More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6212 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  83.42 
 
 		 1089 aa  668    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.56 
 
 		 1092 aa  717    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4108  multi-sensor hybrid histidine kinase  80.42 
 
 		 1095 aa  641    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4630  multi-sensor hybrid histidine kinase  57.32 
 
 		 845 aa  678    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5728  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.86 
 
 		 727 aa  649    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  85.42 
 
 		 1050 aa  679    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5205  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.18 
 
 		 727 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  84.77 
 
 		 957 aa  671    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 999 aa  2038    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  89.47 
 
 		 1381 aa  699    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  50.67 
 
 		 1086 aa  719    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  78.12 
 
 		 858 aa  641    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  87.28 
 
 		 1086 aa  695    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1730  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  83.82 
 
 		 1103 aa  634  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.747769  normal  0.0625523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1455  PAS sensor protein  83.82 
 
 		 1092 aa  635  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534076  normal  0.193101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3791  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  79.8 
 
 		 492 aa  635  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.107728 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  82.76 
 
 		 977 aa  632  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.416631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  80.37 
 
 		 695 aa  632  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.98 
 
 		 830 aa  627  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6183  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  79.85 
 
 		 916 aa  628  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.24256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.77 
 
 		 890 aa  626  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0752  ATPase domain-containing protein  78.43 
 
 		 537 aa  617  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  78.43 
 
 		 692 aa  616  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  78.43 
 
 		 573 aa  615  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.61 
 
 		 905 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  73.55 
 
 		 646 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  74.62 
 
 		 646 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  78.76 
 
 		 1022 aa  601  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  72.11 
 
 		 686 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  70.9 
 
 		 847 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  69.65 
 
 		 998 aa  582  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1778  PAS  73.38 
 
 		 956 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.584017  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3696  sensory box histidine kinase/response regulator  71.5 
 
 		 827 aa  571  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.652711  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  68.67 
 
 		 889 aa  572  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6214  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  70.02 
 
 		 772 aa  557  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.459564 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  67.42 
 
 		 1065 aa  535  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  67.68 
 
 		 1065 aa  533  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1830  multi-sensor hybrid histidine kinase  72.21 
 
 		 1165 aa  527  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  65.82 
 
 		 695 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  66.33 
 
 		 812 aa  521  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3532  PAS  61.82 
 
 		 691 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.804686  normal  0.0772354 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1870  sensory box histidine kinase/response regulator  60.84 
 
 		 691 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  65.59 
 
 		 814 aa  505  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486726  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  61.68 
 
 		 695 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0878  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  63.47 
 
 		 754 aa  481  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0508  multi-sensor hybrid histidine kinase  62.69 
 
 		 1215 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.722414  normal  0.07841 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4732  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.38 
 
 		 728 aa  469  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2450  PAS  59.1 
 
 		 676 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154072 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2717  sensory box histidine kinase/response regulator  57.61 
 
 		 676 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.230475  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2540  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 809 aa  456  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0036  histidine kinase  57.11 
 
 		 556 aa  453  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.526737  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  59.25 
 
 		 845 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  56.72 
 
 		 689 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.800994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0471  multi-sensor hybrid histidine kinase  61.95 
 
 		 1225 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221036  normal  0.153067 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0437  PAS sensor protein  60.93 
 
 		 1225 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719852  normal  0.440419 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3679  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  59.08 
 
 		 979 aa  442  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.138825  normal  0.0339746 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  59.9 
 
 		 941 aa  436  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2652  histidine kinase  58.42 
 
 		 556 aa  432  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.79 
 
 		 864 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0114  Signal transduction histidine kinase  59.79 
 
 		 939 aa  427  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.153209 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0712  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  57.47 
 
 		 827 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2780  histidine kinase  55.93 
 
 		 558 aa  424  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3298  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  55.73 
 
 		 922 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2377  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.91 
 
 		 688 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2228  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.81 
 
 		 688 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.899414 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3546  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.51 
 
 		 688 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1290  histidine kinase  50.99 
 
 		 573 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4726  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.96 
 
 		 625 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1201  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 		 548 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.642458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3208  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.63 
 
 		 622 aa  398  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0750823 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4076  histidine kinase  52.38 
 
 		 416 aa  395  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5389  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  58.29 
 
 		 762 aa  392  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5251  histidine kinase  47.69 
 
 		 571 aa  393  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.782087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1939  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.36 
 
 		 691 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0201512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.34 
 
 		 943 aa  388  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5761  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.92 
 
 		 708 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.28 
 
 		 966 aa  383  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1031  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.77 
 
 		 689 aa  382  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6011  histidine kinase  54.46 
 
 		 743 aa  380  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0568406  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1221  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  52.13 
 
 		 532 aa  379  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178023 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.68 
 
 		 789 aa  375  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.01 
 
 		 943 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  48.03 
 
 		 949 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  34.6 
 
 		 1036 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.03 
 
 		 949 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  47.42 
 
 		 1651 aa  369  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 		 740 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.62 
 
 		 688 aa  368  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121998  normal  0.468356 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2885  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.49 
 
 		 818 aa  366  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237924  normal  0.0700462 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.39 
 
 		 807 aa  365  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.61 
 
 		 789 aa  364  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.61 
 
 		 789 aa  364  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.46 
 
 		 1036 aa  364  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.61 
 
 		 1646 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2229  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.28 
 
 		 553 aa  363  8e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.638317 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.65 
 
 		 1631 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1684  histidine kinase  51.39 
 
 		 701 aa  357  8.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3545  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.33 
 
 		 553 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.70141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  47.93 
 
 		 726 aa  356  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1835  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.56 
 
 		 782 aa  354  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.448152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>