More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0688 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0605  histidine kinase  98.62 
 
 		 1190 aa  2311    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0688  histidine kinase/response regulator hybrid protein  100 
 
 		 1179 aa  2376    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01690  histidine kinase-response regulator hybrid protein  51.51 
 
 		 1191 aa  1120    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3042  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.42 
 
 		 1181 aa  651    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.227036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  39 
 
 		 1175 aa  677    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  38.29 
 
 		 1185 aa  622  1e-176  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01692  histidine kinase-response regulator hybrid protein  41.75 
 
 		 921 aa  548  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.803557  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  26.45 
 
 		 1407 aa  350  7e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  25.35 
 
 		 1378 aa  320  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.75 
 
 		 1498 aa  317  9e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  22.82 
 
 		 1340 aa  312  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  25.3 
 
 		 1378 aa  311  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  24.07 
 
 		 1374 aa  311  5.9999999999999995e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  23.98 
 
 		 1526 aa  304  8.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  23.67 
 
 		 1366 aa  291  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  24.76 
 
 		 1355 aa  286  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  27.24 
 
 		 1346 aa  286  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  24.23 
 
 		 1351 aa  283  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  24 
 
 		 1370 aa  282  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  23.16 
 
 		 1363 aa  278  5e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  22.46 
 
 		 1342 aa  276  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  25.31 
 
 		 1327 aa  274  8.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  22.05 
 
 		 1373 aa  271  5e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  23.22 
 
 		 1347 aa  269  2e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  21.51 
 
 		 1384 aa  267  8.999999999999999e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  22.58 
 
 		 1374 aa  265  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  24.55 
 
 		 1349 aa  265  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  23.84 
 
 		 1335 aa  262  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  23.89 
 
 		 1093 aa  261  7e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  23.59 
 
 		 1086 aa  256  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  30.5 
 
 		 1343 aa  254  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.9 
 
 		 631 aa  254  9.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 		 896 aa  253  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.11 
 
 		 1199 aa  253  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  20.92 
 
 		 1400 aa  251  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 		 1313 aa  249  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 		 881 aa  249  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 631 aa  247  8e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  36.38 
 
 		 641 aa  247  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.44 
 
 		 764 aa  246  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 		 1611 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  22.19 
 
 		 1334 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  24.39 
 
 		 1404 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.73 
 
 		 1204 aa  246  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  25.8 
 
 		 1105 aa  246  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  36.57 
 
 		 968 aa  245  3.9999999999999997e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.69 
 
 		 780 aa  245  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  22.72 
 
 		 1418 aa  245  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 		 940 aa  244  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 		 846 aa  244  7e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.7 
 
 		 645 aa  244  7e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.31 
 
 		 1550 aa  242  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  37.64 
 
 		 882 aa  241  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 		 1064 aa  241  5.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  21.69 
 
 		 1355 aa  241  6.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.85 
 
 		 947 aa  241  8e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  21.63 
 
 		 1373 aa  241  8e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 		 803 aa  241  8e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  25 
 
 		 1388 aa  239  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  40.21 
 
 		 1001 aa  239  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.04 
 
 		 923 aa  238  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2513  ATP-binding region, ATPase-like  36.3 
 
 		 945 aa  238  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.543755  normal  0.160676 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.6 
 
 		 1791 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 		 957 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  38.33 
 
 		 1287 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 		 1007 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 		 1177 aa  236  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.2 
 
 		 957 aa  236  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 		 1767 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4246  histidine kinase  31.12 
 
 		 1280 aa  236  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.921248  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  23.24 
 
 		 1374 aa  235  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 		 969 aa  234  6e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.9 
 
 		 1165 aa  234  8.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.6 
 
 		 770 aa  234  8.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.19 
 
 		 781 aa  233  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.01 
 
 		 932 aa  233  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  27.25 
 
 		 1344 aa  233  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  22.69 
 
 		 1397 aa  233  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  38.7 
 
 		 923 aa  232  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  39.36 
 
 		 1193 aa  232  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 		 674 aa  231  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  35.05 
 
 		 1763 aa  231  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  36.32 
 
 		 1120 aa  231  6e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0654  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.85 
 
 		 934 aa  231  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.5 
 
 		 1767 aa  230  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.5 
 
 		 1767 aa  230  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 		 882 aa  230  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  29.03 
 
 		 1298 aa  230  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 		 1771 aa  229  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  22.16 
 
 		 1306 aa  229  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  36.41 
 
 		 952 aa  229  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 873 aa  229  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  30.52 
 
 		 1311 aa  228  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.28 
 
 		 864 aa  228  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 		 863 aa  228  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  33.87 
 
 		 736 aa  228  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  36.79 
 
 		 810 aa  228  5.0000000000000005e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2521  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 		 597 aa  228  5.0000000000000005e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.68 
 
 		 846 aa  228  6e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.41 
 
 		 907 aa  228  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>