More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4321 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  31.18 
 
 		 1347 aa  640    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  100 
 
 		 1355 aa  2800    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  31.87 
 
 		 1374 aa  633  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  32.03 
 
 		 1378 aa  623  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  31.09 
 
 		 1306 aa  620  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  30.43 
 
 		 1397 aa  615  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  32.03 
 
 		 1355 aa  609  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  31.31 
 
 		 1370 aa  596  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  29.61 
 
 		 1316 aa  576  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  30.26 
 
 		 1378 aa  570  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  30.02 
 
 		 1363 aa  572  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  28.94 
 
 		 1334 aa  572  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  30.08 
 
 		 1374 aa  571  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  31.18 
 
 		 1388 aa  566  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  30.02 
 
 		 1373 aa  563  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  29.23 
 
 		 1400 aa  563  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  28.88 
 
 		 1366 aa  554  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  28.17 
 
 		 1342 aa  553  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  29.44 
 
 		 1384 aa  540  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  30.06 
 
 		 1418 aa  541  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  30 
 
 		 1340 aa  541  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  28.25 
 
 		 1335 aa  535  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  28.94 
 
 		 1327 aa  535  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  29.23 
 
 		 1373 aa  532  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  29.45 
 
 		 1324 aa  529  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  28.91 
 
 		 1344 aa  528  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  27.78 
 
 		 1347 aa  513  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  28.3 
 
 		 1349 aa  498  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  29.22 
 
 		 1343 aa  490  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  29.33 
 
 		 1278 aa  493  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  28.95 
 
 		 1311 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  29.97 
 
 		 1313 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  29.52 
 
 		 1298 aa  486  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  28.94 
 
 		 1526 aa  482  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  27.69 
 
 		 1404 aa  475  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  27.43 
 
 		 1344 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  29.18 
 
 		 1407 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  26.73 
 
 		 1396 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  26.08 
 
 		 1374 aa  412  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  26.52 
 
 		 1376 aa  405  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  29.77 
 
 		 1105 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  25.46 
 
 		 1414 aa  400  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  29.13 
 
 		 1366 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  28.38 
 
 		 1346 aa  354  8e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.3 
 
 		 1498 aa  354  8e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  37.57 
 
 		 904 aa  347  8e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  26.03 
 
 		 1093 aa  331  6e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  26.18 
 
 		 1086 aa  331  6e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  25.07 
 
 		 1296 aa  330  2.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  25.92 
 
 		 1070 aa  327  1e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 		 934 aa  325  5e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  26.51 
 
 		 1278 aa  309  3e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  26.69 
 
 		 1070 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  26.57 
 
 		 1114 aa  301  8e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  32.33 
 
 		 940 aa  300  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3042  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.6 
 
 		 1181 aa  297  7e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.227036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 1341 aa  296  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 1258 aa  296  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  25.41 
 
 		 1118 aa  293  2e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  27.78 
 
 		 1054 aa  291  4e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  26.53 
 
 		 1185 aa  291  5.0000000000000004e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 		 677 aa  289  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01690  histidine kinase-response regulator hybrid protein  25.18 
 
 		 1191 aa  284  9e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  31.31 
 
 		 961 aa  280  2e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  27.33 
 
 		 1024 aa  278  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.47 
 
 		 1079 aa  278  6e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  23.57 
 
 		 1084 aa  273  1e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  25.29 
 
 		 1351 aa  272  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0605  histidine kinase  24.84 
 
 		 1190 aa  265  4e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0688  histidine kinase/response regulator hybrid protein  24.76 
 
 		 1179 aa  261  9e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.74 
 
 		 1431 aa  260  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1905  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 668 aa  259  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0295515  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  32.85 
 
 		 663 aa  259  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4600  two component regulator propeller domain protein  29.42 
 
 		 1194 aa  254  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  29.52 
 
 		 993 aa  251  6e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 1118 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  24.54 
 
 		 1175 aa  246  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  27.85 
 
 		 1004 aa  244  7.999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  24.44 
 
 		 1063 aa  244  7.999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 1002 aa  241  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 1153 aa  240  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 		 1390 aa  238  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 		 1390 aa  238  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 		 1390 aa  238  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 1383 aa  237  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 1711 aa  236  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 1131 aa  234  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.33 
 
 		 1426 aa  233  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 1010 aa  233  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 1048 aa  232  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00426  putative two-component system sensor kinase/response regulator fusion protein  26.46 
 
 		 1280 aa  231  6e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 1385 aa  228  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 1003 aa  228  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 		 1631 aa  227  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  31.38 
 
 		 1152 aa  226  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 		 1415 aa  226  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 1370 aa  225  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  24.8 
 
 		 1053 aa  225  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  31.41 
 
 		 1202 aa  224  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 1140 aa  223  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>