More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4415 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 		 769 aa  653    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1003  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  55.8 
 
 		 751 aa  867    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.972748  hitchhiker  0.000165551 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3852  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  46.65 
 
 		 765 aa  669    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.04 
 
 		 760 aa  644    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4111  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.04 
 
 		 760 aa  644    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 749 aa  1551    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541129  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.45 
 
 		 760 aa  712    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2818  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 		 769 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0945314 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 		 775 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3425  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.12 
 
 		 775 aa  588  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0531418  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2403  ATP-binding region, ATPase-like  40.32 
 
 		 776 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.92 
 
 		 779 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689927  normal  0.970382 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0539  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 		 751 aa  553  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.802089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 		 762 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15596  normal  0.128973 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2402  ATP-binding region, ATPase-like  39.36 
 
 		 762 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0299776 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4270  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 751 aa  531  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.235212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3424  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 		 758 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 		 758 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2377  ATP-binding region, ATPase-like  38 
 
 		 759 aa  529  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.974028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0383  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 746 aa  525  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.269133 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 		 774 aa  515  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.960478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1956  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 		 748 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727974  normal  0.121547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2356  phytochrome family protein, putative  38.07 
 
 		 755 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1796  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 756 aa  509  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.232536 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 748 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.48 
 
 		 791 aa  505  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0125  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 759 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.812946  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 		 1002 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0099  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 746 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 		 1002 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 		 1002 aa  478  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4021  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 		 1013 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 799 aa  449  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721204  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2162  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 745 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3185  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 762 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97115  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1902  bacteriophytochrome histidine kinase  35.6 
 
 		 745 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333534  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2910  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 783 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0200681  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2793  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 763 aa  429  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172208  normal  0.714834 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3504  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.31 
 
 		 745 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.280312  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2652  bacteriophytochrome, putative  35.46 
 
 		 993 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.163581  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4127  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 743 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313016  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  35.11 
 
 		 1003 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  38.1 
 
 		 772 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0150  phytochrome sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 752 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3141  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 762 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583701  normal  0.345899 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 775 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 		 771 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 757 aa  388  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3820  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 755 aa  388  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  40.19 
 
 		 783 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  43 
 
 		 755 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  39.21 
 
 		 770 aa  356  7.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  38.17 
 
 		 772 aa  352  1e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3914  Phytochrome central region domain protein  36.9 
 
 		 509 aa  351  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.218618 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.4 
 
 		 849 aa  351  3e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3673  putative PAS/PAC sensor protein  39.49 
 
 		 738 aa  350  5e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.483009  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  37.38 
 
 		 842 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1986  putative GAF sensor protein  36.52 
 
 		 798 aa  334  3e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.932658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3458  putative PAS/PAC sensor protein  37.67 
 
 		 760 aa  333  7.000000000000001e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0932578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3740  phytochrome  35.06 
 
 		 732 aa  327  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103591  decreased coverage  0.000116427 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0975  putative bacteriophytochrome  32.02 
 
 		 728 aa  324  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1309  putative PAS/PAC sensor protein  34.87 
 
 		 722 aa  323  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.543635 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  36.83 
 
 		 856 aa  321  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10700  putative bacteriophytochrome  31.87 
 
 		 728 aa  320  5e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3985  putative PAS/PAC sensor protein  34.29 
 
 		 732 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525883  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1726  putative PAS/PAC sensor protein  34.07 
 
 		 731 aa  312  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  36 
 
 		 855 aa  311  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7207  putative PAS/PAC sensor protein  33.93 
 
 		 508 aa  307  5.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  29.91 
 
 		 895 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 875 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 		 709 aa  303  8.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2169  putative GAF sensor protein  31.67 
 
 		 812 aa  300  6e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0312851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 874 aa  299  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6428  bacteriophytochrome  32.89 
 
 		 723 aa  295  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 770 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  32.99 
 
 		 852 aa  293  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 		 871 aa  291  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.73 
 
 		 844 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2978  putative GAF sensor protein  34.57 
 
 		 567 aa  284  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186  normal  0.0306937 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00897  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  27.96 
 
 		 884 aa  284  5.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.717501  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  33.86 
 
 		 844 aa  283  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03310  GAF domain protein  34.4 
 
 		 625 aa  279  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0453757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 864 aa  277  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with phytochrome (GAF) sensor  31.62 
 
 		 980 aa  270  8e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03481  Multi-sensor Signal Transduction Histidine Kinase  27.41 
 
 		 908 aa  269  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0652805  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4111  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with phytochrome (GAF) sensor  31.69 
 
 		 931 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.87 
 
 		 847 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  32.89 
 
 		 847 aa  268  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 721 aa  267  4e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  33.14 
 
 		 847 aa  267  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.65 
 
 		 846 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  31.54 
 
 		 856 aa  265  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1235  phytochrome-like protein  31.15 
 
 		 506 aa  266  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4279  diguanylate phosphodiesterase  33.27 
 
 		 936 aa  265  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3089  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 740 aa  259  9e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.552133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2235  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.27 
 
 		 865 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1497  putative GAF sensor protein  30.28 
 
 		 689 aa  246  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0285  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.5 
 
 		 713 aa  238  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0316  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  50.64 
 
 		 713 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01099  bacteriophytochrome protein  31.47 
 
 		 822 aa  217  7e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.506628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>