More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6165 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  34.68 
 
 		 1347 aa  734    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  32.21 
 
 		 1400 aa  711    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  34.72 
 
 		 1374 aa  785    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  34.7 
 
 		 1370 aa  810    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  31.72 
 
 		 1378 aa  702    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  33.04 
 
 		 1340 aa  732    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  31.07 
 
 		 1334 aa  658    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  31.94 
 
 		 1363 aa  695    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  32.08 
 
 		 1347 aa  717    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  31.66 
 
 		 1378 aa  737    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  33.8 
 
 		 1374 aa  821    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  35.15 
 
 		 1355 aa  856    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  100 
 
 		 1397 aa  2908    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  31.66 
 
 		 1388 aa  723    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  31.15 
 
 		 1373 aa  644    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  32.17 
 
 		 1373 aa  692    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  31.23 
 
 		 1384 aa  681    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  31.67 
 
 		 1366 aa  694    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  31.11 
 
 		 1342 aa  709    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  33.5 
 
 		 1306 aa  756    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  33.2 
 
 		 1407 aa  649    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  29.38 
 
 		 1404 aa  635  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  30.65 
 
 		 1355 aa  626  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  30.03 
 
 		 1418 aa  624  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  29.18 
 
 		 1327 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  31.66 
 
 		 1526 aa  605  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  30.68 
 
 		 1335 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  29.76 
 
 		 1349 aa  587  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  33.45 
 
 		 1105 aa  577  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  29.46 
 
 		 1344 aa  571  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  29.98 
 
 		 1313 aa  570  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  30.65 
 
 		 1324 aa  569  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  28.91 
 
 		 1316 aa  565  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 1258 aa  549  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  29.31 
 
 		 1396 aa  543  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  29.44 
 
 		 1278 aa  543  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  29 
 
 		 1343 aa  540  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  27.93 
 
 		 1374 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  31.17 
 
 		 1070 aa  494  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  27.78 
 
 		 1298 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  30.03 
 
 		 1070 aa  473  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  25.75 
 
 		 1414 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  28.05 
 
 		 1311 aa  460  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  29.42 
 
 		 1093 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  26.75 
 
 		 1376 aa  453  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  28.9 
 
 		 1086 aa  446  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  30.71 
 
 		 1344 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 		 1498 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  29.08 
 
 		 1054 aa  406  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  28.53 
 
 		 1366 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  30.67 
 
 		 1278 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  25.66 
 
 		 1296 aa  387  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.06 
 
 		 1079 aa  382  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  27.72 
 
 		 1118 aa  370  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  28.48 
 
 		 1053 aa  350  9e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  26.31 
 
 		 1114 aa  344  8e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  35.73 
 
 		 934 aa  342  2.9999999999999998e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  28.86 
 
 		 1063 aa  333  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  30.25 
 
 		 1024 aa  332  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  36.21 
 
 		 940 aa  326  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  24.91 
 
 		 1084 aa  320  9e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  24.67 
 
 		 1351 aa  318  6e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4600  two component regulator propeller domain protein  28.44 
 
 		 1194 aa  317  9e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 904 aa  313  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  24.96 
 
 		 1346 aa  311  5.9999999999999995e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.22 
 
 		 1276 aa  299  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  27.25 
 
 		 1250 aa  294  8e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  25.36 
 
 		 1017 aa  293  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3042  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  23.93 
 
 		 1181 aa  287  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.227036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 1341 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  24.36 
 
 		 1175 aa  285  6.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 1237 aa  285  6.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  27.09 
 
 		 1034 aa  278  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0341  sensory box protein  27.71 
 
 		 1515 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 		 677 aa  274  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  23.84 
 
 		 1185 aa  271  8e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.38 
 
 		 1505 aa  269  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01690  histidine kinase-response regulator hybrid protein  24.69 
 
 		 1191 aa  268  8e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  32.64 
 
 		 663 aa  267  8e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0311  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.36 
 
 		 1504 aa  261  6e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3633  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.24 
 
 		 1504 aa  260  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  29.48 
 
 		 993 aa  259  3e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  31.45 
 
 		 961 aa  250  1e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 		 1431 aa  249  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2353  signal transduction histidine kinase, LytS  23.66 
 
 		 1021 aa  246  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  26.54 
 
 		 1004 aa  245  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4052  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.89 
 
 		 1508 aa  244  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 1048 aa  243  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.18 
 
 		 1514 aa  241  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1905  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 		 668 aa  240  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0295515  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  33.4 
 
 		 1427 aa  239  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.6 
 
 		 1514 aa  239  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 1002 aa  239  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2298  histidine kinase  25.91 
 
 		 1093 aa  238  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 		 1226 aa  238  7e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 1426 aa  234  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 		 1390 aa  233  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3950  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.41 
 
 		 1508 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 		 1390 aa  233  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 		 1415 aa  233  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>