More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0272 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2588  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  57.18 
 
 
766 aa  732    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2057  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.3 
 
 
774 aa  712    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.906607  hitchhiker  0.00133985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
766 aa  1537    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.05 
 
 
660 aa  488  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  50.18 
 
 
678 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.76 
 
 
651 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5991  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.95 
 
 
642 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.71 
 
 
642 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750197  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3591  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.8 
 
 
650 aa  437  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.23 
 
 
653 aa  436  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  56.88 
 
 
721 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115994  normal  0.0775846 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2043  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  56.99 
 
 
691 aa  412  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10086  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2474  histidine kinase  57.8 
 
 
559 aa  403  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.369133 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36420  putative sensor/response regulator hybrid  45 
 
 
699 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426849  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3125  putative sensor/response regulator hybrid  45.18 
 
 
650 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70953  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.78 
 
 
927 aa  385  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6354  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.88 
 
 
699 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2691  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.55 
 
 
639 aa  379  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4603  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.03 
 
 
783 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1329  PAS sensor protein  50.23 
 
 
1164 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.488954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.23 
 
 
1164 aa  379  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.03 
 
 
688 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0500187 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5110  histidine kinase  49.1 
 
 
558 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  0.0814675 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5394  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  53.09 
 
 
558 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0211479 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5576  histidine kinase  52.51 
 
 
529 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0252292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3692  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.49 
 
 
951 aa  364  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.408416  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2956  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.04 
 
 
650 aa  361  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753222  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48160  putative sensor/response regulator hybrid  41.19 
 
 
858 aa  349  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2960  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.88 
 
 
622 aa  327  5e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.83 
 
 
628 aa  325  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2842  PAS sensor protein  46.09 
 
 
622 aa  323  6e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174863  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.09 
 
 
622 aa  323  6e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231547  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41 
 
 
696 aa  317  5e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  45.45 
 
 
571 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  44.39 
 
 
646 aa  311  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  37.62 
 
 
695 aa  310  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  38.79 
 
 
695 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.51 
 
 
1089 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4151  sensor histidine kinase/response regulator hybrid  40.82 
 
 
571 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.579562  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 
673 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3795  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 
807 aa  304  5.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  37.97 
 
 
695 aa  303  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.96 
 
 
548 aa  302  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  44.39 
 
 
646 aa  302  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 
1105 aa  302  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  44.47 
 
 
573 aa  301  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0878  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.43 
 
 
754 aa  301  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307069  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 
943 aa  300  6e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.55 
 
 
827 aa  300  7e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 
695 aa  299  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3901  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.7 
 
 
661 aa  299  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0390399  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2450  PAS  43.48 
 
 
676 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154072 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.53 
 
 
889 aa  298  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  45.07 
 
 
544 aa  297  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2717  sensory box histidine kinase/response regulator  45.92 
 
 
676 aa  296  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.230475  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0024  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.18 
 
 
734 aa  296  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3015  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.22 
 
 
762 aa  296  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.23 
 
 
812 aa  295  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  36.75 
 
 
1065 aa  294  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.26 
 
 
732 aa  294  5e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 
1065 aa  293  9e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 
1022 aa  293  9e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.37 
 
 
1381 aa  293  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5728  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.85 
 
 
727 aa  292  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.04 
 
 
957 aa  292  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0225  PAS  37.14 
 
 
673 aa  292  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.7 
 
 
1067 aa  291  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2251  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.24 
 
 
721 aa  292  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0770498  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.77 
 
 
1053 aa  292  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5205  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.9 
 
 
727 aa  292  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  38.85 
 
 
539 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.62 
 
 
999 aa  291  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.73 
 
 
941 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.99 
 
 
966 aa  290  6e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2204  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  44.82 
 
 
588 aa  290  7e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0313534  normal  0.331001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.13 
 
 
926 aa  290  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6183  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 
916 aa  290  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.24256 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 
922 aa  290  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
632 aa  288  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4430  GAF sensor hybrid histidine kinase  45.15 
 
 
571 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.63 
 
 
1076 aa  289  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.95 
 
 
810 aa  288  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5389  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.43 
 
 
762 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.61 
 
 
662 aa  289  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 
789 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4875  PAS sensor protein  36.75 
 
 
632 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152822  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.67 
 
 
949 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.02 
 
 
830 aa  287  5.999999999999999e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.35 
 
 
1036 aa  287  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0541  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  44.3 
 
 
575 aa  287  5.999999999999999e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3208  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.46 
 
 
622 aa  286  8e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0750823 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4846  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44 
 
 
701 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.110474 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 
1013 aa  286  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.79 
 
 
1086 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1830  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.65 
 
 
1165 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.37 
 
 
1050 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  46.38 
 
 
1086 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.38 
 
 
1092 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.72 
 
 
814 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  38.13 
 
 
692 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>