More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4824 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  100 
 
 		 1024 aa  2111    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  37.16 
 
 		 1114 aa  595  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  32.53 
 
 		 1105 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  33.3 
 
 		 1407 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  31.78 
 
 		 1374 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  27.08 
 
 		 1526 aa  356  1e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  30.56 
 
 		 1397 aa  355  2.9999999999999997e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  30.44 
 
 		 1278 aa  350  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  29.1 
 
 		 1355 aa  349  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  29.19 
 
 		 1070 aa  347  6e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  28.03 
 
 		 1370 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  28.63 
 
 		 1070 aa  344  4e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  27.37 
 
 		 1363 aa  336  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.77 
 
 		 1258 aa  333  7.000000000000001e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  28.24 
 
 		 1306 aa  322  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  27.14 
 
 		 1093 aa  320  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  26.95 
 
 		 1086 aa  318  4e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  26.3 
 
 		 1342 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  26.95 
 
 		 1063 aa  311  5.9999999999999995e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  26.77 
 
 		 1017 aa  310  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  28.37 
 
 		 1054 aa  306  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  27.17 
 
 		 1118 aa  302  2e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.53 
 
 		 1079 aa  300  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  24.53 
 
 		 1316 aa  293  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4600  two component regulator propeller domain protein  27.93 
 
 		 1194 aa  290  7e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  29.24 
 
 		 1378 aa  287  7e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  26.22 
 
 		 1396 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  28.56 
 
 		 1388 aa  286  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  27.13 
 
 		 1335 aa  283  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  25.51 
 
 		 1378 aa  278  5e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  25.89 
 
 		 1347 aa  276  1.0000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  27.66 
 
 		 1004 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  25.67 
 
 		 1053 aa  275  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  26.82 
 
 		 1404 aa  275  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  25.94 
 
 		 1374 aa  273  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  25.52 
 
 		 1327 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  26.48 
 
 		 1418 aa  268  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.23 
 
 		 1498 aa  265  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  24.51 
 
 		 1384 aa  265  4e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  25.08 
 
 		 1334 aa  264  6e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  26.56 
 
 		 1366 aa  264  6.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  24.57 
 
 		 1400 aa  261  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  23.87 
 
 		 1373 aa  260  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  23.45 
 
 		 1373 aa  256  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2298  histidine kinase  23.85 
 
 		 1093 aa  254  8.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  27.48 
 
 		 1278 aa  251  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.67 
 
 		 1276 aa  248  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 		 1030 aa  248  4e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223882  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  26.15 
 
 		 1034 aa  247  6e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  25.95 
 
 		 1355 aa  244  7.999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  26.93 
 
 		 1414 aa  243  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  28.29 
 
 		 1346 aa  243  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  28.3 
 
 		 1343 aa  239  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05925  GGDEF domain protein  23.95 
 
 		 1005 aa  234  4.0000000000000004e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  26.56 
 
 		 1349 aa  233  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2353  signal transduction histidine kinase, LytS  24.27 
 
 		 1021 aa  233  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4026  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  24.55 
 
 		 1508 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.51 
 
 		 1237 aa  228  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  24.43 
 
 		 1374 aa  228  6e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3950  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.17 
 
 		 1508 aa  227  8e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4145  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  24.86 
 
 		 1508 aa  226  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  24.69 
 
 		 1313 aa  225  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  24.91 
 
 		 1340 aa  225  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  25.45 
 
 		 1250 aa  224  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3749  putative signal transduction histidine kinase  24.39 
 
 		 1018 aa  221  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0973084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4052  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  23.9 
 
 		 1508 aa  220  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3424  GGDEF domain-containing protein  24.97 
 
 		 1502 aa  219  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  22.78 
 
 		 1324 aa  218  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4291  histidine kinase  25.71 
 
 		 954 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.608548  normal  0.104271 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0415  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.24 
 
 		 1486 aa  214  7e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0622  histidine kinase  26.02 
 
 		 1013 aa  213  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  23.43 
 
 		 1298 aa  212  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0725  histidine kinase  23.58 
 
 		 1036 aa  213  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3648  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.19 
 
 		 1511 aa  213  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3101  histidine kinase  26.32 
 
 		 1037 aa  211  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377571  normal  0.147743 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0341  sensory box protein  24.33 
 
 		 1515 aa  211  8e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  23.84 
 
 		 1351 aa  209  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  23.81 
 
 		 1093 aa  208  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1617  ATP-binding region ATPase domain protein  24.03 
 
 		 975 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2667  histidine kinase  26.42 
 
 		 1017 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.865327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  23.91 
 
 		 1046 aa  202  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0311  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.77 
 
 		 1504 aa  197  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1685  GGDEF domain-containing protein  23.54 
 
 		 987 aa  196  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00461565  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  24.47 
 
 		 1344 aa  196  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3633  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.77 
 
 		 1504 aa  195  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  24.17 
 
 		 1344 aa  195  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.03 
 
 		 1505 aa  194  8e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  22.42 
 
 		 1347 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  23.08 
 
 		 1084 aa  191  7e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.66 
 
 		 1242 aa  187  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2339  histidine kinase  26.28 
 
 		 1009 aa  186  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 		 1211 aa  185  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3042  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  23.35 
 
 		 1181 aa  184  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.227036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1400  signal transduction histidine kinase, LytS  22.71 
 
 		 1051 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  23.54 
 
 		 1311 aa  179  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  24.75 
 
 		 967 aa  175  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.22 
 
 		 1226 aa  175  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2733  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  24.69 
 
 		 965 aa  171  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  24.28 
 
 		 1075 aa  170  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 		 1453 aa  170  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>