38.08 
 
 
1092 aa  439  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534076  normal  0.193101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0232  sensor histidine kinase  58.63 
 
 
716 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786809  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 
922 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.71 
 
 
1426 aa  426  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.48 
 
 
1415 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 
1089 aa  398  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  45.47 
 
 
1299 aa  386  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3679  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 
979 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138825  normal  0.0339746 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2885  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.23 
 
 
818 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237924  normal  0.0700462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  40.03 
 
 
692 aa  362  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0855  GAF sensor hybrid histidine kinase  52.28 
 
 
776 aa  362  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.62 
 
 
573 aa  360  9.999999999999999e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.19 
 
 
1215 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.93 
 
 
1651 aa  357  7.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6183  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 
916 aa  349  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.24256 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 
1050 aa  349  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.08 
 
 
1646 aa  346  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.93 
 
 
1631 aa  339  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.05 
 
 
827 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.23 
 
 
1225 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.19 
 
 
1086 aa  337  5.999999999999999e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  41 
 
 
1225 aa  335  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 
1067 aa  334  5e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  32.5 
 
 
1086 aa  333  9e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 
1092 aa  332  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 
1022 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 
1013 aa  327  9e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 
688 aa  320  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121998  normal  0.468356 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3791  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.75 
 
 
492 aa  317  9e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.107728 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.28 
 
 
695 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02065  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 
936 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4108  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 
1095 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.05 
 
 
795 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.477207 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 
1079 aa  313  1e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5389  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 
762 aa  312  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 
662 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.74 
 
 
630 aa  307  7e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  36.68 
 
 
695 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.66 
 
 
1122 aa  305  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 
1432 aa  304  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>