More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1447 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1028 aa  2120    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  unclonable  0.0000177894 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1862  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 
869 aa  269  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.557725  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
1267 aa  263  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 
817 aa  261  6e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
883 aa  256  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 
1669 aa  253  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 
821 aa  248  4e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 
904 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 
1807 aa  230  8e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 
1195 aa  228  5.0000000000000005e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 
1060 aa  226  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
683 aa  226  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.78 
 
 
767 aa  224  7e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 
793 aa  223  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3820  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
881 aa  223  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 
891 aa  220  8.999999999999998e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
1029 aa  217  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645634  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.53 
 
 
435 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.652277 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.63 
 
 
628 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
368 aa  216  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
678 aa  215  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.541226  hitchhiker  0.00764394 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0668  histidine kinase  47.04 
 
 
700 aa  214  9e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0742794 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2837  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 
716 aa  214  9e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1660  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
781 aa  213  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2049  histidine kinase  45.57 
 
 
494 aa  213  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 
1140 aa  213  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.67 
 
 
903 aa  212  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.644945  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3150  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.02 
 
 
408 aa  211  8e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.8 
 
 
380 aa  209  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.49 
 
 
1153 aa  209  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
799 aa  208  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190357  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1676  histidine kinase  33.86 
 
 
881 aa  208  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  55 
 
 
886 aa  208  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2176  histidine kinase  34.13 
 
 
520 aa  207  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.955283 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.54 
 
 
960 aa  207  8e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
1064 aa  206  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 
674 aa  206  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01275  putative two-component sensor histidine kinase  41.43 
 
 
503 aa  206  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590202  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2907  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 
520 aa  206  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
786 aa  205  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
575 aa  204  5e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0991  histidine kinase  42.11 
 
 
462 aa  204  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
1172 aa  204  6e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.54 
 
 
1499 aa  204  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.87 
 
 
639 aa  204  7e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1663  sensor for ctr capsule biosynthesis, histidine kinase acting on RcsB  24.49 
 
 
1093 aa  204  9e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.749752  normal  0.503363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2719  histidine kinase  41.9 
 
 
490 aa  204  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.369287 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2062  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 
951 aa  204  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.275424  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0262  bacteriophytochrome-like protein  42.8 
 
 
505 aa  204  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.268371 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 
710 aa  204  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
809 aa  204  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 
775 aa  203  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4154  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 
493 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 
1532 aa  202  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1901  two-component sensor histidine kinase  42.52 
 
 
931 aa  202  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0313083  normal  0.0871787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 
829 aa  202  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.254263  normal  0.520462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4420  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 
922 aa  201  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0348998  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.21 
 
 
626 aa  201  6e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2794  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.13 
 
 
767 aa  201  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470571 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1725  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 
407 aa  201  9e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 
973 aa  200  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2607  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.87 
 
 
1144 aa  200  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3100  histidine kinase  41 
 
 
573 aa  199  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.25 
 
 
642 aa  199  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0795  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
911 aa  198  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.403179  normal  0.168088 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2403  ATP-binding region, ATPase-like  45.04 
 
 
776 aa  197  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.22 
 
 
774 aa  198  6e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00413354  normal  0.0431838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3730  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 
978 aa  197  7e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208606  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3202  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.78 
 
 
896 aa  197  9e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4322  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 
969 aa  197  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3954  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 
792 aa  196  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.75 
 
 
729 aa  197  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 
761 aa  196  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3347  sensor histidine kinase  31.89 
 
 
1020 aa  195  5e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 
828 aa  194  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.419482 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
838 aa  194  9e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
770 aa  194  9e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2691  hypothetical protein  33.14 
 
 
800 aa  194  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.337462  normal  0.0535481 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 
1267 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 
713 aa  194  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
361 aa  194  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0994  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 
640 aa  193  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620121  normal  0.0418978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 
566 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 
515 aa  192  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4842  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 
1339 aa  192  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0386  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.82 
 
 
674 aa  192  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.963585  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3764  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
538 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180542  normal  0.0415669 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.19 
 
 
1297 aa  191  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 
929 aa  191  5.999999999999999e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.98 
 
 
1252 aa  191  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.758591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5844  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  35.99 
 
 
529 aa  191  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.533062 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
1359 aa  191  8e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 
798 aa  190  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.505413  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 
628 aa  190  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117845  decreased coverage  0.00612296 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22960  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  39.83 
 
 
552 aa  189  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4114  histidine kinase  41.03 
 
 
268 aa  189  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0596823  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.03 
 
 
384 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00811703  normal  0.288098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1125  histidine kinase  42.57 
 
 
564 aa  189  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2215  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
810 aa  189  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
789 aa  189  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>