More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4599 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1029 aa  2132    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645634  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
1060 aa  603  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
1172 aa  541  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1676  histidine kinase  35.79 
 
 
881 aa  446  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0795  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
911 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.403179  normal  0.168088 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6533  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
636 aa  342  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.920736  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2882  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.34 
 
 
528 aa  342  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0386  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 
674 aa  280  8e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.963585  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2176  histidine kinase  39.65 
 
 
520 aa  275  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.955283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2064  histidine kinase  41.56 
 
 
602 aa  275  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246858  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.22 
 
 
435 aa  255  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.652277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.63 
 
 
1153 aa  243  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2794  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.04 
 
 
767 aa  243  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.26 
 
 
713 aa  241  5e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
628 aa  240  9e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3820  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.28 
 
 
881 aa  240  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4322  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.12 
 
 
969 aa  238  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3730  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.13 
 
 
978 aa  238  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208606  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3100  histidine kinase  43.84 
 
 
573 aa  237  7e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3917  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.66 
 
 
683 aa  236  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.465717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.12 
 
 
829 aa  235  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.254263  normal  0.520462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.61 
 
 
678 aa  233  9e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.541226  hitchhiker  0.00764394 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.79 
 
 
809 aa  233  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.33 
 
 
828 aa  231  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.419482 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01275  putative two-component sensor histidine kinase  45.56 
 
 
503 aa  230  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590202  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1748  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.47 
 
 
550 aa  228  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
1195 aa  226  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
1807 aa  226  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.98 
 
 
799 aa  225  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190357  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
821 aa  224  6e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0262  bacteriophytochrome-like protein  45.42 
 
 
505 aa  223  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.268371 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4154  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.53 
 
 
493 aa  219  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
817 aa  217  9e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2719  histidine kinase  45.16 
 
 
490 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.369287 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
1028 aa  217  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  unclonable  0.0000177894 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.19 
 
 
775 aa  215  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1901  two-component sensor histidine kinase  42.8 
 
 
931 aa  215  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0313083  normal  0.0871787 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
767 aa  213  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2837  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46 
 
 
716 aa  213  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 
681 aa  211  6e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1656  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.12 
 
 
478 aa  210  9e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.999121 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4842  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 
1339 aa  208  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 
1064 aa  206  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.75 
 
 
779 aa  206  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689927  normal  0.970382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  42.47 
 
 
1499 aa  206  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0668  histidine kinase  42.01 
 
 
700 aa  206  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0742794 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1862  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 
869 aa  205  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.557725  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 
1267 aa  204  5e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.39 
 
 
1669 aa  204  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
639 aa  204  6e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5080  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
677 aa  203  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
883 aa  202  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 
642 aa  202  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 
710 aa  202  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.98 
 
 
798 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.505413  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3764  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 
538 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180542  normal  0.0415669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0108  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 
827 aa  201  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4928  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.82 
 
 
659 aa  201  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0222332  normal  0.944106 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
838 aa  201  7e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0991  histidine kinase  40.68 
 
 
462 aa  200  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2403  ATP-binding region, ATPase-like  42.25 
 
 
776 aa  200  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1675  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 
558 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0567929 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 
674 aa  199  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 
1532 aa  199  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 
368 aa  199  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3150  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 
408 aa  198  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 
1068 aa  197  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 
1140 aa  196  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3546  sensor protein (histidine protein kinase), acting on arcA  40.58 
 
 
586 aa  196  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00933538  normal  0.0548176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.02 
 
 
828 aa  195  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.725659  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
575 aa  195  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4114  histidine kinase  41.13 
 
 
268 aa  195  4e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0596823  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3338  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.98 
 
 
526 aa  195  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782598 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3202  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
896 aa  194  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.13 
 
 
683 aa  194  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0899  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 
491 aa  192  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1660  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
781 aa  192  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1007  sensory box histidine kinase  39.56 
 
 
812 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.572876  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 
361 aa  192  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 
793 aa  192  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 
786 aa  192  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3425  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
775 aa  192  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0531418  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1663  sensor for ctr capsule biosynthesis, histidine kinase acting on RcsB  24.02 
 
 
1093 aa  192  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.749752  normal  0.503363 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 
789 aa  191  5e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2907  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 
520 aa  191  5.999999999999999e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0331  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 
929 aa  191  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.590564 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1083  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
973 aa  190  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1036  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 
527 aa  189  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 
1013 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
774 aa  189  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00413354  normal  0.0431838 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2316  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 
594 aa  188  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574326  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 
551 aa  188  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 
729 aa  188  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1725  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 
407 aa  188  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 
761 aa  188  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 
960 aa  187  8e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4011  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 
418 aa  187  9e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.139178  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4338  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 
430 aa  187  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.743404  decreased coverage  0.000431263 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2215  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 
810 aa  187  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3347  sensor histidine kinase  38.24 
 
 
1020 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0428099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>