More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3335 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3335  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
942 aa  1925    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.32 
 
 
944 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2108  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.94 
 
 
1014 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.659699  normal  0.848073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.92 
 
 
809 aa  536  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.57 
 
 
1059 aa  535  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.14 
 
 
1011 aa  519  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.75 
 
 
1224 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  57.44 
 
 
585 aa  481  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179057  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  59.34 
 
 
703 aa  478  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.96 
 
 
899 aa  477  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4107  PAS sensor protein  58.41 
 
 
587 aa  478  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0206968  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4475  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  58.41 
 
 
587 aa  478  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5223  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  60.49 
 
 
722 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.36 
 
 
821 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2970  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  56.56 
 
 
584 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653031  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.27 
 
 
1057 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.46 
 
 
943 aa  469  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5234  multi-sensor hybrid histidine kinase  61.26 
 
 
946 aa  465  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4051  PAS sensor protein  61.68 
 
 
783 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.688401  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4421  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  61.68 
 
 
783 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4105  multi-sensor hybrid histidine kinase  58.77 
 
 
888 aa  458  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  60.63 
 
 
946 aa  458  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1131  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.62 
 
 
826 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120114  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  62.2 
 
 
785 aa  459  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.955834 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3021  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  59.03 
 
 
812 aa  458  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510865  normal  0.160517 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  59.13 
 
 
837 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  56.21 
 
 
684 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0144  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.18 
 
 
764 aa  450  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.131271 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3343  histidine kinase  58.59 
 
 
632 aa  451  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.7 
 
 
814 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.09 
 
 
1076 aa  452  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.57 
 
 
822 aa  452  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3622  PAS sensor protein  55.97 
 
 
684 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0508  histidine kinase  59.62 
 
 
632 aa  444  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  61.6 
 
 
581 aa  446  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5233  histidine kinase  59.22 
 
 
638 aa  446  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.42 
 
 
795 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524225  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4196  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  57.11 
 
 
693 aa  436  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0092  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.61 
 
 
742 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0097  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  55.36 
 
 
720 aa  430  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3794  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  57.6 
 
 
708 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.475023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0232  sensor histidine kinase  56.68 
 
 
716 aa  432  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.786809  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6444  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  55.04 
 
 
736 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114269  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 
957 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  57.03 
 
 
1427 aa  422  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 
630 aa  414  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4293  sensory box histidine kinase/response regulator  37.55 
 
 
793 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  51.25 
 
 
727 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.51 
 
 
1415 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  52 
 
 
727 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  49.76 
 
 
727 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.84 
 
 
1426 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  49.64 
 
 
732 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3996  PAS  36.54 
 
 
796 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447634  normal  0.187563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.31 
 
 
662 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3692  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 
951 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.408416  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.96 
 
 
943 aa  398  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.4 
 
 
810 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 
927 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  52.81 
 
 
1299 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0855  GAF sensor hybrid histidine kinase  51.71 
 
 
776 aa  382  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 
743 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.55 
 
 
966 aa  372  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 
651 aa  361  3e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 
660 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  33.8 
 
 
812 aa  353  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  34.97 
 
 
1036 aa  350  7e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
789 aa  346  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
789 aa  346  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.15 
 
 
977 aa  345  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.416631 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.2 
 
 
807 aa  342  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 
642 aa  339  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750197  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5991  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.79 
 
 
642 aa  336  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.12 
 
 
949 aa  335  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  32.53 
 
 
1086 aa  335  3e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 
1092 aa  334  4e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4307  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 
806 aa  334  4e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.767019  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  34.67 
 
 
949 aa  334  6e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.64 
 
 
936 aa  333  7.000000000000001e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1835  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.95 
 
 
782 aa  333  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5407  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 
815 aa  333  9e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.05 
 
 
943 aa  333  9e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 
1013 aa  333  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  34.88 
 
 
678 aa  332  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 
789 aa  331  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4749  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.91 
 
 
781 aa  327  6e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.872225  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5841  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.45 
 
 
887 aa  325  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.111175 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 
703 aa  323  6e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.89 
 
 
653 aa  323  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 
1086 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.16 
 
 
983 aa  322  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.1 
 
 
1079 aa  317  5e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 
962 aa  317  6e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  31.71 
 
 
1065 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 
941 aa  314  5.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  44.77 
 
 
571 aa  313  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 
1106 aa  311  4e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0134  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.46 
 
 
682 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.574481  normal  0.0374693 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0038  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 
681 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0323591 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2717  sensory box histidine kinase/response regulator  36.13 
 
 
676 aa  310  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.230475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>