More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4928 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4928  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
659 aa  1377    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0222332  normal  0.944106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3917  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
683 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.465717 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1067  sensor histidine kinase  37.86 
 
 
666 aa  279  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1901  two-component sensor histidine kinase  30.09 
 
 
931 aa  272  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0313083  normal  0.0871787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3640  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  28.9 
 
 
1303 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.581797 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
829 aa  262  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.254263  normal  0.520462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0331  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
929 aa  262  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.590564 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0338  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.73 
 
 
568 aa  250  6e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127973  decreased coverage  0.00024777 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
1669 aa  240  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0108  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.61 
 
 
827 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1663  sensor for ctr capsule biosynthesis, histidine kinase acting on RcsB  46.15 
 
 
1093 aa  238  4e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.749752  normal  0.503363 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.39 
 
 
1013 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7206  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  44.25 
 
 
1499 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4842  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
1339 aa  233  7.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.86 
 
 
799 aa  230  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190357  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 
628 aa  229  8e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1881  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.15 
 
 
435 aa  229  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.652277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4322  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.85 
 
 
969 aa  227  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.71 
 
 
1010 aa  225  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4154  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.49 
 
 
493 aa  225  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0262  bacteriophytochrome-like protein  45.85 
 
 
505 aa  223  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.268371 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1215  sensor for regulator EvgA  32.58 
 
 
553 aa  218  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0300686  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.99 
 
 
1153 aa  217  7e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0394  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
531 aa  216  8e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4420  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 
922 aa  216  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0348998  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0795  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.75 
 
 
911 aa  215  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.403179  normal  0.168088 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.46 
 
 
713 aa  213  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2176  histidine kinase  48.35 
 
 
520 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.955283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2719  histidine kinase  45.11 
 
 
490 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.369287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2794  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.24 
 
 
767 aa  212  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
678 aa  212  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.541226  hitchhiker  0.00764394 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01275  putative two-component sensor histidine kinase  38.73 
 
 
503 aa  209  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.590202  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3730  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.06 
 
 
978 aa  209  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208606  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 
1172 aa  209  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3764  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 
538 aa  208  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180542  normal  0.0415669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1036  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.19 
 
 
527 aa  208  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3820  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.28 
 
 
881 aa  207  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 
828 aa  207  6e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.725659  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0991  histidine kinase  46.06 
 
 
462 aa  207  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2168  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.7 
 
 
828 aa  206  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.419482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3100  histidine kinase  46.47 
 
 
573 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 
809 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1748  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.81 
 
 
550 aa  204  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0386  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 
674 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.963585  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 
506 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546822  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0291  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.05 
 
 
543 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.808463 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1676  histidine kinase  42.11 
 
 
881 aa  201  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 
883 aa  201  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.82 
 
 
1029 aa  201  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645634  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 
571 aa  201  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0945672  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3347  sensor histidine kinase  28.42 
 
 
1020 aa  200  7.999999999999999e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3338  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.76 
 
 
526 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00782598 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0668  histidine kinase  44.15 
 
 
700 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0742794 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6533  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.84 
 
 
636 aa  199  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.920736  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1237  chemotaxis response regulator (methyltransferase)  29.92 
 
 
1618 aa  197  5.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 
532 aa  197  6e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.030472 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3150  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.53 
 
 
408 aa  196  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2882  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 
528 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 
1140 aa  196  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.14 
 
 
1060 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6522  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.25 
 
 
556 aa  196  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.07 
 
 
1195 aa  196  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3360  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
1068 aa  194  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  29.13 
 
 
1019 aa  194  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3546  sensor protein (histidine protein kinase), acting on arcA  40 
 
 
586 aa  194  4e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00933538  normal  0.0548176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3355  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.7 
 
 
405 aa  193  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4479  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 
502 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
770 aa  192  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
380 aa  192  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
681 aa  191  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1862  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
869 aa  190  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.557725  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1725  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 
407 aa  190  7e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 
1064 aa  189  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2084  sensor for ctr capsule biosynthesis; sensor histidine kinase  40.15 
 
 
660 aa  189  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 
767 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 
642 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 
529 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481885  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
1118 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 
529 aa  188  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.633654  normal  0.687189 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  41.87 
 
 
821 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  41.87 
 
 
821 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 
821 aa  187  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  41.87 
 
 
821 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  41.87 
 
 
723 aa  187  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22960  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  43.36 
 
 
552 aa  187  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3046  two-component sensor histidine kinase  40.74 
 
 
515 aa  187  5e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3846  normal  0.30289 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  41.87 
 
 
723 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  41.87 
 
 
723 aa  187  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  41.87 
 
 
723 aa  187  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 
527 aa  187  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.521326 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 
527 aa  187  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151228  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2733  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 
527 aa  187  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal  0.282473 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 
502 aa  187  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 
710 aa  187  7e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3202  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
896 aa  186  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
793 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 
817 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5034  histidine kinase  43.33 
 
 
498 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 
890 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3485  histidine kinase  39.39 
 
 
565 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>