More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1764 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  100 
 
 
1093 aa  2210    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  93.78 
 
 
1086 aa  2051    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  31.2 
 
 
1363 aa  477  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  30.36 
 
 
1355 aa  468  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  29.81 
 
 
1407 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  29.75 
 
 
1370 aa  458  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  29.87 
 
 
1374 aa  459  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  29.77 
 
 
1397 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  29.34 
 
 
1378 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  28.42 
 
 
1070 aa  426  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  29.27 
 
 
1347 aa  424  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  30.09 
 
 
1400 aa  422  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  26.59 
 
 
1342 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  29.45 
 
 
1340 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  26.67 
 
 
1378 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  28.99 
 
 
1070 aa  416  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  27.79 
 
 
1388 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  26.9 
 
 
1526 aa  405  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  27.86 
 
 
1105 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  28.18 
 
 
1306 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  29.31 
 
 
1118 aa  397  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  27.64 
 
 
1366 aa  386  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  28.6 
 
 
1374 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
1258 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  27.32 
 
 
1327 aa  365  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  27.51 
 
 
1334 aa  365  3e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  29.53 
 
 
1054 aa  364  4e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  26.67 
 
 
1418 aa  354  4e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.08 
 
 
1498 aa  354  5e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  26.88 
 
 
1396 aa  354  5.9999999999999994e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  28.18 
 
 
1373 aa  350  7e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  27.65 
 
 
1351 aa  350  8e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  27.93 
 
 
1316 aa  346  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  26.23 
 
 
1404 aa  339  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  24.47 
 
 
1346 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  26.25 
 
 
1355 aa  335  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  25.9 
 
 
1114 aa  331  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  27.42 
 
 
1313 aa  329  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  27.28 
 
 
1384 aa  327  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  27.03 
 
 
1024 aa  327  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  25.55 
 
 
1349 aa  326  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  23.26 
 
 
1175 aa  318  3e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  26.84 
 
 
1373 aa  315  3.9999999999999997e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  27.44 
 
 
1344 aa  310  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  23.64 
 
 
1278 aa  307  6e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  26.69 
 
 
1335 aa  300  7e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  25.37 
 
 
1343 aa  298  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  25.54 
 
 
1311 aa  290  9e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  26.13 
 
 
1053 aa  281  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  25.8 
 
 
1298 aa  274  7e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  25.69 
 
 
1324 aa  273  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  24.23 
 
 
1344 aa  271  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  22.31 
 
 
1185 aa  271  4e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  25.02 
 
 
1347 aa  269  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 
1237 aa  268  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.03 
 
 
1079 aa  267  8.999999999999999e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4052  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.55 
 
 
1508 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0341  sensory box protein  26.78 
 
 
1515 aa  262  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3042  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  22.24 
 
 
1181 aa  262  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.227036  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.04 
 
 
1226 aa  262  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4026  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.6 
 
 
1508 aa  261  4e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3648  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.97 
 
 
1511 aa  261  7e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  24.88 
 
 
1374 aa  259  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3950  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.03 
 
 
1508 aa  258  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  25.44 
 
 
1250 aa  258  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3633  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.8 
 
 
1504 aa  257  7e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4145  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.29 
 
 
1508 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.18 
 
 
1242 aa  256  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0311  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.2 
 
 
1504 aa  256  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0415  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.33 
 
 
1486 aa  255  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05925  GGDEF domain protein  25.33 
 
 
1005 aa  255  3e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0605  histidine kinase  23.78 
 
 
1190 aa  254  5.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0688  histidine kinase/response regulator hybrid protein  23.99 
 
 
1179 aa  248  4e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  23.45 
 
 
1063 aa  248  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  24.33 
 
 
1017 aa  246  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.76 
 
 
1505 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  23.93 
 
 
1414 aa  240  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3424  GGDEF domain-containing protein  26.11 
 
 
1502 aa  238  4e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01690  histidine kinase-response regulator hybrid protein  22.63 
 
 
1191 aa  238  5.0000000000000005e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  24.74 
 
 
1278 aa  232  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3298  sensory box protein  25.23 
 
 
1494 aa  232  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.217559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4600  two component regulator propeller domain protein  24.4 
 
 
1194 aa  225  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  23.31 
 
 
1376 aa  222  3e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  24.64 
 
 
1034 aa  218  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  24.25 
 
 
1084 aa  215  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01692  histidine kinase-response regulator hybrid protein  22.53 
 
 
921 aa  204  9e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.803557  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  22.69 
 
 
1093 aa  201  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1852  histidine kinase  23.38 
 
 
1074 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.496494  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3101  histidine kinase  24.73 
 
 
1037 aa  194  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377571  normal  0.147743 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.02 
 
 
1276 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1523  sensory box histidine kinase  43.28 
 
 
787 aa  187  9e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00153524  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1316  sensory box histidine kinase  43.28 
 
 
787 aa  187  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00351204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3383  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
617 aa  187  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  21.71 
 
 
1004 aa  187  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1685  GGDEF domain-containing protein  24.89 
 
 
987 aa  186  3e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00461565  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0198  sensory box histidine kinase  45.45 
 
 
791 aa  186  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00155091  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2298  histidine kinase  22.28 
 
 
1093 aa  186  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1400  signal transduction histidine kinase, LytS  24.18 
 
 
1051 aa  184  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0286  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 
424 aa  183  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0195  sensory box histidine kinase  45.53 
 
 
791 aa  183  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00184929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>