More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1931 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  68.53 
 
 
1390 aa  1802    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.17 
 
 
1383 aa  1139    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  47.58 
 
 
1514 aa  680    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.55 
 
 
1406 aa  672    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.82 
 
 
1002 aa  671    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  55.75 
 
 
1370 aa  1348    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  43.71 
 
 
1202 aa  639    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.19 
 
 
1431 aa  754    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 
1383 aa  646    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.44 
 
 
1415 aa  713    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.56 
 
 
1426 aa  731    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  77.59 
 
 
1361 aa  2088    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.63 
 
 
1248 aa  1137    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  47.23 
 
 
1651 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  51 
 
 
1299 aa  710    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  45.16 
 
 
1427 aa  722    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.27 
 
 
1131 aa  642    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.31 
 
 
1140 aa  744    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  50.07 
 
 
1631 aa  663    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  68.38 
 
 
1390 aa  1802    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  47.45 
 
 
1514 aa  680    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  68.38 
 
 
1390 aa  1802    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1385 aa  2756    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50.27 
 
 
1048 aa  671    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.92 
 
 
1646 aa  636    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  54.63 
 
 
1711 aa  873    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  48.27 
 
 
1152 aa  635  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.93 
 
 
1010 aa  635  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.8 
 
 
1003 aa  631  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.78 
 
 
1559 aa  607  9.999999999999999e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  63.47 
 
 
828 aa  592  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.28 
 
 
1118 aa  588  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  60.68 
 
 
851 aa  583  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 
1153 aa  579  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 
1013 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.92 
 
 
1287 aa  563  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.31 
 
 
1051 aa  545  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  44.71 
 
 
919 aa  535  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02240  protein-histidine kinase, putative  32.47 
 
 
1816 aa  424  1e-117  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.21 
 
 
1645 aa  416  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02350  protein-histidine kinase, putative  29.94 
 
 
1614 aa  371  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16806  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.91 
 
 
1036 aa  306  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  37.75 
 
 
1156 aa  293  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  34.92 
 
 
1180 aa  283  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  36.11 
 
 
1172 aa  279  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.22 
 
 
889 aa  277  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  37.5 
 
 
1311 aa  271  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  37.88 
 
 
1366 aa  270  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 
975 aa  267  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  37.71 
 
 
904 aa  253  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  37.48 
 
 
876 aa  251  9e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  36.09 
 
 
1344 aa  250  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  32.81 
 
 
1374 aa  250  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2885  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.66 
 
 
818 aa  249  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0237924  normal  0.0700462 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 
934 aa  249  2e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 
978 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  33.97 
 
 
1378 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  34.5 
 
 
1343 aa  241  9e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  31.48 
 
 
1384 aa  241  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  34.7 
 
 
1366 aa  239  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  33.82 
 
 
1370 aa  238  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  34.62 
 
 
1306 aa  237  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.05 
 
 
1301 aa  235  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  34.9 
 
 
1355 aa  235  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  31.92 
 
 
1347 aa  233  3e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  32.49 
 
 
1373 aa  230  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  33.18 
 
 
1378 aa  230  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  34.64 
 
 
1418 aa  229  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  33.73 
 
 
1355 aa  228  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  33.11 
 
 
1344 aa  227  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
816 aa  226  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  30.51 
 
 
1340 aa  226  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  33.41 
 
 
1341 aa  224  6e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  32.44 
 
 
677 aa  224  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  29.19 
 
 
1373 aa  223  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  32.55 
 
 
1335 aa  221  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  32.39 
 
 
1397 aa  219  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  32.59 
 
 
816 aa  219  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  35.8 
 
 
663 aa  219  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  27.67 
 
 
1400 aa  218  9e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 
1002 aa  216  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3061  ATP-binding region ATPase domain protein  32.54 
 
 
863 aa  212  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141845  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  31.32 
 
 
1298 aa  212  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  31.93 
 
 
1374 aa  211  7e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  36.52 
 
 
537 aa  211  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  32.11 
 
 
940 aa  209  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  28.8 
 
 
1133 aa  208  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.89 
 
 
823 aa  209  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  33.25 
 
 
1349 aa  207  8e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.85 
 
 
703 aa  207  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  30.9 
 
 
1526 aa  205  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 
1358 aa  200  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
979 aa  200  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  33.71 
 
 
1313 aa  200  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  27.97 
 
 
1376 aa  200  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 
963 aa  199  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.44 
 
 
727 aa  199  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.7 
 
 
727 aa  197  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  32.81 
 
 
1324 aa  197  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  32.48 
 
 
1404 aa  197  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>