More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2096 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.97 
 
 		 1153 aa  783    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 1118 aa  783    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  48.3 
 
 		 1202 aa  755    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.82 
 
 		 1370 aa  667    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  49.93 
 
 		 1152 aa  681    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  42.13 
 
 		 1299 aa  784    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.79 
 
 		 1431 aa  824    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.91 
 
 		 1711 aa  803    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.56 
 
 		 1631 aa  706    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.31 
 
 		 1010 aa  713    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.38 
 
 		 1426 aa  758    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.99 
 
 		 1406 aa  723    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.11 
 
 		 1003 aa  659    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  50.32 
 
 		 1651 aa  689    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  46.83 
 
 		 1427 aa  766    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 		 1131 aa  766    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1140 aa  2271    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.27 
 
 		 1390 aa  741    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.31 
 
 		 1383 aa  718    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.22 
 
 		 1415 aa  768    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  51.91 
 
 		 1514 aa  774    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  51.17 
 
 		 1002 aa  751    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.39 
 
 		 1646 aa  687    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  53.85 
 
 		 1048 aa  698    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.27 
 
 		 1390 aa  741    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.31 
 
 		 1385 aa  753    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.27 
 
 		 1390 aa  741    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.3 
 
 		 1361 aa  730    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.03 
 
 		 1559 aa  657    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  52.04 
 
 		 1514 aa  775    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.29 
 
 		 1287 aa  717    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.31 
 
 		 1248 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 		 1013 aa  599  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.38 
 
 		 1383 aa  586  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  48.38 
 
 		 919 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.9 
 
 		 1051 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.36 
 
 		 1645 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02240  protein-histidine kinase, putative  31.25 
 
 		 1816 aa  397  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02350  protein-histidine kinase, putative  29.22 
 
 		 1614 aa  396  1e-108  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16806  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 978 aa  324  7e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.69 
 
 		 975 aa  311  4e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.09 
 
 		 1036 aa  303  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  41.51 
 
 		 1156 aa  298  5e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  41.88 
 
 		 1180 aa  297  8e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.49 
 
 		 1301 aa  283  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2885  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.43 
 
 		 818 aa  281  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237924  normal  0.0700462 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.18 
 
 		 889 aa  281  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  36.6 
 
 		 1172 aa  276  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  36.99 
 
 		 1418 aa  273  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 		 626 aa  272  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.69 
 
 		 761 aa  271  5.9999999999999995e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  37.32 
 
 		 1366 aa  270  8e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0667  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 		 929 aa  271  8e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  37.74 
 
 		 1311 aa  268  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 		 960 aa  267  8.999999999999999e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2179  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.73 
 
 		 710 aa  267  8.999999999999999e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.312055 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.86 
 
 		 770 aa  263  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.57 
 
 		 502 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 934 aa  257  1.0000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  36.78 
 
 		 904 aa  255  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.75 
 
 		 683 aa  251  5e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1660  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.52 
 
 		 781 aa  250  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1703  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  42.9 
 
 		 368 aa  249  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.301457  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  34.11 
 
 		 1373 aa  247  6.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  32.71 
 
 		 1374 aa  247  8e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.61 
 
 		 529 aa  247  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.633654  normal  0.687189 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  36.75 
 
 		 1378 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 		 660 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1656  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.18 
 
 		 478 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.999121 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  32.16 
 
 		 1384 aa  244  6e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3546  sensor protein (histidine protein kinase), acting on arcA  35.59 
 
 		 586 aa  244  7e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00933538  normal  0.0548176 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2531  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 880 aa  244  7.999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  36.73 
 
 		 1344 aa  243  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.95 
 
 		 628 aa  243  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  34.79 
 
 		 1341 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  29.53 
 
 		 1373 aa  242  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.6 
 
 		 1267 aa  242  4e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  37.43 
 
 		 876 aa  241  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8461  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  49 
 
 		 528 aa  241  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.93 
 
 		 628 aa  241  5e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117845  decreased coverage  0.00612296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  35.21 
 
 		 1306 aa  240  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 384 aa  240  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00811703  normal  0.288098 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3046  two-component sensor histidine kinase  39.86 
 
 		 515 aa  238  4e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3846  normal  0.30289 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.52 
 
 		 575 aa  238  4e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22960  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  48.61 
 
 		 552 aa  238  5.0000000000000005e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.282071 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  35.28 
 
 		 1343 aa  238  6e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.57 
 
 		 639 aa  237  1.0000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6522  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.45 
 
 		 556 aa  236  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  33.56 
 
 		 1370 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0908  sensory box histidine kinase  50.41 
 
 		 723 aa  235  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1934  two-component sensor kinase protein  50.41 
 
 		 723 aa  235  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1844  sensory box histidine kinase  50.41 
 
 		 723 aa  235  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167823  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0382  sensory box histidine kinase  50.41 
 
 		 723 aa  235  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5360  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.61 
 
 		 515 aa  235  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0474  sensory box histidine kinase  46.91 
 
 		 821 aa  235  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0174  sensory box histidine kinase  46.91 
 
 		 821 aa  235  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1434  sensory box histidine kinase  46.91 
 
 		 821 aa  235  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  32.52 
 
 		 1366 aa  234  9e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 823 aa  234  9e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  31.43 
 
 		 1340 aa  233  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>