More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3507 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5991  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.17 
 
 
642 aa  637    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
662 aa  1338    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.8 
 
 
810 aa  646    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.47 
 
 
660 aa  670    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.7 
 
 
651 aa  649    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  52.65 
 
 
678 aa  654    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.84 
 
 
642 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750197  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2691  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.14 
 
 
639 aa  625  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.87 
 
 
630 aa  624  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.55 
 
 
653 aa  621  1e-176  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3591  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.71 
 
 
650 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.48 
 
 
789 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.48 
 
 
789 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.84 
 
 
807 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1835  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.51 
 
 
782 aa  581  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5407  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.64 
 
 
815 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4749  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.04 
 
 
781 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.872225  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.05 
 
 
789 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2015  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.24 
 
 
538 aa  554  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3125  putative sensor/response regulator hybrid  46.66 
 
 
650 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70953  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36420  putative sensor/response regulator hybrid  46.66 
 
 
699 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426849  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.46 
 
 
743 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.8 
 
 
508 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  41.78 
 
 
812 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.84 
 
 
766 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2057  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.39 
 
 
774 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.906607  hitchhiker  0.00133985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2956  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.31 
 
 
650 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753222  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3335  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.22 
 
 
942 aa  372  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.21 
 
 
639 aa  369  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 
641 aa  354  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.86 
 
 
657 aa  345  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.64 
 
 
712 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.113069  normal  0.344517 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.73 
 
 
657 aa  336  7e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 
632 aa  336  1e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177294  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2399  histidine kinase  51.79 
 
 
564 aa  334  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  41.53 
 
 
539 aa  332  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3835  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.81 
 
 
386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1531  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 
643 aa  327  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0092  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.53 
 
 
742 aa  328  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.77 
 
 
386 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.732563  normal  0.10133 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 
962 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 
944 aa  327  6e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.31 
 
 
966 aa  326  7e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.01 
 
 
1059 aa  326  9e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1935  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.81 
 
 
386 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487493  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.36 
 
 
943 aa  324  4e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.6 
 
 
673 aa  323  7e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 
809 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.77 
 
 
949 aa  320  6e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 
655 aa  319  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.42 
 
 
936 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.56 
 
 
386 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.861815 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  36.94 
 
 
949 aa  318  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 
1011 aa  316  8e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 
1057 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 
1076 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 
1105 aa  312  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 
1053 aa  310  5e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.04 
 
 
946 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 
1013 aa  310  5.9999999999999995e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3795  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.72 
 
 
807 aa  310  6.999999999999999e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2024  fused PAS sensor histidine kinase protein and response regulator  33.33 
 
 
1005 aa  310  6.999999999999999e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00627468  normal  0.216163 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2081  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
899 aa  310  8e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 
1076 aa  310  8e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0542  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 
1050 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.757487  normal  0.763027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 
853 aa  307  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 
1092 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.52 
 
 
703 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 
1086 aa  306  6e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.09 
 
 
1651 aa  306  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.85 
 
 
927 aa  306  7e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 
943 aa  306  7e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  41.03 
 
 
534 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 
827 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  33.18 
 
 
1086 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 
1381 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  37.78 
 
 
541 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.36 
 
 
1631 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  37.78 
 
 
541 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  38.64 
 
 
533 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1131  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.87 
 
 
826 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.120114  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  37.17 
 
 
541 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  40.43 
 
 
531 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4307  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 
806 aa  303  6.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.767019  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  38.36 
 
 
544 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.56 
 
 
1646 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  39.23 
 
 
507 aa  303  8.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  38.43 
 
 
533 aa  302  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 
943 aa  302  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 
859 aa  301  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5234  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.49 
 
 
946 aa  301  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 
1079 aa  300  4e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5456  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.67 
 
 
641 aa  300  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0579502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4711  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.82 
 
 
683 aa  300  6e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.73 
 
 
628 aa  300  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0247  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.74 
 
 
640 aa  300  7e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
766 aa  300  8e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.41 
 
 
814 aa  299  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3692  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
951 aa  299  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.408416  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  34.11 
 
 
749 aa  298  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>