More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2540 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2540  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
809 aa  1634    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 
999 aa  450  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.88 
 
 
710 aa  365  2e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5205  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 
727 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5728  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 
727 aa  269  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 
905 aa  259  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.13 
 
 
960 aa  218  5e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  51.44 
 
 
1651 aa  204  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.8 
 
 
1631 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0038  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 
1043 aa  197  8.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.2 
 
 
1646 aa  196  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2103  histidine kinase  44.44 
 
 
382 aa  194  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2115  histidine kinase  44.8 
 
 
379 aa  193  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.8 
 
 
987 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0300  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.5 
 
 
887 aa  179  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328128  normal  0.0126688 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.41 
 
 
866 aa  171  6e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3437  sensory box histidine kinase  28.52 
 
 
533 aa  168  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 
941 aa  160  8e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.109629  normal  0.20707 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1193  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 
857 aa  159  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146062  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2299  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 
670 aa  159  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465317  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.19 
 
 
1202 aa  156  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 
1195 aa  155  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 
786 aa  155  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3012  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
556 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0214699  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3377  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 
775 aa  153  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
616 aa  152  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.459436  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2062  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 
951 aa  151  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.275424  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 
770 aa  151  6e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2811  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
738 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
626 aa  148  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.99 
 
 
878 aa  149  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0009  sensory box histidine kinase  36.44 
 
 
499 aa  147  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
1669 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4842  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 
1339 aa  147  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3195  histidine kinase  35.41 
 
 
354 aa  146  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107163  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  36.21 
 
 
492 aa  146  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
642 aa  145  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1296  histidine kinase  39.21 
 
 
378 aa  145  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.572141  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1796  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
756 aa  145  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.232536 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4114  histidine kinase  36.61 
 
 
268 aa  145  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0596823  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
575 aa  145  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2049  histidine kinase  35.36 
 
 
494 aa  144  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1145  multi-sensor signal transduction multi-kinase  31.8 
 
 
532 aa  144  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
483 aa  144  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0404114  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0255  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
525 aa  144  7e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
729 aa  144  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.9 
 
 
1086 aa  144  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
384 aa  143  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00811703  normal  0.288098 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  34.3 
 
 
604 aa  143  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40.33 
 
 
952 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  39.42 
 
 
1086 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.42 
 
 
1092 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
547 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0504248  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
1028 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  unclonable  0.0000177894 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2384  sensor histidine kinase  33.97 
 
 
614 aa  142  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  37.5 
 
 
733 aa  142  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4420  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 
922 aa  142  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0348998  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0731  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
536 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000138137  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 
396 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2639  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 
396 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.717158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
628 aa  141  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117845  decreased coverage  0.00612296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
591 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 
1118 aa  141  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
628 aa  141  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
817 aa  141  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
821 aa  141  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0539  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
751 aa  141  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.802089  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
639 aa  141  6e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5232  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.51 
 
 
698 aa  140  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2774  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 
535 aa  140  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  24.57 
 
 
749 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 
793 aa  140  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  33.2 
 
 
496 aa  140  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0383  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 
746 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.269133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4630  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.64 
 
 
845 aa  139  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3432  histidine kinase  35.37 
 
 
796 aa  139  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
479 aa  139  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0408317  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
517 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0255  sensory box histidine kinase  33.76 
 
 
616 aa  138  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1725  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
407 aa  138  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1531  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
643 aa  138  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
1532 aa  137  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
749 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541129  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1212  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
458 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.377857  hitchhiker  0.00290095 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
789 aa  137  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2742  sensory box histidine kinase  31.08 
 
 
363 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.507187  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.63 
 
 
553 aa  137  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
515 aa  137  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3347  sensor histidine kinase  33.61 
 
 
1020 aa  137  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0678  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
721 aa  137  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146546  normal  0.0234435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
529 aa  137  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481885  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
748 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2567  sensor histidine kinase  34.14 
 
 
583 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2356  phytochrome family protein, putative  36.56 
 
 
755 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
1807 aa  137  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
380 aa  137  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
502 aa  136  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1956  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
748 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727974  normal  0.121547 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2876  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
930 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3764  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
538 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180542  normal  0.0415669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>